ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Pyrocoelia rufa mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_003970	ATT	4	211	222	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	21326210
2	NC_003970	TAA	4	231	242	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	21326210
3	NC_003970	ATA	4	419	430	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	21326210
4	NC_003970	ATT	6	818	835	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	21326210
5	NC_003970	ATT	5	904	918	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	21326210
6	NC_003970	ATA	8	1019	1042	24	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	21326210
7	NC_003970	AGA	4	1151	1162	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	21326210
8	NC_003970	TAT	4	3611	3622	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	21326211
9	NC_003970	GAG	4	3779	3789	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	21326211
10	NC_003970	TAT	5	4514	4527	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	21326211
11	NC_003970	ATA	4	4847	4859	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	21326212
12	NC_003970	TA	6	5589	5599	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	21326213
13	NC_003970	TCA	4	5947	5957	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	21326214
14	NC_003970	TAACAT	3	5971	5988	18	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	5 %	21326214
15	NC_003970	TTAGA	3	6476	6489	14	40 %	40 %	20 %	0 %	7 %	21326215
16	NC_003970	T	14	6614	6627	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	21326215
17	NC_003970	AAT	4	7212	7223	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	21326216
18	NC_003970	TAA	4	7696	7706	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
19	NC_003970	TTTATA	3	7783	7800	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
20	NC_003970	TAAA	3	7932	7943	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	21326217
21	NC_003970	A	13	8153	8165	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	21326217
22	NC_003970	AT	6	8491	8501	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	21326217
23	NC_003970	TGAA	3	8958	8968	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	21326217
24	NC_003970	TTA	4	9314	9325	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	21326217
25	NC_003970	TAA	4	9576	9587	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	21326217
26	NC_003970	TAA	4	9590	9600	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	21326217
27	NC_003970	TAAA	4	9678	9693	16	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	21326218
28	NC_003970	TA	10	10568	10587	20	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	21326218
29	NC_003970	TAAA	4	10913	10928	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	21326218
30	NC_003970	ATA	4	10976	10986	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	21326218
31	NC_003970	AT	8	11249	11263	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	21326219
32	NC_003970	TTAA	3	11656	11668	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	21326220
33	NC_003970	AAT	4	11811	11822	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	21326220
34	NC_003970	TTTA	3	12183	12194	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	21326221
35	NC_003970	AAT	5	12605	12619	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	21326221
36	NC_003970	AAC	4	12896	12907	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	21326221
37	NC_003970	GAA	4	13493	13503	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	21326222
38	NC_003970	ATA	5	14051	14065	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	21326222
39	NC_003970	TAAA	3	14802	14812	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
40	NC_003970	ATT	4	14978	14989	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
41	NC_003970	TTAA	3	15036	15046	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
42	NC_003970	ATA	4	15060	15072	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
43	NC_003970	TAA	4	15270	15281	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
44	NC_003970	TAA	5	15331	15344	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
45	NC_003970	ATA	4	15366	15377	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
46	NC_003970	TAA	4	15844	15855	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
47	NC_003970	TAA	4	16141	16151	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
48	NC_003970	ATAA	4	16209	16224	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
49	NC_003970	TTAA	3	16592	16602	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
50	NC_003970	AAATA	5	16770	16794	25	80 %	20 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
51	NC_003970	TAAA	4	16829	16844	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
52	NC_003970	ATTT	4	16878	16893	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
53	NC_003970	T	12	17078	17089	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_003970	TAT	4	17100	17110	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
55	NC_003970	AATAA	3	17178	17192	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
56	NC_003970	AT	13	17486	17509	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Pyrocoelia rufa mitochondrion