ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Spizellomyces punctatus mitochondrion chromosome 1

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_003052	TTA	5	3927	3941	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
2	NC_003052	ATT	4	8607	8618	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	15147295
3	NC_003052	GAA	4	9815	9826	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	15147296
4	NC_003052	AGA	7	11053	11073	21	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	15147298
5	NC_003052	ACT	4	13624	13635	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	0 %	15147300
6	NC_003052	ATA	4	15244	15254	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	15147302
7	NC_003052	TAA	4	16874	16885	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	15147302
8	NC_003052	TTA	4	17391	17401	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
9	NC_003052	ATA	4	18452	18464	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
10	NC_003052	TAC	4	20056	20066	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
11	NC_003052	TAA	4	20244	20254	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
12	NC_003052	TAT	4	20917	20929	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	15147305
13	NC_003052	TAC	4	22315	22326	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	15147305
14	NC_003052	TAT	4	22407	22418	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	15147305
15	NC_003052	TTA	4	24430	24441	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
16	NC_003052	TAA	4	25050	25061	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
17	NC_003052	TAA	4	25067	25079	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
18	NC_003052	TAA	4	25536	25547	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	15147308
19	NC_003052	ATA	4	25673	25684	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	15147308
20	NC_003052	ACT	4	25843	25854	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	15147308
21	NC_003052	GTA	4	28791	28802	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	15147310
22	NC_003052	ATA	4	28987	28998	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	15147310
23	NC_003052	ATA	4	29821	29831	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
24	NC_003052	TTA	4	30239	30251	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	15147311
25	NC_003052	TTA	4	30420	30431	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	15147311
26	NC_003052	TAA	4	31939	31950	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	15147312
27	NC_003052	ATA	4	33730	33741	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
28	NC_003052	AGT	4	34658	34669	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
29	NC_003052	CAA	4	35889	35900	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
30	NC_003052	ATA	4	37185	37196	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	15147313
31	NC_003052	AAT	4	37297	37309	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	15147313
32	NC_003052	ATA	4	39002	39013	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
33	NC_003052	TAG	4	41180	41191	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
34	NC_003052	CAG	4	44113	44124	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
35	NC_003052	AGT	4	46231	46241	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	15147318
36	NC_003052	TCG	4	49954	49964	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	15147320
37	NC_003052	CAT	4	50101	50112	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	15147320
38	NC_003052	ACT	4	51729	51740	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	15147320
39	NC_003052	TAT	4	52324	52335	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	15147320
40	NC_003052	CTA	4	52525	52536	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	15147320
41	NC_003052	TAC	4	53484	53495	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
42	NC_003052	ATT	4	54613	54625	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	15147323
43	NC_003052	ACT	4	55097	55109	13	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	15147324
44	NC_003052	TAA	4	56757	56768	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
45	NC_003052	TGA	4	58093	58104	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Spizellomyces punctatus mitochondrion chromosome 1