ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Melipona bicolor mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_004529	AAAT	3	291	303	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
2	NC_004529	TA	8	321	336	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
3	NC_004529	TA	6	361	371	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
4	NC_004529	TAA	4	388	400	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
5	NC_004529	TTAAAT	3	1009	1027	19	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	27733917
6	NC_004529	ATT	5	1155	1169	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	27733917
7	NC_004529	ATATTT	3	1247	1264	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	27733917
8	NC_004529	AAT	4	1266	1276	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	27733917
9	NC_004529	ATATT	3	1285	1298	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	27733917
10	NC_004529	TAT	5	1893	1907	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	27733918
11	NC_004529	TAT	4	2187	2197	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	27733918
12	NC_004529	AGG	4	2233	2244	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	27733918
13	NC_004529	TCA	4	3022	3034	13	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	27733918
14	NC_004529	ATAA	3	3095	3105	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	27733918
15	NC_004529	TAT	5	3287	3301	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	27733919
16	NC_004529	AATT	3	3725	3736	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	27733919
17	NC_004529	TAA	4	3881	3892	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
18	NC_004529	TA	7	3899	3911	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
19	NC_004529	TTTAAT	3	4019	4036	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	27733920
20	NC_004529	TAA	4	4122	4133	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	27733920
21	NC_004529	AATTT	3	4182	4196	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	27733921
22	NC_004529	ATT	4	4211	4222	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	27733921
23	NC_004529	A	13	4313	4325	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	27733921
24	NC_004529	CATTAT	3	4437	4454	18	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	5 %	27733921
25	NC_004529	TTTAAT	3	4633	4650	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	27733921
26	NC_004529	TAA	4	4941	4952	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	27733922
27	NC_004529	TAT	4	5292	5302	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	27733922
28	NC_004529	T	12	5394	5405	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	27733922
29	NC_004529	TA	6	5470	5480	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	27733922
30	NC_004529	TA	12	5592	5613	22	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
31	NC_004529	AT	6	5657	5669	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	27733923
32	NC_004529	ATT	4	5848	5859	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	27733923
33	NC_004529	TAATTA	3	5925	5942	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	27733923
34	NC_004529	ATTA	3	5969	5981	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	27733923
35	NC_004529	TTAAA	3	6084	6098	15	60 %	40 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_004529	AT	7	6366	6378	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	27733924
37	NC_004529	T	14	6416	6429	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	27733924
38	NC_004529	A	17	6431	6447	17	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	27733924
39	NC_004529	TA	6	6533	6543	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	27733924
40	NC_004529	AAT	4	6976	6986	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	27733924
41	NC_004529	ATTATA	3	7435	7452	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	27733924
42	NC_004529	AATT	3	7677	7689	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	27733924
43	NC_004529	ATA	5	7694	7708	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	27733924
44	NC_004529	TAAT	3	7825	7836	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	27733924
45	NC_004529	ATTT	3	8107	8117	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	27733925
46	NC_004529	AATA	7	8205	8232	28	75 %	25 %	0 %	0 %	10 %	27733925
47	NC_004529	TAAA	3	8235	8246	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	27733925
48	NC_004529	ATT	4	8484	8494	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	27733925
49	NC_004529	ATT	4	8608	8620	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	27733925
50	NC_004529	TA	6	8656	8666	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	27733925
51	NC_004529	AAT	4	9004	9016	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	27733925
52	NC_004529	AAAAT	3	9036	9050	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	27733925
53	NC_004529	A	14	9247	9260	14	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	27733925
54	NC_004529	TAAA	3	9286	9298	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	27733925
55	NC_004529	AAAT	3	9301	9312	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	27733925
56	NC_004529	AAAAT	3	9318	9331	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	27733925
57	NC_004529	TAAA	3	9354	9365	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	27733925
58	NC_004529	TAA	4	9416	9427	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	27733926
59	NC_004529	AT	6	9487	9499	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	27733926
60	NC_004529	AAAT	3	9508	9518	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	27733926
61	NC_004529	TAAA	3	9551	9561	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	27733926
62	NC_004529	TA	6	9571	9581	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	27733926
63	NC_004529	TA	6	9590	9602	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	27733926
64	NC_004529	ATA	7	9597	9618	22	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	27733926
65	NC_004529	TA	8	9629	9644	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	27733926
66	NC_004529	AT	8	9646	9661	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	27733926
67	NC_004529	AATT	4	9678	9692	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
68	NC_004529	ATT	4	9764	9775	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
69	NC_004529	AT	11	9793	9816	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	27733927
70	NC_004529	ATTTTT	3	9868	9886	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	10 %	27733927
71	NC_004529	TTA	4	9945	9956	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	27733927
72	NC_004529	A	16	10086	10101	16	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	27733927
73	NC_004529	ATTT	10	10111	10149	39	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	27733927
74	NC_004529	TA	6	10156	10166	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	27733927
75	NC_004529	TTAA	3	10220	10230	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	27733927
76	NC_004529	ATT	4	10248	10258	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	27733927
77	NC_004529	ATTT	3	10405	10417	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
78	NC_004529	AATT	3	10865	10875	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	27733928
79	NC_004529	TCATT	3	10896	10910	15	20 %	60 %	0 %	20 %	0 %	27733928
80	NC_004529	ATTT	3	10916	10926	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	27733928
81	NC_004529	ATTTTT	3	11250	11266	17	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	27733928
82	NC_004529	AT	6	11658	11668	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	27733929
83	NC_004529	ATT	4	11705	11716	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	27733929
84	NC_004529	A	13	11773	11785	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	27733929
85	NC_004529	ATAA	3	11836	11847	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	27733929
86	NC_004529	ATA	4	11972	11983	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	27733929
87	NC_004529	ATAA	3	11998	12009	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	27733929
88	NC_004529	AT	6	12183	12193	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	27733929
89	NC_004529	TA	6	12199	12211	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	27733929
90	NC_004529	TTA	4	12495	12507	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	27733929
91	NC_004529	TAATT	4	12508	12526	19	40 %	60 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
92	NC_004529	TATT	3	12568	12579	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_004529	TTAA	3	12712	12722	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
94	NC_004529	TAAATT	3	12916	12933	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
95	NC_004529	TA	6	13234	13246	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
96	NC_004529	AT	12	13269	13290	22	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
97	NC_004529	T	13	13332	13344	13	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_004529	TA	11	13350	13370	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
99	NC_004529	AAAT	3	13398	13409	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_004529	AAT	4	13464	13474	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
101	NC_004529	ATT	4	13654	13664	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
102	NC_004529	TA	6	13665	13676	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
103	NC_004529	AT	12	13866	13889	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
104	NC_004529	AAAT	3	13892	13903	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Melipona bicolor mitochondrion