ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Chaetosphaeridium globosum mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_004118	TAT	4	426	438	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
2	NC_004118	TAAT	3	4682	4693	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_004118	AAAT	3	5231	5242	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
4	NC_004118	TC	6	6069	6079	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
5	NC_004118	TGT	4	6231	6241	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
6	NC_004118	GTAA	3	6270	6280	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
7	NC_004118	AATA	3	7421	7431	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	22550369
8	NC_004118	TAT	4	9483	9493	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
9	NC_004118	TTAA	3	10152	10164	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
10	NC_004118	GAT	4	13732	13742	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	22550343
11	NC_004118	ATTT	4	14563	14578	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	22550365
12	NC_004118	TAT	4	14702	14713	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	22550365
13	NC_004118	TATT	3	15037	15048	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	22550365
14	NC_004118	TAAG	3	17012	17023	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
15	NC_004118	TAATT	3	18718	18731	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	22550357
16	NC_004118	T	13	20974	20986	13	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	22550349
17	NC_004118	ATTT	3	23127	23137	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	22550346
18	NC_004118	CAA	4	24566	24577	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	22550331
19	NC_004118	ATA	4	25261	25271	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	22550338
20	NC_004118	TA	6	26381	26391	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	22550337
21	NC_004118	CATT	3	26822	26832	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	22550337
22	NC_004118	AT	6	27365	27375	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	22550337
23	NC_004118	AATA	3	29037	29047	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	22550345
24	NC_004118	CAA	4	29342	29352	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	22550345
25	NC_004118	AATA	3	30990	31000	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
26	NC_004118	TCAT	3	31580	31591	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	22550362
27	NC_004118	AAAAT	3	32624	32637	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	22550340
28	NC_004118	AT	6	32809	32820	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	22550340
29	NC_004118	GAA	4	33208	33218	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	22550340
30	NC_004118	ATC	4	35842	35852	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	22550344
31	NC_004118	ATTTT	3	37305	37319	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
32	NC_004118	ACAA	3	38385	38395	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	22550374
33	NC_004118	ATT	4	38515	38525	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	22550347
34	NC_004118	ATAA	3	39062	39073	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
35	NC_004118	CAT	4	39464	39474	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	22550339
36	NC_004118	TAA	4	39586	39597	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	22550339
37	NC_004118	CTGAAG	3	39745	39762	18	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	5 %	22550339
38	NC_004118	CGATAT	3	39993	40009	17	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	5 %	22550339
39	NC_004118	CAA	5	40621	40634	14	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	7 %	22550335
40	NC_004118	AGA	4	42097	42107	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	22550335
41	NC_004118	TTACAA	3	43754	43770	17	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	5 %	22550359
42	NC_004118	T	12	44319	44330	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
43	NC_004118	AAGT	3	44566	44578	13	50 %	25 %	25 %	0 %	7 %	22550352
44	NC_004118	ATT	4	45465	45476	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	22550366
45	NC_004118	TTA	4	48009	48020	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	22550336
46	NC_004118	GGT	4	48093	48104	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	22550336
47	NC_004118	AC	6	49207	49217	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	22550336
48	NC_004118	TAT	4	50022	50034	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	22550336
49	NC_004118	ATT	4	50671	50681	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	22550336
50	NC_004118	CAAA	3	50928	50938	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	22550336
51	NC_004118	ACA	4	52132	52142	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
52	NC_004118	TA	9	52612	52629	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
53	NC_004118	TAGA	3	54353	54363	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
54	NC_004118	GTT	4	54452	54463	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding

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