ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Penta-nucleotide Imperfect Repeats of Monosiga brevicollis mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_004309	AATAT	3	660	674	15	60 %	40 %	0 %	6 %	Non-Coding
2	NC_004309	ATTTT	3	874	888	15	20 %	80 %	0 %	6 %	Non-Coding
3	NC_004309	TATAT	3	952	965	14	40 %	60 %	0 %	7 %	Non-Coding
4	NC_004309	ATAAA	6	3118	3148	31	80 %	20 %	0 %	9 %	Non-Coding
5	NC_004309	ATAAA	3	4604	4618	15	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_004309	ATTTT	4	6459	6478	20	20 %	80 %	0 %	10 %	Non-Coding
7	NC_004309	AATAA	4	7380	7398	19	80 %	20 %	0 %	10 %	23464597
8	NC_004309	AATAA	3	7725	7739	15	80 %	20 %	0 %	6 %	23464597
9	NC_004309	AAAAT	4	7970	7988	19	80 %	20 %	0 %	10 %	Non-Coding
10	NC_004309	AAAAT	7	7996	8027	32	80 %	20 %	0 %	9 %	Non-Coding
11	NC_004309	TAAAA	3	9719	9733	15	80 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
12	NC_004309	ATTTT	3	9980	9993	14	20 %	80 %	0 %	7 %	Non-Coding
13	NC_004309	TTAAT	3	10640	10653	14	40 %	60 %	0 %	7 %	23464599
14	NC_004309	AATAA	4	11644	11664	21	80 %	20 %	0 %	9 %	Non-Coding
15	NC_004309	AAATA	3	12648	12661	14	80 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
16	NC_004309	AAAAT	4	13334	13352	19	80 %	20 %	0 %	5 %	Non-Coding
17	NC_004309	ATAAA	3	13427	13441	15	80 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
18	NC_004309	AAAAT	3	13716	13730	15	80 %	20 %	0 %	0 %	23464601
19	NC_004309	TATAA	5	16620	16643	24	60 %	40 %	0 %	8 %	Non-Coding
20	NC_004309	TAAAA	4	16666	16686	21	80 %	20 %	0 %	4 %	Non-Coding
21	NC_004309	TAAAA	4	16787	16807	21	80 %	20 %	0 %	4 %	Non-Coding
22	NC_004309	TAAAA	4	16861	16881	21	80 %	20 %	0 %	4 %	Non-Coding
23	NC_004309	TATTT	4	18960	18979	20	20 %	80 %	0 %	5 %	Non-Coding
24	NC_004309	AAAAT	3	20745	20758	14	80 %	20 %	0 %	7 %	23464604
25	NC_004309	ATAAA	3	23718	23733	16	80 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
26	NC_004309	AATAA	4	23843	23863	21	80 %	20 %	0 %	4 %	Non-Coding
27	NC_004309	AATAT	3	25489	25503	15	60 %	40 %	0 %	6 %	Non-Coding
28	NC_004309	TAAAA	4	27192	27211	20	80 %	20 %	0 %	10 %	Non-Coding
29	NC_004309	AATAA	3	28040	28054	15	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_004309	AATAA	3	28200	28214	15	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_004309	AAAAT	4	28215	28234	20	80 %	20 %	0 %	5 %	Non-Coding
32	NC_004309	AAATA	4	28387	28406	20	80 %	20 %	0 %	5 %	Non-Coding
33	NC_004309	TATAA	3	29273	29287	15	60 %	40 %	0 %	6 %	Non-Coding
34	NC_004309	ATAAT	4	30548	30566	19	60 %	40 %	0 %	10 %	Non-Coding
35	NC_004309	TAAAA	8	30974	31015	42	80 %	20 %	0 %	9 %	Non-Coding
36	NC_004309	ATATA	7	31071	31104	34	60 %	40 %	0 %	8 %	Non-Coding
37	NC_004309	ATAAA	3	31244	31258	15	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_004309	ATAAA	3	31399	31413	15	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_004309	AGAAT	3	33096	33110	15	60 %	20 %	20 %	6 %	Non-Coding
40	NC_004309	AAATA	4	33179	33197	19	80 %	20 %	0 %	10 %	Non-Coding
41	NC_004309	AATAA	4	35283	35302	20	80 %	20 %	0 %	10 %	Non-Coding
42	NC_004309	TAAAA	4	36982	37000	19	80 %	20 %	0 %	10 %	Non-Coding
43	NC_004309	ATATT	4	37763	37783	21	40 %	60 %	0 %	9 %	Non-Coding
44	NC_004309	ATATT	4	37872	37892	21	40 %	60 %	0 %	9 %	Non-Coding
45	NC_004309	TAATA	3	42113	42127	15	60 %	40 %	0 %	6 %	Non-Coding
46	NC_004309	AAATT	3	42128	42142	15	60 %	40 %	0 %	6 %	Non-Coding
47	NC_004309	AAATT	8	42484	42523	40	60 %	40 %	0 %	10 %	Non-Coding
48	NC_004309	AATAA	3	42554	42568	15	80 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
49	NC_004309	AATAA	4	42791	42811	21	80 %	20 %	0 %	4 %	Non-Coding
50	NC_004309	AAAAT	3	42835	42848	14	80 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
51	NC_004309	AAAAT	5	42876	42898	23	80 %	20 %	0 %	8 %	Non-Coding
52	NC_004309	AATTA	3	45148	45161	14	60 %	40 %	0 %	7 %	23464616
53	NC_004309	AAAAT	4	46676	46694	19	80 %	20 %	0 %	10 %	23464616
54	NC_004309	AATAA	3	46830	46844	15	80 %	20 %	0 %	0 %	23464616
55	NC_004309	AAAAT	4	47552	47570	19	80 %	20 %	0 %	10 %	23464616
56	NC_004309	AAAAT	4	48840	48858	19	80 %	20 %	0 %	10 %	23464616
57	NC_004309	AAAAT	4	48865	48883	19	80 %	20 %	0 %	10 %	23464616
58	NC_004309	ATATT	4	48941	48960	20	40 %	60 %	0 %	5 %	23464616
59	NC_004309	ATTAA	3	50519	50532	14	60 %	40 %	0 %	7 %	23464616
60	NC_004309	TTAAT	21	51589	51683	95	40 %	60 %	0 %	10 %	Non-Coding
61	NC_004309	AATAA	3	52394	52408	15	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_004309	TAAAA	3	52473	52487	15	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_004309	ATAAA	3	53154	53167	14	80 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
64	NC_004309	AATAA	3	53684	53698	15	80 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
65	NC_004309	TATAT	3	54431	54445	15	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_004309	AAATA	3	55478	55491	14	80 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
67	NC_004309	TTTAT	4	59641	59659	19	20 %	80 %	0 %	5 %	Non-Coding
68	NC_004309	ATTTT	3	60945	60959	15	20 %	80 %	0 %	6 %	Non-Coding
69	NC_004309	AATTA	3	60977	60990	14	60 %	40 %	0 %	7 %	Non-Coding
70	NC_004309	AAAAT	6	61234	61263	30	80 %	20 %	0 %	10 %	23464622
71	NC_004309	AAAAT	3	62553	62567	15	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_004309	AAAAT	4	63779	63797	19	80 %	20 %	0 %	10 %	Non-Coding
73	NC_004309	AAAAT	3	63850	63864	15	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_004309	AAATA	3	64332	64346	15	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_004309	AAAAT	5	65731	65753	23	80 %	20 %	0 %	8 %	Non-Coding
76	NC_004309	TTAAA	4	66351	66370	20	60 %	40 %	0 %	10 %	23464625
77	NC_004309	TAAAT	14	67058	67126	69	60 %	40 %	0 %	10 %	Non-Coding
78	NC_004309	AAAAT	3	67198	67212	15	80 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
79	NC_004309	ATATT	3	71518	71532	15	40 %	60 %	0 %	6 %	Non-Coding
80	NC_004309	AAAAT	3	72781	72795	15	80 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
81	NC_004309	AATAA	5	72834	72858	25	80 %	20 %	0 %	8 %	Non-Coding
82	NC_004309	ATAAA	3	73463	73477	15	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_004309	TTTAT	3	76116	76129	14	20 %	80 %	0 %	7 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Penta-nucleotide Imperfect Repeats of Monosiga brevicollis mitochondrion