ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Monosiga brevicollis mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_004309	ATT	4	5667	5679	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	23464596
2	NC_004309	TAT	5	6212	6227	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
3	NC_004309	ATT	4	6533	6544	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
4	NC_004309	ATT	4	6580	6591	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
5	NC_004309	ATT	4	6651	6662	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_004309	ATT	4	6739	6750	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_004309	TAT	5	6860	6874	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
8	NC_004309	ATT	4	6875	6886	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
9	NC_004309	TAT	5	6888	6902	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
10	NC_004309	ATT	4	6903	6914	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
11	NC_004309	TAT	5	6916	6930	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
12	NC_004309	ATT	4	8486	8497	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	23464598
13	NC_004309	ATA	4	8705	8718	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
14	NC_004309	ATA	4	8762	8772	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
15	NC_004309	ATA	4	8919	8932	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
16	NC_004309	ATA	4	8998	9008	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
17	NC_004309	ATA	4	9077	9088	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
18	NC_004309	TAA	4	9180	9190	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
19	NC_004309	TAA	4	9297	9307	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
20	NC_004309	ATA	4	9396	9406	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
21	NC_004309	ATA	4	9628	9639	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
22	NC_004309	ATA	5	10363	10376	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
23	NC_004309	TTA	4	11190	11201	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	23464599
24	NC_004309	ATT	4	11496	11508	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
25	NC_004309	ATT	4	11518	11530	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
26	NC_004309	ATT	4	11561	11573	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
27	NC_004309	TAA	5	12151	12164	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
28	NC_004309	TAA	4	12168	12178	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
29	NC_004309	TAA	4	13278	13288	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
30	NC_004309	TAA	6	13560	13578	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
31	NC_004309	TAA	4	13703	13715	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
32	NC_004309	AGC	4	14164	14174	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	23464601
33	NC_004309	TAT	4	14207	14218	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	23464601
34	NC_004309	TTA	4	14981	14991	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
35	NC_004309	TAT	4	15092	15104	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
36	NC_004309	ATT	4	15119	15130	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
37	NC_004309	TTA	5	15128	15142	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
38	NC_004309	ATA	4	15874	15884	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
39	NC_004309	ATA	5	17139	17153	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
40	NC_004309	TAA	4	17996	18007	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	23464603
41	NC_004309	ATT	5	18104	18118	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	23464603
42	NC_004309	ATT	6	18179	18197	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
43	NC_004309	ATT	4	18916	18927	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
44	NC_004309	ATT	4	19008	19018	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
45	NC_004309	TAT	4	20242	20253	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	23464604
46	NC_004309	ATA	4	20530	20540	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	23464604
47	NC_004309	TAA	4	20558	20569	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	23464604
48	NC_004309	TAA	4	20588	20599	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	23464604
49	NC_004309	ATT	4	22054	22066	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	23464604
50	NC_004309	TAG	4	23506	23516	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
51	NC_004309	TAA	4	24185	24199	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
52	NC_004309	TAA	4	24270	24284	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
53	NC_004309	TAA	4	24309	24323	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
54	NC_004309	TAA	5	24414	24429	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
55	NC_004309	TAA	5	24438	24452	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
56	NC_004309	ACT	4	24544	24554	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
57	NC_004309	AAT	11	24569	24598	30	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
58	NC_004309	AAT	4	25569	25579	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
59	NC_004309	TAG	4	25597	25607	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
60	NC_004309	ATA	5	25740	25753	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
61	NC_004309	TAA	4	25821	25833	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
62	NC_004309	ATA	4	26057	26068	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	23464606
63	NC_004309	ATA	4	26237	26248	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	23464606
64	NC_004309	AAT	4	27744	27756	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
65	NC_004309	TAT	4	29797	29809	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
66	NC_004309	ATT	4	30186	30196	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
67	NC_004309	TAA	4	31799	31810	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	23464609
68	NC_004309	TTA	4	32091	32103	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
69	NC_004309	TTA	4	32128	32140	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
70	NC_004309	ATT	4	32199	32211	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
71	NC_004309	TAT	5	32604	32617	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	23464610
72	NC_004309	TTA	4	32681	32692	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	23464610
73	NC_004309	TTA	4	32956	32967	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	23464610
74	NC_004309	ATA	4	33201	33212	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
75	NC_004309	TAA	5	33224	33238	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_004309	TAT	8	33371	33395	25	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
77	NC_004309	AAT	4	34045	34056	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
78	NC_004309	TAA	4	34233	34247	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
79	NC_004309	TAA	5	34253	34267	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
80	NC_004309	TAA	4	34357	34371	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
81	NC_004309	TAA	5	34377	34391	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
82	NC_004309	ATA	6	34477	34493	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
83	NC_004309	ATA	6	34501	34517	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
84	NC_004309	ATA	6	34525	34541	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
85	NC_004309	TAA	4	34542	34552	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
86	NC_004309	ATA	5	34936	34950	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
87	NC_004309	ATA	4	34960	34970	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
88	NC_004309	ATA	5	35009	35023	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
89	NC_004309	ATA	4	35033	35043	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
90	NC_004309	TAA	4	35086	35097	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
91	NC_004309	TAA	5	35623	35637	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	23464612
92	NC_004309	ATA	4	35772	35782	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	23464612
93	NC_004309	TAA	4	36780	36791	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
94	NC_004309	TAA	4	37002	37013	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
95	NC_004309	TAA	4	37075	37086	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
96	NC_004309	TAA	5	37133	37147	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
97	NC_004309	TAA	4	38161	38171	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	23464614
98	NC_004309	TAT	4	38452	38463	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	23464614
99	NC_004309	ATA	4	38704	38715	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	23464614
100	NC_004309	ATT	4	40193	40205	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
101	NC_004309	ATT	4	41363	41373	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	23464615
102	NC_004309	ATT	4	41956	41967	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
103	NC_004309	ATT	4	42006	42020	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
104	NC_004309	TAA	4	42634	42644	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
105	NC_004309	TAA	5	42912	42927	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
106	NC_004309	ATA	4	43040	43051	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
107	NC_004309	ATA	4	43054	43065	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
108	NC_004309	ATA	4	43068	43079	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
109	NC_004309	TAA	4	43167	43177	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
110	NC_004309	TAA	4	43278	43288	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
111	NC_004309	AGG	4	44106	44117	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	23464616
112	NC_004309	TTA	4	45178	45189	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	23464616
113	NC_004309	TAA	4	45687	45698	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	23464616
114	NC_004309	TAA	4	45703	45714	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	23464616
115	NC_004309	TAA	4	45719	45731	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	23464616
116	NC_004309	TAA	4	45736	45747	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	23464616
117	NC_004309	TAA	4	45752	45766	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	23464616
118	NC_004309	TAA	4	45788	45799	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	23464616
119	NC_004309	TAA	4	45824	45835	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	23464616
120	NC_004309	TAA	4	45840	45851	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	23464616
121	NC_004309	TAA	4	45856	45868	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	23464616
122	NC_004309	TAA	4	45873	45884	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	23464616
123	NC_004309	TAA	5	45892	45906	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	23464616
124	NC_004309	TAA	4	45924	45935	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	23464616
125	NC_004309	TAA	4	45940	45951	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	23464616
126	NC_004309	TAA	4	45956	45967	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	23464616
127	NC_004309	TAA	4	45972	45983	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	23464616
128	NC_004309	TAA	4	45988	45999	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	23464616
129	NC_004309	TAA	4	46015	46026	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	23464616
130	NC_004309	TAA	4	46048	46062	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	23464616
131	NC_004309	TAT	5	46327	46341	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	23464616
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215	NC_004309	ATT	4	76254	76265	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Monosiga brevicollis mitochondrion