ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Hexa-nucleotide Imperfect Repeats of Monosiga brevicollis mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_004309	TAAAAA	3	3153	3171	19	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
2	NC_004309	AAAAAT	3	4312	4328	17	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
3	NC_004309	AAAAAT	5	4377	4404	28	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
4	NC_004309	ATTTTT	4	5754	5777	24	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	8 %	23464596
5	NC_004309	ATTTTT	3	6346	6363	18	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
6	NC_004309	TAAAAA	3	8607	8625	19	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
7	NC_004309	TAAAAA	3	8855	8873	19	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
8	NC_004309	AAATTA	3	9055	9072	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
9	NC_004309	AAATTA	3	9135	9152	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
10	NC_004309	AAATTA	3	9252	9269	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
11	NC_004309	TTTATT	4	9955	9978	24	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
12	NC_004309	AATATA	5	10426	10455	30	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
13	NC_004309	AATAAA	3	15953	15971	19	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
14	NC_004309	ATAAAA	8	16061	16110	50	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	8 %	23464602
15	NC_004309	AAATAA	6	16862	16898	37	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
16	NC_004309	ATTTAT	3	18593	18611	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
17	NC_004309	TTAATT	3	18750	18767	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
18	NC_004309	TAAAAT	3	24828	24844	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
19	NC_004309	TAAAAT	3	24924	24940	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
20	NC_004309	AAAATA	3	25909	25927	19	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	23464606
21	NC_004309	ATTATA	3	27367	27384	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
22	NC_004309	AAATAA	5	27864	27895	32	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
23	NC_004309	AAATAA	3	28112	28130	19	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
24	NC_004309	TTAAAA	3	28351	28369	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
25	NC_004309	ATAAAA	4	29894	29918	25	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
26	NC_004309	AAAAAT	5	30419	30447	29	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
27	NC_004309	AAATAA	4	31533	31557	25	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	8 %	23464609
28	NC_004309	TATAAT	3	32074	32090	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
29	NC_004309	AAATAA	3	33549	33567	19	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
30	NC_004309	AAATAA	3	33792	33810	19	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
31	NC_004309	AAATAA	4	36269	36292	24	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	4 %	Non-Coding
32	NC_004309	AATAAA	4	37137	37159	23	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	4 %	Non-Coding
33	NC_004309	AAATTA	3	42524	42541	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
34	NC_004309	AAATTA	4	43419	43443	25	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
35	NC_004309	TAAAAA	3	46644	46661	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	23464616
36	NC_004309	AAATAA	4	53621	53645	25	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
37	NC_004309	TAGCAT	3	53951	53968	18	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	5 %	23464620
38	NC_004309	ATTTTT	3	57105	57122	18	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
39	NC_004309	TTAAAT	3	60478	60496	19	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
40	NC_004309	AAAATA	5	60614	60644	31	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
41	NC_004309	TATATT	4	60816	60838	23	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
42	NC_004309	ATATTA	3	62535	62552	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
43	NC_004309	ATAAAA	4	62690	62714	25	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	4 %	Non-Coding
44	NC_004309	ATAAAA	3	62729	62746	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
45	NC_004309	AAAAAT	3	64075	64093	19	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
46	NC_004309	TAAATA	4	64362	64385	24	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
47	NC_004309	AAATAA	4	65318	65341	24	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
48	NC_004309	AAAATT	3	65355	65373	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
49	NC_004309	AAATAA	4	65469	65492	24	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
50	NC_004309	AAAATT	3	65506	65524	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
51	NC_004309	ATAAAA	3	67287	67304	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
52	NC_004309	AAAATA	3	67299	67316	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
53	NC_004309	TAATTT	3	67734	67751	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_004309	AAAATA	13	68086	68163	78	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
55	NC_004309	AAATTA	3	69174	69192	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
56	NC_004309	AAATAC	3	70227	70244	18	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	5 %	23464627
57	NC_004309	CTTTAA	4	70772	70795	24	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	8 %	23464627
58	NC_004309	AAATAA	3	72084	72102	19	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
59	NC_004309	TATTTA	3	73861	73879	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
60	NC_004309	TTTTAT	3	74760	74778	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
61	NC_004309	AATTTT	3	74779	74797	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
62	NC_004309	TTTTAT	3	74804	74822	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
63	NC_004309	AATTTT	3	74823	74841	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
64	NC_004309	ATTTTT	3	74846	74864	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Hexa-nucleotide Imperfect Repeats of Monosiga brevicollis mitochondrion