ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Ciona savignyi mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_004570	T	14	209	222	14	0 %	100 %	0 %	7 %	28436199
2	NC_004570	AATT	3	250	261	12	50 %	50 %	0 %	8 %	28436199
3	NC_004570	TTTAAA	3	1566	1584	19	50 %	50 %	0 %	10 %	Non-Coding
4	NC_004570	AAT	4	1743	1754	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	28436200
5	NC_004570	T	15	2119	2133	15	0 %	100 %	0 %	6 %	28436200
6	NC_004570	TAA	4	2858	2869	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	28436200
7	NC_004570	T	12	2918	2929	12	0 %	100 %	0 %	8 %	28436200
8	NC_004570	TTTA	3	3044	3054	11	25 %	75 %	0 %	9 %	28436200
9	NC_004570	T	13	3287	3299	13	0 %	100 %	0 %	7 %	28436200
10	NC_004570	ATT	4	3622	3633	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
11	NC_004570	ATTA	3	3880	3891	12	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_004570	ATA	4	4134	4145	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
13	NC_004570	T	22	4666	4687	22	0 %	100 %	0 %	9 %	28436201
14	NC_004570	TTTA	3	4721	4733	13	25 %	75 %	0 %	7 %	28436201
15	NC_004570	TTTA	3	4818	4829	12	25 %	75 %	0 %	8 %	28436201
16	NC_004570	AGTTTT	3	4832	4850	19	16.67 %	66.67 %	16.67 %	10 %	28436201
17	NC_004570	T	16	4937	4952	16	0 %	100 %	0 %	6 %	28436201
18	NC_004570	TTAA	3	5352	5363	12	50 %	50 %	0 %	8 %	28436202
19	NC_004570	TAT	5	5520	5534	15	33.33 %	66.67 %	0 %	6 %	28436202
20	NC_004570	TTTA	3	5677	5687	11	25 %	75 %	0 %	9 %	28436202
21	NC_004570	T	15	5845	5859	15	0 %	100 %	0 %	6 %	28436203
22	NC_004570	T	12	6117	6128	12	0 %	100 %	0 %	8 %	28436203
23	NC_004570	TGAT	3	6381	6391	11	25 %	50 %	25 %	9 %	28436203
24	NC_004570	TAT	4	6550	6562	13	33.33 %	66.67 %	0 %	7 %	28436203
25	NC_004570	T	13	6623	6635	13	0 %	100 %	0 %	0 %	28436203
26	NC_004570	TAA	4	6784	6795	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	28436203
27	NC_004570	AT	6	7154	7164	11	50 %	50 %	0 %	9 %	28436204
28	NC_004570	TTG	4	8119	8130	12	0 %	66.67 %	33.33 %	8 %	28436205
29	NC_004570	TTA	4	8542	8552	11	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	28436205
30	NC_004570	T	15	8621	8635	15	0 %	100 %	0 %	6 %	28436205
31	NC_004570	TTTAA	3	8639	8654	16	40 %	60 %	0 %	6 %	28436205
32	NC_004570	ATT	4	8667	8678	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	28436206
33	NC_004570	TAGT	3	9005	9016	12	25 %	50 %	25 %	8 %	28436206
34	NC_004570	ATATTT	3	9210	9227	18	33.33 %	66.67 %	0 %	5 %	28436206
35	NC_004570	TGT	4	9440	9451	12	0 %	66.67 %	33.33 %	8 %	28436206
36	NC_004570	AAAT	3	9795	9805	11	75 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
37	NC_004570	T	13	10617	10629	13	0 %	100 %	0 %	0 %	28436208
38	NC_004570	ATT	4	10809	10820	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	28436208
39	NC_004570	TTTG	3	11098	11109	12	0 %	75 %	25 %	8 %	28436208
40	NC_004570	TTAAT	3	11577	11591	15	40 %	60 %	0 %	6 %	Non-Coding
41	NC_004570	T	12	11878	11889	12	0 %	100 %	0 %	8 %	Non-Coding
42	NC_004570	TTAA	3	12243	12253	11	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
43	NC_004570	TA	6	12281	12291	11	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
44	NC_004570	T	12	13122	13133	12	0 %	100 %	0 %	8 %	28436210
45	NC_004570	ATT	4	13264	13275	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	28436210
46	NC_004570	T	14	13875	13888	14	0 %	100 %	0 %	7 %	28436210
47	NC_004570	AAT	4	14114	14125	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	28436210

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Ciona savignyi mitochondrion