ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Thrips imaginis mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_004371	A	14	32	45	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	25057394
2	NC_004371	A	15	51	65	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	25057394
3	NC_004371	TAA	4	597	608	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	25057394
4	NC_004371	AATA	3	1472	1482	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	25057394
5	NC_004371	A	17	1627	1643	17	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	25057394
6	NC_004371	A	13	1650	1662	13	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	25057394
7	NC_004371	AAAAAG	3	1880	1898	19	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	10 %	25057395
8	NC_004371	A	17	2734	2750	17	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	25057395
9	NC_004371	AAT	4	2916	2926	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	25057395
10	NC_004371	A	16	2986	3001	16	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	25057395
11	NC_004371	A	12	3201	3212	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	25057396
12	NC_004371	A	13	3314	3326	13	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	25057396
13	NC_004371	TAA	5	3477	3491	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	25057397
14	NC_004371	ATTT	3	3613	3623	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	25057397
15	NC_004371	TAAA	3	3700	3712	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	25057397
16	NC_004371	TTTC	3	3742	3752	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	25057397
17	NC_004371	T	14	3950	3963	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
18	NC_004371	TTAA	3	4077	4088	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
19	NC_004371	AAGA	3	4221	4231	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
20	NC_004371	AAAT	3	4239	4249	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
21	NC_004371	TAAT	3	4356	4367	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
22	NC_004371	AAAAAT	3	4467	4485	19	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
23	NC_004371	AAAAAG	3	4872	4890	19	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
24	NC_004371	ATTA	3	4990	5001	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_004371	GGA	4	5846	5856	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	25057390
26	NC_004371	ATTT	3	6572	6584	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	25057390
27	NC_004371	ATT	4	6718	6729	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	25057390
28	NC_004371	ATT	4	7009	7019	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	25057391
29	NC_004371	ATT	4	7240	7251	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	25057392
30	NC_004371	ATG	4	8102	8113	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	25057393
31	NC_004371	T	13	8214	8226	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	25057393
32	NC_004371	T	22	9330	9351	22	0 %	100 %	0 %	0 %	4 %	Non-Coding
33	NC_004371	TA	9	9388	9405	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
34	NC_004371	ATT	4	10364	10375	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	25057398
35	NC_004371	TTAA	3	10608	10620	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	25057398
36	NC_004371	AAAT	3	10852	10862	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	25057399
37	NC_004371	AAT	4	10907	10918	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	25057399
38	NC_004371	AGAATA	3	10944	10961	18	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	5 %	25057399
39	NC_004371	AAT	4	11120	11131	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	25057399
40	NC_004371	ATTT	3	12108	12118	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	25057400
41	NC_004371	TAAA	3	13108	13119	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
42	NC_004371	TTAAA	3	13225	13240	16	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
43	NC_004371	CAAA	3	13845	13855	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	25057401
44	NC_004371	ATTATA	3	14426	14443	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	25057402
45	NC_004371	AATT	3	14671	14682	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
46	NC_004371	T	20	15263	15282	20	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
47	NC_004371	TA	8	15319	15334	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Thrips imaginis mitochondrion