ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Perfect Repeats of Medicago truncatula chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003119	ATTA	4	2668	2683	16	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_003119	TA	7	2714	2727	14	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_003119	TATT	3	8470	8481	12	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_003119	T	18	13087	13104	18	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_003119	AT	6	13281	13292	12	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_003119	TA	6	13304	13315	12	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_003119	T	13	15177	15189	13	0 %	100 %	0 %	0 %	153012167
8	NC_003119	T	18	15966	15983	18	0 %	100 %	0 %	0 %	153012167
9	NC_003119	AAT	4	28937	28948	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_003119	ATC	6	35068	35085	18	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153012189
11	NC_003119	ATTT	3	39320	39331	12	25 %	75 %	0 %	0 %	153012189
12	NC_003119	T	12	42113	42124	12	0 %	100 %	0 %	0 %	153012189
13	NC_003119	A	13	43834	43846	13	100 %	0 %	0 %	0 %	153012189
14	NC_003119	T	15	44602	44616	15	0 %	100 %	0 %	0 %	153012189
15	NC_003119	ATA	4	45306	45317	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153012189
16	NC_003119	A	12	45322	45333	12	100 %	0 %	0 %	0 %	153012189
17	NC_003119	TCAT	3	45510	45521	12	25 %	50 %	0 %	25 %	153012189
18	NC_003119	A	17	45659	45675	17	100 %	0 %	0 %	0 %	153012189
19	NC_003119	A	14	46723	46736	14	100 %	0 %	0 %	0 %	153012189
20	NC_003119	T	12	51207	51218	12	0 %	100 %	0 %	0 %	153012189
21	NC_003119	T	14	51833	51846	14	0 %	100 %	0 %	0 %	153012189
22	NC_003119	TATT	3	58321	58332	12	25 %	75 %	0 %	0 %	153012191
23	NC_003119	T	13	59503	59515	13	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_003119	A	16	59539	59554	16	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_003119	TTA	4	59961	59972	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_003119	TA	7	60077	60090	14	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_003119	T	15	62578	62592	15	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_003119	T	14	66254	66267	14	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_003119	ATC	4	68247	68258	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153012203
30	NC_003119	AATTTG	3	74287	74304	18	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_003119	T	12	75016	75027	12	0 %	100 %	0 %	0 %	153012207
32	NC_003119	TAA	4	75724	75735	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_003119	TAAT	3	75748	75759	12	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_003119	AT	7	76077	76090	14	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_003119	T	13	76567	76579	13	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_003119	TGAA	3	77077	77088	12	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_003119	TAAT	4	77285	77300	16	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_003119	AT	6	78183	78194	12	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_003119	T	12	79421	79432	12	0 %	100 %	0 %	0 %	196154823
40	NC_003119	ATT	4	80543	80554	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	196154823
41	NC_003119	T	13	81322	81334	13	0 %	100 %	0 %	0 %	196154823
42	NC_003119	TTCATT	3	85005	85022	18	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	153012212
43	NC_003119	T	12	85831	85842	12	0 %	100 %	0 %	0 %	153012212
44	NC_003119	ATTT	3	90137	90148	12	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_003119	ATA	4	90481	90492	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_003119	T	15	92311	92325	15	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_003119	A	15	93104	93118	15	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_003119	GATA	3	95434	95445	12	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_003119	A	12	99618	99629	12	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_003119	A	14	107704	107717	14	100 %	0 %	0 %	0 %	153012222
51	NC_003119	AAT	4	109596	109607	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_003119	TTAA	3	109634	109645	12	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_003119	TA	6	109975	109986	12	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_003119	A	15	116891	116905	15	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_003119	GAAT	3	119283	119294	12	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_003119	A	12	119316	119327	12	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_003119	T	14	119368	119381	14	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_003119	T	12	119617	119628	12	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_003119	A	12	123731	123742	12	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Perfect Repeats of Medicago truncatula chloroplast