ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Hypocrea jecorina mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_003388	AAT	4	279	290	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	18640465
2	NC_003388	TTA	4	535	547	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	18640465
3	NC_003388	TAA	5	1517	1531	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
4	NC_003388	CTA	4	2381	2392	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	18640464
5	NC_003388	TTA	4	3241	3251	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
6	NC_003388	ATA	4	3271	3281	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
7	NC_003388	AAT	4	3346	3357	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	18640463
8	NC_003388	GAG	4	5417	5427	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
9	NC_003388	TTA	4	7242	7252	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	18640456
10	NC_003388	ATC	4	7524	7535	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	0 %	18640456
11	NC_003388	TAA	4	9373	9384	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
12	NC_003388	ATT	4	9388	9399	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
13	NC_003388	TAA	5	12080	12094	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
14	NC_003388	TAA	4	12591	12602	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	18640452
15	NC_003388	TAT	4	12707	12717	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	18640452
16	NC_003388	TTC	4	15908	15919	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
17	NC_003388	ATA	4	16648	16659	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	18640451
18	NC_003388	TAT	4	17030	17042	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	18640451
19	NC_003388	TTA	5	17865	17878	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	18640451
20	NC_003388	ATA	4	18140	18151	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	18640451
21	NC_003388	ATA	4	18179	18189	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	18640451
22	NC_003388	CTA	4	20817	20827	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	18640453
23	NC_003388	TAA	4	20833	20843	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	18640453
24	NC_003388	ATT	4	21770	21781	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	18640453
25	NC_003388	TTA	4	21828	21838	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	18640466
26	NC_003388	AAC	4	24430	24441	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	18640450
27	NC_003388	ATT	4	25330	25341	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	18640450
28	NC_003388	AGT	4	25918	25929	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	18640450
29	NC_003388	GAA	4	26754	26765	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
30	NC_003388	TAC	4	26993	27004	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
31	NC_003388	TAT	4	27322	27332	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
32	NC_003388	ATA	7	27798	27818	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	21200770
33	NC_003388	ATA	4	28876	28886	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	21200770
34	NC_003388	GAT	4	29873	29884	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	21200770
35	NC_003388	TTA	4	31224	31236	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
36	NC_003388	TAT	5	31935	31949	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	18640468
37	NC_003388	TTA	4	32099	32110	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	18640468
38	NC_003388	TAA	4	32725	32736	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	18640468
39	NC_003388	TTA	6	33471	33488	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	18640468
40	NC_003388	ATT	4	37147	37159	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	18640468
41	NC_003388	TAA	4	37345	37356	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	18640468
42	NC_003388	ATA	4	37790	37801	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	18640468
43	NC_003388	TAT	4	39055	39066	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	18640468
44	NC_003388	ATA	4	40244	40254	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
45	NC_003388	TAC	4	40907	40918	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	18640455
46	NC_003388	TAT	4	41336	41348	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	18640455

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Hypocrea jecorina mitochondrion