ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Bombyx mandarina mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_003395	AT	7	247	259	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
2	NC_003395	T	16	334	349	16	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	18644897
3	NC_003395	TAA	4	358	372	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	18644897
4	NC_003395	TAT	4	596	607	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	18644897
5	NC_003395	AT	28	669	722	54	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
6	NC_003395	TA	29	778	834	57	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_003395	AAAAT	3	1185	1198	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	18644898
8	NC_003395	TAAA	3	1219	1230	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	18644898
9	NC_003395	AAATA	3	1749	1763	15	80 %	20 %	0 %	0 %	0 %	18644898
10	NC_003395	TAAA	3	1969	1979	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	18644898
11	NC_003395	AAT	4	2333	2344	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	18644898
12	NC_003395	TAA	4	2587	2599	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	18644898
13	NC_003395	ATT	4	2950	2961	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
14	NC_003395	AT	27	2968	3021	54	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
15	NC_003395	TAT	11	3005	3036	32	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	18644899
16	NC_003395	ATA	4	3100	3112	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	18644899
17	NC_003395	ATA	4	3322	3333	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	18644899
18	NC_003395	ATC	4	3334	3345	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	18644899
19	NC_003395	TAAA	3	3857	3867	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	18644899
20	NC_003395	AAAT	3	3941	3951	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	18644899
21	NC_003395	A	15	4028	4042	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	18644899
22	NC_003395	TAA	5	4038	4051	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	18644899
23	NC_003395	AAAAAT	3	4111	4128	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	18644899
24	NC_003395	AT	7	4488	4502	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	18644900
25	NC_003395	A	16	4526	4541	16	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	18644900
26	NC_003395	ATAA	3	4630	4641	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	18644900
27	NC_003395	TAA	4	4830	4841	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	18644901
28	NC_003395	ATT	5	4984	4998	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	18644901
29	NC_003395	ATT	4	5029	5040	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	18644901
30	NC_003395	TAT	5	5065	5079	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	18644901
31	NC_003395	ATA	4	5093	5103	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	18644901
32	NC_003395	AAAT	3	5148	5159	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	18644901
33	NC_003395	ATTT	4	5251	5266	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	18644901
34	NC_003395	GTA	4	5276	5287	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	18644901
35	NC_003395	AAAT	3	5326	5337	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	18644901
36	NC_003395	AT	23	5332	5377	46	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	18644901
37	NC_003395	ATTT	3	5954	5964	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	18644902
38	NC_003395	ATTT	3	5983	5993	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	18644902
39	NC_003395	ATTT	3	6089	6099	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	18644902
40	NC_003395	A	14	6531	6544	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	18644902
41	NC_003395	TAAAA	3	6640	6653	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	18644903
42	NC_003395	ATA	4	6668	6680	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	18644903
43	NC_003395	ATAAAT	3	7559	7577	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10 %	18644903
44	NC_003395	AAAAT	3	8465	8479	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
45	NC_003395	ATT	4	8600	8610	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
46	NC_003395	TTTA	3	8623	8634	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
47	NC_003395	TTA	4	8754	8766	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
48	NC_003395	AATT	4	8990	9005	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
49	NC_003395	TTAA	3	9203	9214	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
50	NC_003395	TAT	5	9351	9365	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
51	NC_003395	TTA	4	9509	9520	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
52	NC_003395	ATTTTA	3	9623	9640	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
53	NC_003395	AATTT	3	9674	9688	15	40 %	60 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_003395	CTTA	3	9745	9756	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
55	NC_003395	ATT	4	9787	9799	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
56	NC_003395	T	22	9906	9927	22	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_003395	ATT	5	9946	9961	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
58	NC_003395	ATTTAA	3	10042	10060	19	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
59	NC_003395	ATT	4	10075	10087	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
60	NC_003395	ATTTAA	3	10168	10186	19	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
61	NC_003395	ATT	4	10201	10213	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
62	NC_003395	ATTTAA	3	10294	10312	19	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
63	NC_003395	AATT	3	10437	10449	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
64	NC_003395	TA	12	10471	10492	22	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
65	NC_003395	TA	6	10508	10518	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
66	NC_003395	AT	12	10545	10569	25	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
67	NC_003395	TTTAT	3	10752	10766	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
68	NC_003395	ATT	4	11661	11673	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	18644904
69	NC_003395	ATT	5	11730	11745	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	18644904
70	NC_003395	TAT	5	12689	12703	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	18644905
71	NC_003395	GAAA	3	12896	12907	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	18644905
72	NC_003395	TAA	5	13502	13516	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	18644905
73	NC_003395	AATT	3	14381	14391	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	18644906
74	NC_003395	ATT	4	14773	14785	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	18644908
75	NC_003395	TTTTA	3	14926	14939	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	18644908
76	NC_003395	TAATTT	3	15490	15507	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
77	NC_003395	TTA	4	15520	15530	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
78	NC_003395	ACAAA	3	15853	15866	14	80 %	0 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Bombyx mandarina mitochondrion