ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Saccharomyces castellii mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_003920	CGG	4	17	27	11	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
2	NC_003920	ATA	5	325	339	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
3	NC_003920	ATA	5	345	359	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
4	NC_003920	ATA	5	377	392	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
5	NC_003920	ATT	4	776	787	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	21263112
6	NC_003920	AAT	4	1365	1375	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
7	NC_003920	ATA	4	1890	1902	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
8	NC_003920	ATT	4	2328	2338	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
9	NC_003920	ATA	4	2407	2417	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
10	NC_003920	TAT	4	2536	2547	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
11	NC_003920	ATA	4	2846	2857	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
12	NC_003920	ATA	6	3885	3902	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	21263113
13	NC_003920	TAA	6	3940	3956	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	21263113
14	NC_003920	TAA	6	3961	3977	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	21263113
15	NC_003920	TAA	4	4006	4016	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	21263113
16	NC_003920	ATA	7	4065	4085	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	21263113
17	NC_003920	TAA	8	4150	4173	24	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	21263113
18	NC_003920	TAT	4	4171	4182	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	21263113
19	NC_003920	TAT	4	4229	4239	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	21263113
20	NC_003920	TAA	6	4240	4256	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	21263113
21	NC_003920	ATA	7	4303	4323	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	21263113
22	NC_003920	TAA	4	4403	4413	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	21263113
23	NC_003920	ATA	5	4509	4523	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	21263113
24	NC_003920	TAA	4	4705	4715	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	21263113
25	NC_003920	AAT	5	4772	4786	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	21263113
26	NC_003920	ATA	4	4851	4863	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
27	NC_003920	ATT	4	5025	5035	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
28	NC_003920	ATA	5	5042	5056	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
29	NC_003920	ATA	4	5110	5122	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
30	NC_003920	TAT	4	5973	5984	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	21263114
31	NC_003920	ATT	4	6391	6402	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	21263114
32	NC_003920	TAA	4	6684	6695	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
33	NC_003920	AAT	4	6835	6846	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
34	NC_003920	TAT	4	7874	7884	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
35	NC_003920	ATA	5	8145	8159	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_003920	TAA	4	8317	8329	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
37	NC_003920	TAA	4	8371	8381	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
38	NC_003920	ATA	4	8653	8663	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
39	NC_003920	TAT	4	8842	8852	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
40	NC_003920	ATA	5	9162	9176	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
41	NC_003920	TTA	4	9174	9186	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
42	NC_003920	TAA	4	9426	9436	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
43	NC_003920	ATA	5	10253	10267	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	21263115
44	NC_003920	TTA	4	10265	10276	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	21263115
45	NC_003920	TTA	4	10278	10290	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	21263115
46	NC_003920	TAT	4	10714	10725	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	21263115
47	NC_003920	TAA	4	11186	11196	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	21263115
48	NC_003920	ATT	4	12645	12656	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	21263115
49	NC_003920	ATT	4	13557	13571	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
50	NC_003920	ATA	4	13593	13604	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
51	NC_003920	TAT	4	13624	13634	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
52	NC_003920	TAA	4	13740	13751	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
53	NC_003920	TAT	4	13980	13990	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	21263117
54	NC_003920	TAA	6	14007	14023	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	21263117
55	NC_003920	ATA	4	15049	15059	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
56	NC_003920	TAA	4	15369	15381	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
57	NC_003920	TAT	4	15387	15398	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
58	NC_003920	TAA	4	15420	15431	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
59	NC_003920	ATA	4	15705	15715	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
60	NC_003920	AAT	11	16626	16659	34	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	21263119
61	NC_003920	TAA	4	16873	16884	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
62	NC_003920	AAT	4	17021	17031	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
63	NC_003920	ATA	4	17262	17272	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
64	NC_003920	ATA	5	17360	17374	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
65	NC_003920	ATT	4	17683	17695	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
66	NC_003920	TAA	4	17724	17735	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
67	NC_003920	TTA	4	17849	17860	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
68	NC_003920	ATA	5	18053	18067	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
69	NC_003920	ATA	5	18562	18577	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
70	NC_003920	TAT	4	18777	18789	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
71	NC_003920	AAT	4	19638	19649	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
72	NC_003920	ATA	5	20792	20805	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
73	NC_003920	TAA	4	21146	21156	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
74	NC_003920	AAT	4	21374	21384	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
75	NC_003920	ATA	7	21620	21640	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
76	NC_003920	ATA	4	21865	21877	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
77	NC_003920	ATA	4	22587	22597	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
78	NC_003920	TAA	4	22757	22767	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
79	NC_003920	TAT	5	23333	23348	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
80	NC_003920	ATA	4	23660	23671	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
81	NC_003920	ATA	5	24420	24433	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
82	NC_003920	TAT	6	24613	24629	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding

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Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Saccharomyces castellii mitochondrion