ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Crioceris duodecimpunctata mitochondrion

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_003372	AAGCT	3	141	154	14	40 %	20 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
2	NC_003372	GATA	3	330	340	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	18390113
3	NC_003372	TTAA	3	589	601	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	18390113
4	NC_003372	AATT	3	922	933	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	18390113
5	NC_003372	TTTAAA	3	1295	1313	19	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
6	NC_003372	TAT	4	3111	3122	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	18390115
7	NC_003372	ATT	4	3665	3675	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	18390115
8	NC_003372	ATT	4	3913	3923	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	18390116
9	NC_003372	TTAA	3	4038	4049	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	18390117
10	NC_003372	ATT	4	4565	4575	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	18390117
11	NC_003372	ATTT	3	4761	4773	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	18390118
12	NC_003372	TAA	4	4790	4801	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	18390118
13	NC_003372	T	14	4931	4944	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	18390118
14	NC_003372	ATT	4	5459	5469	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
15	NC_003372	AAT	4	5514	5525	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	18390119
16	NC_003372	TTA	7	5555	5574	20	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10 %	18390119
17	NC_003372	ATT	4	6283	6294	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	18390120
18	NC_003372	AAAT	4	6352	6367	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	18390120
19	NC_003372	TAAA	3	6426	6437	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	18390120
20	NC_003372	TAAA	3	6488	6498	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	18390120
21	NC_003372	AATT	3	6645	6656	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	18390120
22	NC_003372	AATA	3	6813	6824	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	18390120
23	NC_003372	ATA	4	7226	7237	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	18390120
24	NC_003372	TAAA	4	7455	7469	15	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	18390120
25	NC_003372	TAA	4	7655	7667	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	18390120
26	NC_003372	ATT	4	7822	7833	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	18390120
27	NC_003372	ATAAA	4	7901	7919	19	80 %	20 %	0 %	0 %	10 %	18390120
28	NC_003372	AATA	4	8025	8041	17	75 %	25 %	0 %	0 %	5 %	18390121
29	NC_003372	ATT	4	8450	8461	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	18390121
30	NC_003372	ATAA	3	8757	8768	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	18390121
31	NC_003372	AAAT	3	8926	8936	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	18390121
32	NC_003372	ATAAAA	4	9500	9523	24	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	8 %	18390122
33	NC_003372	TAAAA	3	9599	9612	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	18390122
34	NC_003372	TA	6	9958	9968	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	18390123
35	NC_003372	TAT	8	10031	10054	24	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	18390123
36	NC_003372	AATT	3	10087	10098	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	18390123
37	NC_003372	TA	6	10183	10193	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	18390123
38	NC_003372	ATT	4	11242	11252	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	18390124
39	NC_003372	ATT	5	11267	11280	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	18390124
40	NC_003372	TTATTT	3	11343	11361	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	10 %	18390124
41	NC_003372	AAAT	3	11538	11549	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	18390125
42	NC_003372	AAGT	3	11676	11687	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	18390125
43	NC_003372	AATT	3	12564	12574	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
44	NC_003372	TAA	4	12770	12781	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
45	NC_003372	TTAATA	4	13240	13264	25	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
46	NC_003372	AAT	4	13323	13335	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
47	NC_003372	TAA	4	13434	13444	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
48	NC_003372	AATT	4	13592	13607	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
49	NC_003372	TAAT	4	13960	13975	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
50	NC_003372	CAAATT	3	13984	14001	18	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
51	NC_003372	ACTA	3	14007	14017	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
52	NC_003372	ATA	4	14086	14096	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
53	NC_003372	AATTT	3	14770	14783	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
54	NC_003372	AATT	3	14798	14809	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
55	NC_003372	T	17	14857	14873	17	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_003372	T	16	15151	15166	16	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_003372	TA	7	15220	15234	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
58	NC_003372	AT	8	15394	15408	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
59	NC_003372	TTTA	3	15424	15435	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
60	NC_003372	TAA	5	15444	15458	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
61	NC_003372	AT	6	15469	15480	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
62	NC_003372	A	12	15699	15710	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Crioceris duodecimpunctata mitochondrion