ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Schizosaccharomyces octosporus mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_004312	TAG	4	654	665	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_004312	TAT	4	3803	3813	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
3	NC_004312	TTA	4	4520	4531	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
4	NC_004312	TAA	4	4796	4806	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
5	NC_004312	ATA	5	7479	7494	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
6	NC_004312	TAT	5	7726	7739	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
7	NC_004312	TTA	4	8477	8488	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
8	NC_004312	TAA	4	9063	9073	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
9	NC_004312	CTT	4	10961	10973	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	23505432
10	NC_004312	TAG	4	11573	11584	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	23505432
11	NC_004312	TAT	5	11606	11620	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	23505432
12	NC_004312	TAA	4	13662	13675	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
13	NC_004312	ATT	7	13923	13944	22	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
14	NC_004312	ATT	4	14355	14366	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	23505433
15	NC_004312	ATA	4	15020	15031	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
16	NC_004312	GTG	4	16045	16056	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	23505435
17	NC_004312	TAT	4	17442	17454	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
18	NC_004312	ATA	5	17631	17644	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
19	NC_004312	TTA	4	18024	18035	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
20	NC_004312	TTA	4	18131	18141	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
21	NC_004312	TAA	4	18166	18177	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
22	NC_004312	ATT	4	20672	20682	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	23505436
23	NC_004312	ATA	5	21430	21444	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	23505436
24	NC_004312	TAT	5	22585	22598	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	23505436
25	NC_004312	ATA	4	23892	23905	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
26	NC_004312	TAT	5	24099	24113	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
27	NC_004312	CTT	4	24233	24244	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
28	NC_004312	TTA	4	24342	24352	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
29	NC_004312	ATT	4	24388	24400	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
30	NC_004312	CAG	4	25920	25931	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
31	NC_004312	ATT	4	27128	27138	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
32	NC_004312	GGT	4	29584	29595	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	23505438
33	NC_004312	ATT	4	33208	33220	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	23505438
34	NC_004312	TAA	4	34933	34944	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	23505438
35	NC_004312	GTA	4	35030	35041	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	23505438
36	NC_004312	TTA	4	36829	36841	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
37	NC_004312	TAT	4	38386	38397	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
38	NC_004312	TAA	4	38890	38901	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
39	NC_004312	AAT	4	40673	40685	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
40	NC_004312	TAT	4	40792	40803	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
41	NC_004312	ATA	4	42000	42011	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	23505444
42	NC_004312	ATT	4	43509	43521	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Schizosaccharomyces octosporus mitochondrion