ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Chaetosphaeridium globosum chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_004115	TTA	4	3681	3692	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	22711991
2	NC_004115	TAT	4	3810	3820	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	22711991
3	NC_004115	AAT	4	3824	3835	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	22711991
4	NC_004115	CTT	4	4367	4377	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	22711991
5	NC_004115	ATA	4	7926	7936	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	22711991
6	NC_004115	CAA	4	8009	8020	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	22711991
7	NC_004115	AAC	4	9174	9185	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	22711991
8	NC_004115	TAT	4	10614	10625	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	22711991
9	NC_004115	TGT	4	11034	11045	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	22711991
10	NC_004115	TAA	5	14642	14656	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	22711991
11	NC_004115	TAA	4	15523	15534	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	22711991
12	NC_004115	ATA	4	17923	17934	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	22711991
13	NC_004115	TTA	4	21625	21638	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	22711991
14	NC_004115	ATA	4	21667	21678	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	22711991
15	NC_004115	TAT	4	22701	22711	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	22711991
16	NC_004115	ATA	4	25509	25519	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	22711991
17	NC_004115	TAT	4	28119	28130	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	22711991
18	NC_004115	AAT	4	28270	28282	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	22711991
19	NC_004115	ATT	4	36059	36069	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	22711991
20	NC_004115	TAA	4	38771	38783	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
21	NC_004115	AAT	4	38880	38891	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
22	NC_004115	TAA	5	39459	39473	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
23	NC_004115	TAT	4	46224	46236	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
24	NC_004115	TAG	4	48641	48652	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	22711896
25	NC_004115	TGC	4	51359	51370	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	22711949
26	NC_004115	ATT	4	53566	53576	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	22711980
27	NC_004115	TAT	4	55381	55391	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	22711902
28	NC_004115	TTA	4	55678	55689	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
29	NC_004115	TTA	5	60071	60085	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
30	NC_004115	GAA	4	60695	60706	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	193735622
31	NC_004115	TAA	4	61481	61492	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	193735622
32	NC_004115	TCT	4	63154	63164	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
33	NC_004115	TCT	4	65421	65431	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	22711934
34	NC_004115	ATT	4	68981	68993	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	22711979
35	NC_004115	AAT	4	71104	71114	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	22711928
36	NC_004115	ACT	4	73703	73713	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	22711929
37	NC_004115	TAA	4	74581	74592	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
38	NC_004115	ATT	4	75697	75708	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	22711908
39	NC_004115	TCT	4	76167	76178	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	22711908
40	NC_004115	ATT	4	76337	76348	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	22711908
41	NC_004115	ATT	4	76553	76564	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	22711908
42	NC_004115	TAA	4	77810	77820	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	22711908
43	NC_004115	TTC	4	79202	79213	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	22711908
44	NC_004115	ATT	4	79952	79963	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	22711908
45	NC_004115	TAT	4	80083	80094	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	22711908
46	NC_004115	ATA	4	80383	80393	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	22711908
47	NC_004115	CTT	5	82311	82325	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	22711959
48	NC_004115	AAC	4	84321	84332	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	22711951
49	NC_004115	TAA	4	84619	84630	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	22711951
50	NC_004115	CCT	4	86830	86840	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	22711952
51	NC_004115	ACC	4	87887	87897	11	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	9 %	22711952
52	NC_004115	TAA	4	88714	88725	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
53	NC_004115	CTT	4	91839	91849	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
54	NC_004115	TAT	4	98923	98934	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	22711905
55	NC_004115	ATA	4	101054	101064	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
56	NC_004115	ATA	4	103718	103728	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	22711954
57	NC_004115	TAT	4	104166	104177	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
58	NC_004115	ACC	4	104320	104331	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
59	NC_004115	TAA	4	107072	107082	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	22711913
60	NC_004115	CTG	4	107966	107976	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	22711914
61	NC_004115	TAA	5	111014	111027	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	22711910
62	NC_004115	TAC	4	113281	113292	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	22711989
63	NC_004115	TAT	4	114297	114307	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
64	NC_004115	CTT	4	114967	114977	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	22711977
65	NC_004115	TAT	4	115111	115121	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	22711977
66	NC_004115	AGA	4	117767	117778	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	22711977
67	NC_004115	TAT	4	118802	118812	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
68	NC_004115	TAA	4	120933	120944	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	22711987

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Chaetosphaeridium globosum chloroplast