ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Adiantum capillus-veneris chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_004766	ATAAAA	4	81	104	24	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_004766	AGAA	3	171	181	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
3	NC_004766	ACTT	3	2500	2510	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	49574588
4	NC_004766	A	19	2927	2945	19	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	49574588
5	NC_004766	T	19	3156	3174	19	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	49574588
6	NC_004766	AG	7	3281	3294	14	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	49574588
7	NC_004766	TCT	4	6147	6158	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49574588
8	NC_004766	CAAT	3	6527	6538	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	49574588
9	NC_004766	GAAA	3	6857	6867	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	49574588
10	NC_004766	GAAAA	3	6925	6938	14	80 %	0 %	20 %	0 %	7 %	49574588
11	NC_004766	GA	6	7205	7216	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	49574588
12	NC_004766	T	14	7745	7758	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	49574588
13	NC_004766	TA	6	7938	7949	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	49574588
14	NC_004766	ATAG	4	8013	8029	17	50 %	25 %	25 %	0 %	5 %	49574588
15	NC_004766	ATTCA	3	8202	8215	14	40 %	40 %	0 %	20 %	7 %	49574588
16	NC_004766	G	17	8230	8246	17	0 %	0 %	100 %	0 %	5 %	49574588
17	NC_004766	A	18	8820	8837	18	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	49574588
18	NC_004766	G	13	9563	9575	13	0 %	0 %	100 %	0 %	0 %	49574588
19	NC_004766	CT	6	9743	9753	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	49574588
20	NC_004766	CCAATT	3	10103	10120	18	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	5 %	49574588
21	NC_004766	AATTT	3	12009	12022	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	49574588
22	NC_004766	GATAAG	3	12135	12153	19	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	10 %	49574588
23	NC_004766	TAA	4	12483	12493	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	49574588
24	NC_004766	ATTA	3	12510	12522	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	49574588
25	NC_004766	ATTT	3	12795	12805	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	49574588
26	NC_004766	T	12	12909	12920	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	49574588
27	NC_004766	A	13	13279	13291	13	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	49574588
28	NC_004766	C	16	13649	13664	16	0 %	0 %	0 %	100 %	6 %	49574588
29	NC_004766	TTTA	4	13721	13736	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	49574588
30	NC_004766	C	12	14753	14764	12	0 %	0 %	0 %	100 %	8 %	49574588
31	NC_004766	ATA	4	14882	14893	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	49574588
32	NC_004766	AT	7	20065	20078	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	49574588
33	NC_004766	TATTAC	3	20201	20218	18	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	5 %	49574588
34	NC_004766	ATTG	3	20303	20313	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	49574588
35	NC_004766	TC	7	22371	22384	14	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	49574588
36	NC_004766	GGGT	3	23502	23513	12	0 %	25 %	75 %	0 %	8 %	49574588
37	NC_004766	AT	6	23841	23853	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	49574588
38	NC_004766	T	13	25762	25774	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	49574588
39	NC_004766	TC	6	26091	26101	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	49574588
40	NC_004766	TAA	4	26347	26357	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	49574588
41	NC_004766	A	12	26612	26623	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	49574588
42	NC_004766	AAAT	3	26918	26928	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	49574588
43	NC_004766	GTAG	3	26936	26947	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	49574588
44	NC_004766	A	20	27093	27112	20	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	49574588
45	NC_004766	GTAA	3	28283	28294	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	49574588
46	NC_004766	T	16	28353	28368	16	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	49574588
47	NC_004766	CTCC	3	28515	28525	11	0 %	25 %	0 %	75 %	9 %	49574588
48	NC_004766	TATC	3	28600	28611	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	49574588
49	NC_004766	A	17	29048	29064	17	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	49574588
50	NC_004766	AGT	4	29492	29502	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	49574588
51	NC_004766	ATCT	3	30331	30342	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	49574588
52	NC_004766	CT	6	31057	31067	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	49574588
53	NC_004766	AAAGA	3	32346	32360	15	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	49574588
54	NC_004766	AAC	4	34156	34166	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	49574588
55	NC_004766	GTA	4	34231	34241	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	49574588
56	NC_004766	AT	6	34634	34645	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	49574588
57	NC_004766	C	14	34824	34837	14	0 %	0 %	0 %	100 %	7 %	49574588
58	NC_004766	CT	6	34910	34920	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	49574588
59	NC_004766	ATG	4	35350	35361	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	49574588
60	NC_004766	CTATC	3	35382	35395	14	20 %	40 %	0 %	40 %	7 %	49574588
61	NC_004766	TTAT	3	35396	35407	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	49574588
62	NC_004766	GATA	3	35413	35424	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	49574588
63	NC_004766	G	12	35460	35471	12	0 %	0 %	100 %	0 %	0 %	49574588
64	NC_004766	TC	6	35696	35706	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	49574588
65	NC_004766	AGC	4	37684	37695	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	49574588
66	NC_004766	GACT	3	38427	38438	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	49574588
67	NC_004766	G	14	40635	40648	14	0 %	0 %	100 %	0 %	0 %	49574588
68	NC_004766	TAG	4	42521	42533	13	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	49574588
69	NC_004766	CAA	4	43469	43481	13	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	7 %	49574588
70	NC_004766	AGAT	3	45052	45063	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	49574588
71	NC_004766	T	18	47876	47893	18	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	49574588
72	NC_004766	T	12	48938	48949	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	49574588
73	NC_004766	C	12	51386	51397	12	0 %	0 %	0 %	100 %	0 %	49574588
74	NC_004766	GGAC	3	52102	52113	12	25 %	0 %	50 %	25 %	8 %	49574588
75	NC_004766	AAGA	3	53778	53789	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	49574588
76	NC_004766	GA	6	53935	53946	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	49574588
77	NC_004766	AGGG	3	54932	54943	12	25 %	0 %	75 %	0 %	8 %	49574588
78	NC_004766	AAGA	3	56162	56173	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	49574588
79	NC_004766	CAAAT	3	57089	57102	14	60 %	20 %	0 %	20 %	7 %	49574588
80	NC_004766	AATG	3	57810	57821	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	49574588
81	NC_004766	TAAA	3	58414	58424	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	49574588
82	NC_004766	TAAC	3	58819	58829	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	49574588
83	NC_004766	CAC	4	59289	59300	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	8 %	49574588
84	NC_004766	AAT	4	59518	59529	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	49574588
85	NC_004766	GGAA	3	60002	60012	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	49574588
86	NC_004766	TATC	3	60514	60525	12	25 %	50 %	0 %	25 %	0 %	49574588
87	NC_004766	C	16	61706	61721	16	0 %	0 %	0 %	100 %	6 %	49574588
88	NC_004766	T	13	62035	62047	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	49574588
89	NC_004766	AAAT	3	62499	62509	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	49574588
90	NC_004766	TTA	4	62660	62671	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	49574588
91	NC_004766	A	17	63088	63104	17	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	49574588
92	NC_004766	AAAT	3	63405	63417	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	49574588
93	NC_004766	TAT	4	63860	63871	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	49574588
94	NC_004766	A	15	64054	64068	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	49574588
95	NC_004766	ATT	4	64779	64790	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	49574588
96	NC_004766	GAA	4	65933	65944	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	49574588
97	NC_004766	TG	6	66103	66113	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	49574588
98	NC_004766	A	19	66919	66937	19	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	49574588
99	NC_004766	AAAT	3	66952	66963	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	49574588
100	NC_004766	T	14	70419	70432	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	49574588
101	NC_004766	AAAT	3	73287	73297	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	49574588
102	NC_004766	GTAA	3	75529	75539	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	49574588
103	NC_004766	CTTT	3	75825	75836	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	49574588
104	NC_004766	TTCT	3	76145	76157	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	49574588
105	NC_004766	ATAGAT	3	76210	76226	17	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	5 %	49574588
106	NC_004766	AT	6	76898	76909	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	49574588
107	NC_004766	TATT	3	76933	76944	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	49574588
108	NC_004766	T	14	77074	77087	14	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	49574588
109	NC_004766	T	14	77607	77620	14	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	49574588
110	NC_004766	ACTT	3	77685	77695	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	49574588
111	NC_004766	T	13	77821	77833	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	49574588
112	NC_004766	AAT	4	78415	78426	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	49574588
113	NC_004766	TA	6	78929	78939	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	49574588
114	NC_004766	TATC	3	79044	79055	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	49574588
115	NC_004766	TTTC	3	79846	79857	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	49574588
116	NC_004766	AAAT	3	83239	83250	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	49574588
117	NC_004766	TTTCT	3	83473	83486	14	0 %	80 %	0 %	20 %	7 %	49574588
118	NC_004766	TCTT	3	83500	83511	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	49574588
119	NC_004766	T	15	83513	83527	15	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	49574588
120	NC_004766	A	15	84769	84783	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	49574588
121	NC_004766	T	14	85481	85494	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	49574588
122	NC_004766	AG	6	85713	85723	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	49574588
123	NC_004766	TTCC	3	87962	87973	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	49574588
124	NC_004766	T	12	90152	90163	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	49574588
125	NC_004766	T	15	93318	93332	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	49574588
126	NC_004766	C	16	93614	93629	16	0 %	0 %	0 %	100 %	6 %	49574588
127	NC_004766	T	13	93903	93915	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	49574588
128	NC_004766	A	12	94959	94970	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	49574588
129	NC_004766	GGAA	3	95808	95818	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	49574588
130	NC_004766	T	19	96091	96109	19	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	49574588
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ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Adiantum capillus-veneris chloroplast