ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Chaetosphaeridium globosum chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_004115	GAAA	3	113	125	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
2	NC_004115	AAAT	3	501	513	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	22711983
3	NC_004115	AATT	3	781	793	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	22711983
4	NC_004115	AT	6	806	817	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	22711983
5	NC_004115	AAAT	3	908	919	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	22711983
6	NC_004115	AAAAT	3	1320	1333	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	22711991
7	NC_004115	TTA	4	3681	3692	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	22711991
8	NC_004115	TAT	4	3810	3820	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	22711991
9	NC_004115	AAT	4	3824	3835	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	22711991
10	NC_004115	CTT	4	4367	4377	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	22711991
11	NC_004115	A	16	4517	4532	16	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	22711991
12	NC_004115	ATGAA	3	4712	4725	14	60 %	20 %	20 %	0 %	7 %	22711991
13	NC_004115	AAAT	3	4794	4804	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	22711991
14	NC_004115	AT	6	4826	4837	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	22711991
15	NC_004115	TA	6	4847	4858	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	22711991
16	NC_004115	ATTT	3	4902	4913	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	22711991
17	NC_004115	ATAA	6	4950	4973	24	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	22711991
18	NC_004115	AAAT	3	5804	5816	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	22711991
19	NC_004115	TA	6	6050	6062	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	22711991
20	NC_004115	A	12	6711	6722	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	22711991
21	NC_004115	ATA	4	7926	7936	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	22711991
22	NC_004115	CAA	4	8009	8020	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	22711991
23	NC_004115	AAC	4	9174	9185	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	22711991
24	NC_004115	AGAAAT	3	9282	9299	18	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	5 %	22711991
25	NC_004115	TAAA	3	10260	10271	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	22711991
26	NC_004115	AAAG	3	10601	10612	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	22711991
27	NC_004115	TAT	4	10614	10625	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	22711991
28	NC_004115	TGT	4	11034	11045	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	22711991
29	NC_004115	ATCT	3	11441	11451	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	22711991
30	NC_004115	A	13	11562	11574	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	22711991
31	NC_004115	AT	6	12524	12534	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	22711991
32	NC_004115	AATT	3	13936	13947	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	22711991
33	NC_004115	TAA	5	14642	14656	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	22711991
34	NC_004115	TAA	4	15523	15534	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	22711991
35	NC_004115	T	12	16223	16234	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	22711991
36	NC_004115	ATTT	3	17009	17019	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	22711991
37	NC_004115	TTTATT	3	17377	17394	18	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	22711991
38	NC_004115	ATA	4	17923	17934	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	22711991
39	NC_004115	AT	6	17977	17987	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	22711991
40	NC_004115	TGTT	3	18075	18085	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	22711991
41	NC_004115	AT	7	18452	18465	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	22711991
42	NC_004115	TA	6	18589	18600	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	22711991
43	NC_004115	ATTG	3	19692	19702	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	22711991
44	NC_004115	TTA	4	21625	21638	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	22711991
45	NC_004115	ATA	4	21667	21678	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	22711991
46	NC_004115	A	12	22488	22499	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	22711991
47	NC_004115	AAAT	3	22564	22574	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	22711991
48	NC_004115	AAAT	3	22673	22683	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	22711991
49	NC_004115	TAT	4	22701	22711	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	22711991
50	NC_004115	TA	6	22945	22955	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	22711991
51	NC_004115	AAAT	3	22982	22994	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	22711991
52	NC_004115	ATTTT	3	23158	23172	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	22711991
53	NC_004115	T	15	23341	23355	15	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	22711991
54	NC_004115	ATAAAA	3	23425	23442	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	22711991
55	NC_004115	T	14	23711	23724	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	22711991
56	NC_004115	AT	8	23887	23901	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	22711991
57	NC_004115	AT	11	24124	24144	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	22711991
58	NC_004115	TA	6	24149	24161	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	22711991
59	NC_004115	AATA	4	25338	25354	17	75 %	25 %	0 %	0 %	5 %	22711991
60	NC_004115	TATT	3	25404	25415	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	22711991
61	NC_004115	ATA	4	25509	25519	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	22711991
62	NC_004115	AAAT	3	25949	25960	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	22711991
63	NC_004115	TAT	4	28119	28130	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	22711991
64	NC_004115	AAT	4	28270	28282	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	22711991
65	NC_004115	T	16	28366	28381	16	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	22711991
66	NC_004115	TA	6	28743	28753	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	22711991
67	NC_004115	AATT	3	28816	28827	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	22711991
68	NC_004115	GA	6	29055	29066	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	22711991
69	NC_004115	A	15	29182	29196	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	22711991
70	NC_004115	AT	11	30953	30973	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	22711991
71	NC_004115	TTAG	3	31602	31612	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	22711991
72	NC_004115	ATTT	3	31842	31853	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	22711991
73	NC_004115	TATT	3	32960	32970	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	22711991
74	NC_004115	TAAA	3	33016	33026	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	22711991
75	NC_004115	ATTT	3	33585	33596	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	22711991
76	NC_004115	TAAA	3	35246	35258	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	22711991
77	NC_004115	ATT	4	36059	36069	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	22711991
78	NC_004115	T	15	36147	36161	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	22711991
79	NC_004115	TA	7	36264	36276	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	22711991
80	NC_004115	GAAA	3	36543	36553	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	22711991
81	NC_004115	TCAA	3	36571	36582	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	22711991
82	NC_004115	TTAATG	3	36949	36967	19	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	10 %	22711991
83	NC_004115	AAAT	3	38147	38157	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
84	NC_004115	AAAG	3	38640	38651	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	22711953
85	NC_004115	TAA	4	38771	38783	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
86	NC_004115	AAT	4	38880	38891	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
87	NC_004115	TTAT	3	39173	39184	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	22711958
88	NC_004115	TAA	5	39459	39473	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
89	NC_004115	AT	6	39479	39490	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
90	NC_004115	TTTA	3	39498	39508	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
91	NC_004115	TAAAA	3	39591	39604	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
92	NC_004115	TTAAA	3	39642	39656	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	22711932
93	NC_004115	AT	8	41408	41422	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
94	NC_004115	TA	8	41433	41447	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
95	NC_004115	TA	6	41450	41460	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
96	NC_004115	TA	6	41489	41499	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
97	NC_004115	AAAAT	4	42996	43014	19	80 %	20 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
98	NC_004115	CAATT	3	43267	43281	15	40 %	40 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
99	NC_004115	TTTA	3	43637	43648	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
100	NC_004115	AAAC	3	44182	44193	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
101	NC_004115	AT	6	46202	46212	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
102	NC_004115	TAT	4	46224	46236	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
103	NC_004115	TAG	4	48641	48652	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	22711896
104	NC_004115	TA	8	49995	50009	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
105	NC_004115	TTAT	3	50022	50033	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
106	NC_004115	TGC	4	51359	51370	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	22711949
107	NC_004115	AAAT	3	51688	51698	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
108	NC_004115	T	15	51798	51812	15	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_004115	TA	6	51894	51905	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_004115	TTTA	3	52136	52147	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
111	NC_004115	TTGG	3	52170	52181	12	0 %	50 %	50 %	0 %	8 %	22711894
112	NC_004115	GTAT	3	52285	52295	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	22711894
113	NC_004115	A	15	53506	53520	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
114	NC_004115	ATT	4	53566	53576	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	22711980
115	NC_004115	AAAT	3	54373	54384	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	22711902
116	NC_004115	TTTA	3	54386	54396	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	22711902
117	NC_004115	TAT	4	55381	55391	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	22711902
118	NC_004115	TTTA	3	55630	55641	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
119	NC_004115	TTA	4	55678	55689	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
120	NC_004115	TTTTA	3	57148	57162	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	22711985
121	NC_004115	TTTAT	3	57184	57197	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	22711985
122	NC_004115	TAAA	3	57466	57477	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	22711985
123	NC_004115	ATTT	3	57692	57702	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	22711942
124	NC_004115	A	12	58559	58570	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_004115	ATTT	3	59007	59018	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	22711976
126	NC_004115	AAGA	3	59214	59225	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	22711976
127	NC_004115	AAGA	3	59813	59823	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
128	NC_004115	T	14	60022	60035	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
129	NC_004115	TTA	5	60071	60085	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
130	NC_004115	CT	6	60516	60526	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
131	NC_004115	AAAG	3	60529	60539	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
132	NC_004115	GAA	4	60695	60706	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	193735622
133	NC_004115	TAA	4	61481	61492	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	193735622
134	NC_004115	AAAGA	3	61568	61582	15	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	193735622
135	NC_004115	CTAAG	3	61723	61736	14	40 %	20 %	20 %	20 %	7 %	193735622
136	NC_004115	AAAC	3	61825	61836	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	193735622
137	NC_004115	AACC	3	62912	62924	13	50 %	0 %	0 %	50 %	7 %	22711937
138	NC_004115	A	14	63097	63110	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
139	NC_004115	TCT	4	63154	63164	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
140	NC_004115	A	12	64280	64291	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
141	NC_004115	ATTT	3	64691	64702	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
142	NC_004115	TCT	4	65421	65431	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	22711934
143	NC_004115	TATTT	3	66318	66331	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
144	NC_004115	TAAA	3	66529	66541	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
145	NC_004115	TAAT	3	66764	66775	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	22711973
146	NC_004115	ATTT	3	68252	68262	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
147	NC_004115	TA	6	68345	68355	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
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150	NC_004115	TA	8	69568	69583	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
151	NC_004115	AT	9	69639	69655	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
152	NC_004115	CAAT	3	70507	70518	12	50 %	25 %	0 %	25 %	0 %	22711928
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157	NC_004115	TAAT	3	75241	75252	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
158	NC_004115	ATT	4	75697	75708	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	22711908
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174	NC_004115	AT	7	80744	80757	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
175	NC_004115	ATTT	3	80833	80843	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	22711961
176	NC_004115	T	16	82143	82158	16	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	22711965
177	NC_004115	TA	6	82211	82222	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
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191	NC_004115	AAAT	3	87494	87505	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	22711952
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194	NC_004115	TAA	4	88714	88725	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
195	NC_004115	ACAT	3	88991	89002	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
196	NC_004115	ACAT	3	89184	89195	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
197	NC_004115	ATTG	3	90327	90337	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
198	NC_004115	TAAT	5	91112	91132	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
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204	NC_004115	AGGT	3	96228	96239	12	25 %	25 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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231	NC_004115	AAAAT	3	113017	113032	16	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
232	NC_004115	A	14	113226	113239	14	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	22711989
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249	NC_004115	TAT	4	118802	118812	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
250	NC_004115	TAA	4	120933	120944	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	22711987
251	NC_004115	ATTG	3	121534	121544	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
252	NC_004115	CTAC	3	123625	123636	12	25 %	25 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
253	NC_004115	AT	6	125958	125968	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
254	NC_004115	ATTA	5	128734	128754	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
255	NC_004115	TTAA	3	128963	128973	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
256	NC_004115	TCAA	3	129528	129538	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
257	NC_004115	AT	7	130667	130680	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
258	NC_004115	AT	6	130862	130873	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Chaetosphaeridium globosum chloroplast