ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Pyrocoelia rufa mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_003970	ATT	4	211	222	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	21326210
2	NC_003970	TAA	4	231	242	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	21326210
3	NC_003970	ATA	4	419	430	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	21326210
4	NC_003970	ATT	6	818	835	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	21326210
5	NC_003970	ATT	5	904	918	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	21326210
6	NC_003970	ATA	8	1019	1042	24	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	21326210
7	NC_003970	AGA	4	1151	1162	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	21326210
8	NC_003970	TAT	4	3611	3622	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	21326211
9	NC_003970	GAG	4	3779	3789	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	21326211
10	NC_003970	TAT	5	4514	4527	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	21326211
11	NC_003970	ATA	4	4847	4859	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	21326212
12	NC_003970	TCA	4	5947	5957	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	21326214
13	NC_003970	AAT	4	7212	7223	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	21326216
14	NC_003970	TAA	4	7696	7706	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
15	NC_003970	TTA	4	9314	9325	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	21326217
16	NC_003970	TAA	4	9576	9587	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	21326217
17	NC_003970	TAA	4	9590	9600	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	21326217
18	NC_003970	ATA	4	10976	10986	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	21326218
19	NC_003970	AAT	4	11811	11822	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	21326220
20	NC_003970	AAT	5	12605	12619	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	21326221
21	NC_003970	AAC	4	12896	12907	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	21326221
22	NC_003970	GAA	4	13493	13503	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	21326222
23	NC_003970	ATA	5	14051	14065	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	21326222
24	NC_003970	ATT	4	14978	14989	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
25	NC_003970	ATA	4	15060	15072	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
26	NC_003970	TAA	4	15270	15281	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
27	NC_003970	TAA	5	15331	15344	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
28	NC_003970	ATA	4	15366	15377	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
29	NC_003970	TAA	4	15844	15855	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
30	NC_003970	TAA	4	16141	16151	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
31	NC_003970	TAT	4	17100	17110	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Pyrocoelia rufa mitochondrion