ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Cooperia oncophora mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_004806	ATTAAT	3	368	385	18	50 %	50 %	0 %	5 %	30725255
2	NC_004806	TTTTAT	3	592	609	18	16.67 %	83.33 %	0 %	5 %	30725256
3	NC_004806	GTTT	4	633	648	16	0 %	75 %	25 %	6 %	30725256
4	NC_004806	TTTA	3	966	978	13	25 %	75 %	0 %	7 %	Non-Coding
5	NC_004806	AT	6	1376	1387	12	50 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_004806	ATTG	3	1682	1692	11	25 %	50 %	25 %	9 %	Non-Coding
7	NC_004806	TTG	4	1790	1801	12	0 %	66.67 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
8	NC_004806	TTTA	3	2489	2499	11	25 %	75 %	0 %	9 %	30725257
9	NC_004806	GTTTT	4	2635	2655	21	0 %	80 %	20 %	9 %	30725257
10	NC_004806	ATGT	3	2681	2692	12	25 %	50 %	25 %	8 %	30725258
11	NC_004806	ATATT	3	2709	2722	14	40 %	60 %	0 %	7 %	30725258
12	NC_004806	TTTG	3	2761	2772	12	0 %	75 %	25 %	8 %	30725258
13	NC_004806	TATT	3	3196	3206	11	25 %	75 %	0 %	9 %	30725258
14	NC_004806	TTTA	3	3227	3239	13	25 %	75 %	0 %	7 %	30725258
15	NC_004806	AAATA	3	3553	3567	15	80 %	20 %	0 %	0 %	30725259
16	NC_004806	TA	6	3972	3982	11	50 %	50 %	0 %	9 %	30725259
17	NC_004806	TAA	4	4243	4254	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	30725259
18	NC_004806	TTTG	3	4743	4754	12	0 %	75 %	25 %	8 %	30725260
19	NC_004806	TTG	4	5037	5048	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	30725260
20	NC_004806	GTTT	3	6364	6375	12	0 %	75 %	25 %	8 %	30725261
21	NC_004806	T	15	6510	6524	15	0 %	100 %	0 %	6 %	30725262
22	NC_004806	ATT	5	6519	6533	15	33.33 %	66.67 %	0 %	6 %	30725262
23	NC_004806	ATA	4	6613	6624	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	30725262
24	NC_004806	AAT	4	6636	6647	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	30725262
25	NC_004806	AATT	3	6664	6675	12	50 %	50 %	0 %	8 %	30725262
26	NC_004806	TTATA	3	6862	6877	16	40 %	60 %	0 %	6 %	30725262
27	NC_004806	TTTA	3	6972	6982	11	25 %	75 %	0 %	9 %	30725262
28	NC_004806	TAT	4	7223	7234	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	30725262
29	NC_004806	ATT	4	7502	7513	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	30725262
30	NC_004806	TTA	4	7544	7556	13	33.33 %	66.67 %	0 %	7 %	30725262
31	NC_004806	TAA	5	7600	7614	15	66.67 %	33.33 %	0 %	6 %	30725262
32	NC_004806	TA	6	7752	7763	12	50 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
33	NC_004806	TGTT	3	8342	8353	12	0 %	75 %	25 %	8 %	30725263
34	NC_004806	TTTA	4	8794	8809	16	25 %	75 %	0 %	6 %	30725263
35	NC_004806	TAT	5	9837	9850	14	33.33 %	66.67 %	0 %	7 %	30725264
36	NC_004806	AAAT	3	10362	10372	11	75 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
37	NC_004806	ATAAAA	4	10376	10400	25	83.33 %	16.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
38	NC_004806	ATT	4	10600	10611	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
39	NC_004806	TAA	5	10665	10678	14	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
40	NC_004806	T	15	10869	10883	15	0 %	100 %	0 %	6 %	Non-Coding
41	NC_004806	AATTT	3	10973	10987	15	40 %	60 %	0 %	6 %	Non-Coding
42	NC_004806	TTTAA	3	11136	11149	14	40 %	60 %	0 %	7 %	Non-Coding
43	NC_004806	TAT	4	11312	11322	11	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
44	NC_004806	ATG	4	11565	11575	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	30725265
45	NC_004806	TAAT	3	11591	11602	12	50 %	50 %	0 %	8 %	30725265
46	NC_004806	T	14	11628	11641	14	0 %	100 %	0 %	7 %	30725265
47	NC_004806	ATT	4	11823	11834	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	30725266
48	NC_004806	TTATA	3	11865	11879	15	40 %	60 %	0 %	6 %	30725266
49	NC_004806	GTTT	3	12683	12693	11	0 %	75 %	25 %	9 %	30725266
50	NC_004806	TA	13	13285	13308	24	50 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
51	NC_004806	AT	12	13434	13458	25	50 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Cooperia oncophora mitochondrion