ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Cryptococcus neoformans var. grubii mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_004336	ATA	8	28	50	23	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_004336	ATA	4	66	76	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
3	NC_004336	AT	6	158	168	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
4	NC_004336	AT	6	2777	2787	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
5	NC_004336	TAT	4	2957	2967	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
6	NC_004336	ATA	5	3054	3069	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
7	NC_004336	AATC	3	3895	3905	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	29090897
8	NC_004336	TA	6	4029	4039	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
9	NC_004336	ACT	5	6885	6899	15	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	6 %	24080115
10	NC_004336	TAC	4	8201	8212	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	24080115
11	NC_004336	AAT	4	8362	8372	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
12	NC_004336	TAAA	4	8542	8557	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
13	NC_004336	TGCTAT	4	8759	8781	23	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	8 %	24080118
14	NC_004336	TAAT	3	9207	9217	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
15	NC_004336	TAT	4	9561	9573	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
16	NC_004336	A	13	9650	9662	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
17	NC_004336	ATT	4	10056	10067	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
18	NC_004336	TA	6	10150	10160	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
19	NC_004336	TTA	5	10212	10226	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
20	NC_004336	TA	6	10222	10232	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
21	NC_004336	TAA	9	10336	10361	26	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
22	NC_004336	TA	6	10369	10380	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
23	NC_004336	TA	6	10410	10421	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
24	NC_004336	TTC	4	12192	12204	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	29090897
25	NC_004336	ATTATA	4	13086	13108	23	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
26	NC_004336	TA	9	13116	13133	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
27	NC_004336	TGG	4	13843	13854	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	24080113
28	NC_004336	ATA	4	14758	14769	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	24080113
29	NC_004336	AT	7	14818	14830	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
30	NC_004336	ATA	4	15046	15056	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
31	NC_004336	TAT	4	15488	15499	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	24080116
32	NC_004336	TTAA	4	17398	17413	16	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_004336	ATA	4	17555	17565	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
34	NC_004336	ATA	5	18350	18364	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	24080114
35	NC_004336	TA	7	18392	18405	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
36	NC_004336	GCA	4	19515	19526	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	24080120
37	NC_004336	CTA	4	19633	19643	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	24080120
38	NC_004336	TTA	4	19679	19690	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	24080120
39	NC_004336	TTC	4	21020	21031	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	29090897
40	NC_004336	ATT	4	23069	23080	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
41	NC_004336	TA	6	23524	23537	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
42	NC_004336	TAAA	7	23563	23591	29	75 %	25 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
43	NC_004336	ACAGTA	3	24062	24079	18	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	21299590
44	NC_004336	ATATTA	4	24595	24617	23	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
45	NC_004336	TAT	4	24789	24800	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Cryptococcus neoformans var. grubii mitochondrion