Team
Contact

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Cyanidioschyzon merolae strain 10D chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_004799ATT4124512551133.33 %66.67 %0 %0 %9 %30468048
2NC_004799GAT4290929201233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %30468051
3NC_004799ATG4411941301233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %30468053
4NC_004799GCA5767576891533.33 %0 %33.33 %33.33 %6 %30468058
5NC_004799TAA412278122891266.67 %33.33 %0 %0 %8 %30468063
6NC_004799AAC413509135201266.67 %0 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
7NC_004799TTC41403614047120 %66.67 %0 %33.33 %8 %30468065
8NC_004799TCT42435924370120 %66.67 %0 %33.33 %0 %30468073
9NC_004799CAA427359273701266.67 %0 %0 %33.33 %8 %30468078
10NC_004799AAG430204302151266.67 %0 %33.33 %0 %8 %30468083
11NC_004799TTC43211332124120 %66.67 %0 %33.33 %8 %30468087
12NC_004799ATT432297323081233.33 %66.67 %0 %0 %8 %30468087
13NC_004799TGC43456334574120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %30468092
14NC_004799CTG44368443695120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %30468099
15NC_004799TGG44503445044110 %33.33 %66.67 %0 %9 %30468103
16NC_004799ACT445389454001233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %30468105
17NC_004799AAG446445464561266.67 %0 %33.33 %0 %8 %30468107
18NC_004799AGA546643466581666.67 %0 %33.33 %0 %6 %30468107
19NC_004799GAA448096481081366.67 %0 %33.33 %0 %7 %Non-Coding
20NC_004799AGA448195482071366.67 %0 %33.33 %0 %7 %Non-Coding
21NC_004799AGA449864498761366.67 %0 %33.33 %0 %7 %30468111
22NC_004799AAG450523505341266.67 %0 %33.33 %0 %8 %30468111
23NC_004799AGT451568515801333.33 %33.33 %33.33 %0 %7 %Non-Coding
24NC_004799GAA451633516431166.67 %0 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
25NC_004799TTA452777527881233.33 %66.67 %0 %0 %8 %30468115
26NC_004799TGG45416354174120 %33.33 %66.67 %0 %8 %92087139
27NC_004799AGA455878558891266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
28NC_004799ACC456266562771233.33 %0 %0 %66.67 %8 %30468120
29NC_004799TTG45649456506130 %66.67 %33.33 %0 %7 %30468120
30NC_004799AAC456686566971266.67 %0 %0 %33.33 %8 %30468120
31NC_004799CTT46171061721120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
32NC_004799ATG563624636381533.33 %33.33 %33.33 %0 %6 %30468129
33NC_004799TCC46708467095120 %33.33 %0 %66.67 %8 %Non-Coding
34NC_004799TTG46750867519120 %66.67 %33.33 %0 %8 %30468134
35NC_004799GCA468877688881233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %30468134
36NC_004799ATC471329713391133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %30468137
37NC_004799CAT472438724481133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %30468138
38NC_004799ATG472881728921233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %30468139
39NC_004799GAG473924739351233.33 %0 %66.67 %0 %8 %30468139
40NC_004799ACA476605766161266.67 %0 %0 %33.33 %8 %30468142
41NC_004799AGT476788767991233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %30468142
42NC_004799TGA477359773701233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %30468144
43NC_004799TCT48058180592120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
44NC_004799TTA482837828481233.33 %66.67 %0 %0 %8 %30468151
45NC_004799CAT489415894251133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %30468158
46NC_004799GCA490056900661133.33 %0 %33.33 %33.33 %9 %30468158
47NC_004799ATG493116931271233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %30468165
48NC_004799ATA493445934561266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
49NC_004799TGA495423954341233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %30468171
50NC_004799ACA41005331005431166.67 %0 %0 %33.33 %9 %30468176
51NC_004799GAA41013931014031166.67 %0 %33.33 %0 %9 %30468176
52NC_004799AAG51015681015811466.67 %0 %33.33 %0 %7 %30468176
53NC_004799GTG4107373107384120 %33.33 %66.67 %0 %8 %30468183
54NC_004799TGG4108562108573120 %33.33 %66.67 %0 %8 %30468185
55NC_004799GTA41130611130731333.33 %33.33 %33.33 %0 %7 %30468198
56NC_004799TAA41166181166291266.67 %33.33 %0 %0 %8 %30468205
57NC_004799GCA41194241194351233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %30468210
58NC_004799CTT4120549120560120 %66.67 %0 %33.33 %8 %30468213
59NC_004799CTT4123984123995120 %66.67 %0 %33.33 %8 %30468217
60NC_004799TGG4129505129516120 %33.33 %66.67 %0 %8 %30468229
61NC_004799AAC51391561391701566.67 %0 %0 %33.33 %6 %30468235
62NC_004799ATG41403431403531133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %30468238
63NC_004799CAA41455171455281266.67 %0 %0 %33.33 %8 %30468249