ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Saccharomyces castellii mitochondrion

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_003920	CGG	4	17	27	11	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
2	NC_003920	AT	6	310	320	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
3	NC_003920	ATA	5	325	339	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
4	NC_003920	ATA	5	345	359	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
5	NC_003920	ATA	5	377	392	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
6	NC_003920	TA	6	406	419	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
7	NC_003920	ATAA	5	411	431	21	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
8	NC_003920	AT	8	444	460	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
9	NC_003920	TA	6	461	471	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
10	NC_003920	CATTAG	3	601	618	18	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	5 %	21263112
11	NC_003920	ATT	4	776	787	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	21263112
12	NC_003920	TTAA	3	1173	1183	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	21263112
13	NC_003920	AAT	4	1365	1375	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
14	NC_003920	TA	6	1572	1582	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
15	NC_003920	ATA	4	1890	1902	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
16	NC_003920	AT	6	2032	2042	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
17	NC_003920	ATT	4	2328	2338	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
18	NC_003920	TA	7	2384	2397	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
19	NC_003920	ATA	4	2407	2417	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
20	NC_003920	AT	6	2491	2502	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
21	NC_003920	TAT	4	2536	2547	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
22	NC_003920	ATA	4	2846	2857	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
23	NC_003920	AAAT	3	3025	3035	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
24	NC_003920	ATAA	3	3326	3337	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_003920	TA	6	3363	3373	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
26	NC_003920	TA	6	3401	3411	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
27	NC_003920	TA	8	3485	3499	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
28	NC_003920	AT	6	3521	3533	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
29	NC_003920	TA	7	3538	3550	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
30	NC_003920	AT	6	3579	3590	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
31	NC_003920	TTAA	3	3735	3745	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
32	NC_003920	TA	6	3757	3767	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
33	NC_003920	TA	6	3817	3827	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
34	NC_003920	ATA	6	3885	3902	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	21263113
35	NC_003920	TAA	6	3940	3956	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	21263113
36	NC_003920	TAA	6	3961	3977	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	21263113
37	NC_003920	AATA	3	3978	3989	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	21263113
38	NC_003920	TAA	4	4006	4016	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	21263113
39	NC_003920	ATA	7	4065	4085	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	21263113
40	NC_003920	TAA	8	4150	4173	24	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	21263113
41	NC_003920	TAT	4	4171	4182	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	21263113
42	NC_003920	TAT	4	4229	4239	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	21263113
43	NC_003920	TAA	6	4240	4256	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	21263113
44	NC_003920	TATAAA	3	4270	4288	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10 %	21263113
45	NC_003920	ATA	7	4303	4323	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	21263113
46	NC_003920	TATAA	3	4324	4337	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	21263113
47	NC_003920	AATTA	3	4384	4398	15	60 %	40 %	0 %	0 %	0 %	21263113
48	NC_003920	TAA	4	4403	4413	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	21263113
49	NC_003920	ATA	5	4509	4523	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	21263113
50	NC_003920	AAAT	3	4558	4568	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	21263113
51	NC_003920	TAA	4	4705	4715	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	21263113
52	NC_003920	AAT	5	4772	4786	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	21263113
53	NC_003920	ATA	4	4851	4863	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
54	NC_003920	ATT	4	5025	5035	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
55	NC_003920	ATA	5	5042	5056	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
56	NC_003920	AT	13	5068	5091	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
57	NC_003920	ATA	4	5110	5122	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
58	NC_003920	AT	6	5127	5137	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
59	NC_003920	TA	6	5217	5227	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
60	NC_003920	AT	6	5277	5287	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
61	NC_003920	AT	8	5424	5438	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
62	NC_003920	TA	9	5460	5476	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
63	NC_003920	TAT	4	5973	5984	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	21263114
64	NC_003920	ATT	4	6391	6402	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	21263114
65	NC_003920	TAA	4	6684	6695	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
66	NC_003920	AAT	4	6835	6846	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
67	NC_003920	AAATC	3	7460	7473	14	60 %	20 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
68	NC_003920	TAT	4	7874	7884	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
69	NC_003920	AATTA	3	8125	8139	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
70	NC_003920	ATA	5	8145	8159	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_003920	TAA	4	8317	8329	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
72	NC_003920	TATAA	5	8325	8349	25	60 %	40 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
73	NC_003920	TAA	4	8371	8381	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
74	NC_003920	TA	6	8409	8419	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
75	NC_003920	TAAT	3	8463	8473	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
76	NC_003920	AT	9	8610	8626	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
77	NC_003920	AT	6	8635	8645	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
78	NC_003920	ATA	4	8653	8663	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
79	NC_003920	AT	7	8831	8846	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
80	NC_003920	TAT	4	8842	8852	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
81	NC_003920	TA	8	9104	9120	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
82	NC_003920	ATA	5	9162	9176	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
83	NC_003920	TTA	4	9174	9186	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
84	NC_003920	TAA	4	9426	9436	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
85	NC_003920	TA	7	9505	9517	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
86	NC_003920	TA	6	10135	10148	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	21263115
87	NC_003920	ATA	5	10253	10267	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	21263115
88	NC_003920	TTA	4	10265	10276	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	21263115
89	NC_003920	TTA	4	10278	10290	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	21263115
90	NC_003920	TAT	4	10714	10725	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	21263115
91	NC_003920	TA	6	10873	10883	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	21263115
92	NC_003920	TAA	4	11186	11196	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	21263115
93	NC_003920	ATT	4	12645	12656	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	21263115
94	NC_003920	TTAT	3	12903	12914	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
95	NC_003920	AAAT	3	12968	12979	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_003920	AT	6	13039	13049	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
97	NC_003920	TA	6	13121	13131	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
98	NC_003920	AATA	3	13231	13242	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
99	NC_003920	AT	7	13454	13466	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
100	NC_003920	AT	8	13469	13483	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
101	NC_003920	ATT	4	13557	13571	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
102	NC_003920	ATA	4	13593	13604	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
103	NC_003920	TAT	4	13624	13634	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
104	NC_003920	TAA	4	13740	13751	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
105	NC_003920	AT	7	13772	13784	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
106	NC_003920	TAT	4	13980	13990	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	21263117
107	NC_003920	TAA	6	14007	14023	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	21263117
108	NC_003920	TA	6	14650	14660	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
109	NC_003920	AT	6	14747	14757	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
110	NC_003920	AT	7	14803	14817	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
111	NC_003920	AT	7	14866	14880	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
112	NC_003920	TA	11	14903	14924	22	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
113	NC_003920	ATA	4	15049	15059	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
114	NC_003920	TTAA	3	15331	15342	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
115	NC_003920	TAA	4	15369	15381	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
116	NC_003920	TAT	4	15387	15398	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
117	NC_003920	TAA	4	15420	15431	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
118	NC_003920	TA	6	15454	15464	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
119	NC_003920	AT	8	15469	15483	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
120	NC_003920	ATTA	3	15609	15619	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
121	NC_003920	TA	8	15627	15641	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
122	NC_003920	ATTT	3	15694	15704	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
123	NC_003920	ATA	4	15705	15715	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
124	NC_003920	AAAT	3	15816	15827	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
125	NC_003920	TATT	3	16017	16028	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	21263119
126	NC_003920	AT	6	16094	16105	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	21263119
127	NC_003920	AAT	11	16626	16659	34	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	21263119
128	NC_003920	TA	7	16760	16772	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
129	NC_003920	TA	6	16838	16849	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
130	NC_003920	TAA	4	16873	16884	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
131	NC_003920	AAT	4	17021	17031	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
132	NC_003920	TA	6	17104	17114	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
133	NC_003920	TA	7	17131	17144	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
134	NC_003920	ATA	4	17262	17272	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
135	NC_003920	ATA	5	17360	17374	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
136	NC_003920	AT	6	17669	17681	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
137	NC_003920	ATT	4	17683	17695	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
138	NC_003920	ATAAAT	3	17696	17712	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
139	NC_003920	TAA	4	17724	17735	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
140	NC_003920	TTA	4	17849	17860	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
141	NC_003920	ATA	5	18053	18067	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
142	NC_003920	TA	9	18205	18221	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
143	NC_003920	AT	8	18292	18308	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
144	NC_003920	AATA	3	18309	18320	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
145	NC_003920	TAGG	3	18379	18389	11	25 %	25 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
146	NC_003920	ATA	5	18562	18577	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
147	NC_003920	AT	7	18582	18595	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
148	NC_003920	AT	9	18663	18680	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
149	NC_003920	TAT	4	18777	18789	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
150	NC_003920	AT	9	18784	18800	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
151	NC_003920	TA	8	18988	19002	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
152	NC_003920	AT	6	19157	19167	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
153	NC_003920	ATAA	3	19223	19234	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
154	NC_003920	AAAT	3	19354	19364	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
155	NC_003920	TA	6	19441	19451	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
156	NC_003920	AAT	4	19638	19649	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
157	NC_003920	AT	14	19725	19750	26	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
158	NC_003920	AT	6	19753	19763	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
159	NC_003920	AT	6	19830	19841	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
160	NC_003920	TA	6	20022	20032	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
161	NC_003920	TA	6	20041	20052	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
162	NC_003920	AAAT	3	20053	20065	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
163	NC_003920	TA	8	20395	20411	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
164	NC_003920	AT	8	20412	20428	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
165	NC_003920	TA	7	20467	20479	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
166	NC_003920	ATTAAT	4	20510	20532	23	50 %	50 %	0 %	0 %	4 %	Non-Coding
167	NC_003920	CTAA	3	20564	20575	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
168	NC_003920	TA	7	20678	20691	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
169	NC_003920	ATA	5	20792	20805	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
170	NC_003920	TA	6	20844	20854	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
171	NC_003920	TAA	4	21146	21156	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
172	NC_003920	TA	7	21171	21183	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
173	NC_003920	AAT	4	21374	21384	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
174	NC_003920	AT	7	21503	21517	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
175	NC_003920	TA	8	21518	21533	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
176	NC_003920	ATA	7	21620	21640	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
177	NC_003920	TA	6	21684	21696	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
178	NC_003920	ATTA	3	21713	21724	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
179	NC_003920	ATA	4	21865	21877	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
180	NC_003920	AT	6	22194	22204	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
181	NC_003920	TA	6	22417	22427	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
182	NC_003920	TA	17	22443	22473	31	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
183	NC_003920	TATAAT	3	22553	22571	19	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
184	NC_003920	ATA	4	22587	22597	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
185	NC_003920	TAA	4	22757	22767	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
186	NC_003920	AT	8	22797	22812	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
187	NC_003920	TA	7	22814	22829	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
188	NC_003920	TAT	5	23333	23348	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
189	NC_003920	AAAT	4	23382	23396	15	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
190	NC_003920	ATA	4	23660	23671	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
191	NC_003920	AT	6	24406	24416	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
192	NC_003920	ATA	5	24420	24433	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
193	NC_003920	CATG	3	24512	24523	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
194	NC_003920	TAT	6	24613	24629	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
195	NC_003920	TA	6	25223	25233	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Saccharomyces castellii mitochondrion