ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tetra-nucleotide Imperfect Repeats of Monosiga brevicollis mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_004309	TTAA	5	1366	1385	20	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
2	NC_004309	AAAT	3	1590	1602	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
3	NC_004309	TTAT	3	2086	2097	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
4	NC_004309	TAAA	6	3706	3730	25	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
5	NC_004309	TAAT	3	6692	6703	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_004309	AATA	3	7146	7157	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_004309	ATTT	3	7280	7291	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
8	NC_004309	TAAA	4	7357	7373	17	75 %	25 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
9	NC_004309	AATT	3	7794	7806	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
10	NC_004309	TAAA	3	7813	7823	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
11	NC_004309	AATT	3	7877	7889	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
12	NC_004309	AAAT	3	8285	8296	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	23464598
13	NC_004309	AATA	3	8462	8472	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	23464598
14	NC_004309	AAAT	3	9496	9507	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_004309	TAAA	3	9641	9651	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
16	NC_004309	ATTT	3	9763	9773	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
17	NC_004309	ATTT	4	9859	9874	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
18	NC_004309	TTAT	4	11531	11546	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
19	NC_004309	TAAA	3	11868	11879	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	23464600
20	NC_004309	AAAT	3	12290	12300	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
21	NC_004309	AGTA	3	13416	13426	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
22	NC_004309	AAAT	3	15982	15993	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
23	NC_004309	AAAT	3	16025	16035	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
24	NC_004309	ATAA	3	16690	16701	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_004309	TAAA	6	16921	16944	24	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
26	NC_004309	AATT	3	17102	17112	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
27	NC_004309	AATT	3	17233	17243	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
28	NC_004309	TTTA	3	18153	18164	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
29	NC_004309	ATTT	3	18241	18252	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
30	NC_004309	TAAT	3	18269	18280	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_004309	TTTA	3	18891	18901	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
32	NC_004309	ATTT	3	19022	19033	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_004309	ATTT	3	19045	19056	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_004309	ATTT	3	19068	19079	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_004309	AAAT	3	19755	19766	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	23464604
36	NC_004309	TTAT	3	20433	20444	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	23464604
37	NC_004309	TTTA	3	21194	21204	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	23464604
38	NC_004309	AAAT	3	21709	21720	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	23464604
39	NC_004309	ATTT	3	21779	21790	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	23464604
40	NC_004309	AATT	5	21967	21986	20	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	23464604
41	NC_004309	AAAT	5	22088	22107	20	75 %	25 %	0 %	0 %	5 %	23464604
42	NC_004309	CTTT	3	22115	22126	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	23464604
43	NC_004309	ATTA	3	22370	22381	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	23464604
44	NC_004309	TAAA	3	23092	23102	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	23464604
45	NC_004309	AATT	3	23690	23700	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
46	NC_004309	TTAA	3	24085	24095	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
47	NC_004309	TTTA	3	24355	24365	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
48	NC_004309	AATA	3	24396	24407	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
49	NC_004309	TTTA	3	24712	24722	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
50	NC_004309	AAAT	3	24861	24872	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
51	NC_004309	ATAA	4	25543	25558	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
52	NC_004309	TTAA	3	26653	26663	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
53	NC_004309	TAAT	3	26773	26783	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
54	NC_004309	TAAT	3	26864	26874	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
55	NC_004309	TAAA	3	27221	27231	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
56	NC_004309	AAAT	4	28291	28305	15	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
57	NC_004309	AAAT	3	28370	28380	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
58	NC_004309	ATTT	4	28871	28886	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
59	NC_004309	TTAA	3	29555	29565	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
60	NC_004309	TAAA	3	29843	29854	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
61	NC_004309	ATTT	3	30283	30294	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_004309	ATTT	3	31218	31229	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
63	NC_004309	TAAA	4	31312	31327	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
64	NC_004309	ATTT	3	31373	31384	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
65	NC_004309	TAAA	8	31473	31503	31	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
66	NC_004309	ATTT	3	32550	32560	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	23464610
67	NC_004309	TAAA	5	34418	34438	21	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
68	NC_004309	AAAT	3	35587	35597	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	23464612
69	NC_004309	TATT	6	36121	36145	25	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
70	NC_004309	TTTA	3	36154	36165	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
71	NC_004309	ATTA	4	36441	36456	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
72	NC_004309	AATT	3	39420	39430	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
73	NC_004309	TTTA	3	40298	40308	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
74	NC_004309	TTTA	3	40412	40422	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
75	NC_004309	TTTA	3	40505	40515	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
76	NC_004309	TTTA	3	40520	40532	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
77	NC_004309	AATT	3	40861	40872	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
78	NC_004309	AATT	3	40875	40886	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
79	NC_004309	AATT	3	40889	40900	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
80	NC_004309	AATT	3	42366	42376	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
81	NC_004309	AATT	3	42456	42466	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
82	NC_004309	AAAT	3	42899	42911	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
83	NC_004309	TAAA	3	42937	42947	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
84	NC_004309	TTAA	3	43126	43137	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
85	NC_004309	TAAA	4	43655	43670	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
86	NC_004309	AAAT	3	44558	44568	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	23464616
87	NC_004309	AAAT	3	44601	44612	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	23464616
88	NC_004309	AAAT	3	45549	45560	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	23464616
89	NC_004309	TAAA	4	46101	46116	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	23464616
90	NC_004309	AATA	3	46795	46806	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	23464616
91	NC_004309	ATAA	5	46848	46868	21	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	23464616
92	NC_004309	TAAA	4	46872	46888	17	75 %	25 %	0 %	0 %	5 %	23464616
93	NC_004309	ATAA	3	48356	48366	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	23464616
94	NC_004309	TTAA	3	48744	48755	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	23464616
95	NC_004309	TTAA	3	50006	50017	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	23464616
96	NC_004309	AAAT	3	51955	51966	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
97	NC_004309	AAAT	3	51979	51990	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
98	NC_004309	ATAA	4	52019	52033	15	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
99	NC_004309	TAAA	3	52172	52182	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
100	NC_004309	TAAA	3	52195	52205	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
101	NC_004309	ATAA	5	52412	52432	21	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
102	NC_004309	AAAT	12	52475	52520	46	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
103	NC_004309	AATA	5	52488	52508	21	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
104	NC_004309	AAAT	3	52634	52644	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
105	NC_004309	ATAA	3	52669	52679	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
106	NC_004309	TATT	3	53184	53195	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_004309	TTAA	3	53756	53767	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
108	NC_004309	CTTA	3	54420	54430	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
109	NC_004309	TAAA	6	54473	54497	25	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
110	NC_004309	AATT	3	54511	54521	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
111	NC_004309	TTTA	3	54877	54889	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
112	NC_004309	AAAT	3	55001	55011	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
113	NC_004309	TTAA	3	55135	55146	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
114	NC_004309	TATT	3	55290	55301	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_004309	AAAT	3	55548	55559	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
116	NC_004309	ATAA	3	55642	55652	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
117	NC_004309	ATTT	3	56515	56525	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	23464621
118	NC_004309	ATTT	5	58025	58046	22	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
119	NC_004309	ATTT	4	58140	58156	17	25 %	75 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
120	NC_004309	AATT	4	58237	58253	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
121	NC_004309	TTAA	3	59443	59454	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
122	NC_004309	TTTA	3	59456	59467	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_004309	TTTA	3	59808	59819	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
124	NC_004309	ATTT	3	60284	60296	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
125	NC_004309	ATTT	3	60368	60380	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
126	NC_004309	TTTA	4	60437	60451	15	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
127	NC_004309	TAAT	3	61191	61202	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
128	NC_004309	TAAA	3	61204	61214	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
129	NC_004309	TAAA	6	62228	62252	25	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
130	NC_004309	ATTT	3	63639	63651	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
131	NC_004309	TTAA	3	64423	64434	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
132	NC_004309	TTAA	3	64538	64549	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
133	NC_004309	AATT	3	64704	64715	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
134	NC_004309	AAAT	3	64788	64798	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
135	NC_004309	ATTT	3	65259	65269	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
136	NC_004309	AAAT	3	66553	66563	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	23464625
137	NC_004309	TTAA	3	67666	67676	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
138	NC_004309	AATA	3	68361	68372	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
139	NC_004309	ATAA	3	69195	69206	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_004309	ATAA	4	69504	69520	17	75 %	25 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
141	NC_004309	GTAT	3	69745	69755	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	23464627
142	NC_004309	TTTA	3	71140	71150	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	23464627
143	NC_004309	ATTA	4	71212	71227	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
144	NC_004309	TTTA	15	71271	71329	59	25 %	75 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
145	NC_004309	TTTA	12	71338	71385	48	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
146	NC_004309	TAAA	5	72106	72126	21	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
147	NC_004309	ATAA	3	73436	73447	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_004309	TAAA	3	74370	74380	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
149	NC_004309	TATT	3	74934	74944	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
150	NC_004309	AAAT	3	75698	75709	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
151	NC_004309	ATTT	3	76054	76064	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
152	NC_004309	ATTT	3	76238	76248	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tetra-nucleotide Imperfect Repeats of Monosiga brevicollis mitochondrion