ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Atropa belladonna chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_004561	AT	6	193	203	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_004561	AAAG	4	395	410	16	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
3	NC_004561	AAGT	3	1193	1203	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	28261697
4	NC_004561	TTA	4	1991	2002	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
5	NC_004561	CATT	3	4100	4111	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
6	NC_004561	GAA	4	4397	4408	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_004561	GAAA	3	4443	4453	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
8	NC_004561	A	15	4583	4597	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
9	NC_004561	AATA	3	4616	4626	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
10	NC_004561	TTTC	3	4803	4813	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
11	NC_004561	AATA	3	5962	5973	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	28261699
12	NC_004561	AT	6	6342	6352	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
13	NC_004561	TA	12	6370	6393	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
14	NC_004561	AAT	4	6394	6405	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
15	NC_004561	AAAT	3	6670	6681	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
16	NC_004561	T	12	6702	6713	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
17	NC_004561	AT	6	7347	7358	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
18	NC_004561	GTTT	3	7470	7482	13	0 %	75 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
19	NC_004561	GTTT	3	7690	7700	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
20	NC_004561	TTCT	3	7912	7922	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	28261700
21	NC_004561	CAAG	3	8996	9006	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
22	NC_004561	T	16	9019	9034	16	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
23	NC_004561	CCTAT	3	9204	9218	15	20 %	40 %	0 %	40 %	6 %	Non-Coding
24	NC_004561	AAAG	3	9615	9625	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
25	NC_004561	AATT	3	12475	12486	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	28261703
26	NC_004561	ATGA	3	12516	12528	13	50 %	25 %	25 %	0 %	7 %	28261703
27	NC_004561	AAAT	3	12614	12624	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	28261703
28	NC_004561	AAAT	3	13346	13357	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
29	NC_004561	ATTCA	3	14179	14192	14	40 %	40 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
30	NC_004561	TAAT	3	14611	14621	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
31	NC_004561	TTTAA	3	14673	14687	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
32	NC_004561	TATT	3	15983	15995	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
33	NC_004561	AAAC	3	18779	18789	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	126165890
34	NC_004561	T	12	18963	18974	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	126165890
35	NC_004561	GAAT	3	19367	19377	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	126165890
36	NC_004561	ATT	4	24049	24061	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
37	NC_004561	CCTA	3	24933	24943	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	28261709
38	NC_004561	TTCA	3	27316	27326	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
39	NC_004561	ATTAG	3	27331	27344	14	40 %	40 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
40	NC_004561	AG	7	27805	27817	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
41	NC_004561	CTAT	3	30380	30391	12	25 %	50 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_004561	TTAA	3	30509	30519	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	28261711
43	NC_004561	TTTA	3	30881	30892	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_004561	TTCT	3	30910	30921	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
45	NC_004561	TTCT	3	32616	32626	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
46	NC_004561	AAAG	3	32766	32777	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
47	NC_004561	ATT	4	32839	32849	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
48	NC_004561	TGAA	3	33234	33244	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
49	NC_004561	TATT	3	33760	33771	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_004561	TTC	4	36536	36547	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28261713
51	NC_004561	AG	6	36891	36901	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
52	NC_004561	TA	6	37097	37108	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
53	NC_004561	TAAA	4	37130	37144	15	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
54	NC_004561	TC	6	37507	37517	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	28261714
55	NC_004561	TA	7	37749	37761	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
56	NC_004561	AATT	5	38038	38057	20	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
57	NC_004561	ATTG	3	39973	39983	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	28261716
58	NC_004561	AATG	3	41619	41630	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	28261717
59	NC_004561	TG	6	42061	42071	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	28261717
60	NC_004561	TTTA	3	43374	43385	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
61	NC_004561	TA	7	43651	43666	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
62	NC_004561	TAA	4	43695	43706	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
63	NC_004561	AACA	3	43934	43945	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
64	NC_004561	T	16	44903	44918	16	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	28261718
65	NC_004561	TAG	4	45648	45658	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	28261718
66	NC_004561	GTA	4	46239	46249	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
67	NC_004561	CTTTGA	3	46664	46680	17	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
68	NC_004561	CTTATT	3	47820	47838	19	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
69	NC_004561	TTTTA	4	47878	47897	20	20 %	80 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
70	NC_004561	TA	6	48022	48032	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
71	NC_004561	AT	7	48532	48544	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
72	NC_004561	ACAT	3	49224	49235	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
73	NC_004561	AT	6	49663	49673	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
74	NC_004561	TTCTC	3	52569	52582	14	0 %	60 %	0 %	40 %	7 %	Non-Coding
75	NC_004561	TAT	5	52813	52826	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
76	NC_004561	TTA	4	53452	53463	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_004561	CAA	4	54110	54121	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
78	NC_004561	ATA	4	56432	56445	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	28261724
79	NC_004561	TTTATT	3	56747	56765	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
80	NC_004561	TTAGG	3	56977	56990	14	20 %	40 %	40 %	0 %	7 %	Non-Coding
81	NC_004561	TTG	4	57202	57212	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
82	NC_004561	TTA	5	59116	59129	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
83	NC_004561	TAT	5	59288	59301	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
84	NC_004561	TAA	4	59305	59315	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
85	NC_004561	AAAG	3	61413	61424	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
86	NC_004561	ATTT	4	61483	61498	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
87	NC_004561	TAA	4	61623	61635	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
88	NC_004561	AT	6	64602	64612	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	28261730
89	NC_004561	A	25	66115	66139	25	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
90	NC_004561	CAAA	3	66545	66556	12	75 %	0 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_004561	TCAAT	3	66599	66612	14	40 %	40 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
92	NC_004561	GTT	4	67732	67742	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
93	NC_004561	TCT	4	68004	68015	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
94	NC_004561	TTAAA	3	68065	68080	16	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
95	NC_004561	AAAT	3	69564	69575	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
96	NC_004561	CTTTA	3	70244	70259	16	20 %	60 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
97	NC_004561	GAAA	3	70570	70581	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	28261738
98	NC_004561	TA	6	70638	70648	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
99	NC_004561	AAAT	3	70663	70674	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
100	NC_004561	AAAC	3	70758	70769	12	75 %	0 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_004561	TGAA	3	71668	71679	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
102	NC_004561	T	13	71829	71841	13	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_004561	T	13	73294	73306	13	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	28261764
104	NC_004561	A	13	73458	73470	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	28261764
105	NC_004561	T	15	74052	74066	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	28261764
106	NC_004561	ATA	4	74510	74521	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	28261764
107	NC_004561	GGTT	3	76193	76204	12	0 %	50 %	50 %	0 %	8 %	28261764
108	NC_004561	TCT	4	76564	76575	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	28261764
109	NC_004561	ATAA	3	76842	76852	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	28261764
110	NC_004561	AT	6	79151	79161	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	28261764
111	NC_004561	AGA	4	79618	79628	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	28261764
112	NC_004561	TA	6	79870	79880	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	28261764
113	NC_004561	AT	7	80623	80635	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	28261764
114	NC_004561	TTTA	3	83304	83315	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	28261764
115	NC_004561	A	18	83825	83842	18	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	28261764
116	NC_004561	AT	6	84457	84468	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	28261764
117	NC_004561	ACTT	3	84838	84848	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	28261764
118	NC_004561	TC	6	85074	85085	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	28261764
119	NC_004561	T	12	85107	85118	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	28261764
120	NC_004561	TA	6	85195	85205	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	28261764
121	NC_004561	TTA	4	86641	86652	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	28261764
122	NC_004561	T	18	86942	86959	18	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	28261764
123	NC_004561	CTT	4	87054	87065	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	28261764
124	NC_004561	GAT	4	87519	87529	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	28261764
125	NC_004561	GAT	4	88893	88903	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	28261764
126	NC_004561	AATA	3	94533	94545	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	28261764
127	NC_004561	TTTCG	3	99719	99732	14	0 %	60 %	20 %	20 %	7 %	28261764
128	NC_004561	TTC	4	101508	101519	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	28261741
129	NC_004561	ATTAGT	6	102073	102107	35	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	8 %	28261741
130	NC_004561	ATCC	3	105164	105175	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	28261741
131	NC_004561	AAGG	3	105466	105476	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	28261741
132	NC_004561	GAGG	3	108062	108073	12	25 %	0 %	75 %	0 %	8 %	28261741
133	NC_004561	AGGT	3	108274	108285	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	28261741
134	NC_004561	AAGG	3	108966	108977	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	28261741
135	NC_004561	TAAG	3	109396	109406	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	28261741
136	NC_004561	A	17	110064	110080	17	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	28261741
137	NC_004561	GGAA	3	111486	111496	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	28261741
138	NC_004561	ATCCTT	3	112193	112210	18	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	5 %	28261741
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148	NC_004561	A	12	115601	115612	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	28261741
149	NC_004561	GAAA	3	118266	118277	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	28261741
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167	NC_004561	GAAGGA	3	131346	131363	18	50 %	0 %	50 %	0 %	5 %	28261741
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169	NC_004561	T	17	133477	133493	17	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	28261741
170	NC_004561	CTTA	3	134151	134161	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	28261741
171	NC_004561	CCTT	3	138081	138091	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	28261741
172	NC_004561	GGAT	3	138382	138393	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	28261741
173	NC_004561	ACTAAT	6	141450	141484	35	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	8 %	28261741
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175	NC_004561	GAA	4	142038	142049	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	28261741
176	NC_004561	CATAC	3	147359	147372	14	40 %	20 %	0 %	40 %	7 %	Non-Coding
177	NC_004561	TATT	3	149012	149024	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	28261781
178	NC_004561	TGAT	3	150014	150026	13	25 %	50 %	25 %	0 %	7 %	28261781
179	NC_004561	GATC	3	150041	150051	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	28261781
180	NC_004561	TGTT	3	151186	151196	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	28261781
181	NC_004561	ATTT	3	152827	152838	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	28261781
182	NC_004561	ATC	4	154654	154664	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
183	NC_004561	ATC	4	156028	156038	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	28261783
184	NC_004561	GAA	5	156491	156505	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	28261783
185	NC_004561	A	18	156600	156617	18	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Atropa belladonna chloroplast