ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Schizophyllum commune mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_003049	ATA	4	3527	3538	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_003049	ATA	4	4547	4559	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
3	NC_003049	TAA	4	4572	4583	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
4	NC_003049	TAA	4	5240	5250	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
5	NC_003049	ATA	4	5788	5802	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
6	NC_003049	AAT	4	6065	6075	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
7	NC_003049	TAA	4	6394	6405	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
8	NC_003049	TAG	4	8399	8409	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
9	NC_003049	ATA	5	8434	8448	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
10	NC_003049	TAA	4	8762	8774	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
11	NC_003049	TAG	4	9519	9530	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	15088704
12	NC_003049	TAA	4	10918	10929	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
13	NC_003049	TAA	4	10932	10942	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
14	NC_003049	TCT	4	11235	11246	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	15088705
15	NC_003049	ATA	4	11669	11680	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	15088705
16	NC_003049	ATA	4	11879	11890	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	15088705
17	NC_003049	TAT	4	11922	11933	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	15088705
18	NC_003049	ATA	5	11972	11985	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	15088705
19	NC_003049	TAA	4	12279	12290	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	15088705
20	NC_003049	TAA	6	12579	12596	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	15088705
21	NC_003049	TTA	4	12974	12985	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	15088705
22	NC_003049	AAT	4	13243	13254	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	15088705
23	NC_003049	TAA	5	13506	13520	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	15088705
24	NC_003049	ATA	4	13685	13695	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	15088705
25	NC_003049	ATA	4	13994	14005	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	15088705
26	NC_003049	ATA	4	14918	14929	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	15088705
27	NC_003049	TAA	4	15393	15404	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	15088705
28	NC_003049	AAT	4	17412	17425	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	15088706
29	NC_003049	ATA	5	17561	17575	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	15088706
30	NC_003049	AAT	4	19528	19538	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
31	NC_003049	ATT	4	20019	20030	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
32	NC_003049	ATA	4	20694	20705	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
33	NC_003049	CTA	4	20841	20852	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	15088708
34	NC_003049	TAT	4	21393	21404	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	15088708
35	NC_003049	ATA	4	22055	22066	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	15088709
36	NC_003049	TAA	7	23486	23509	24	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
37	NC_003049	TAA	4	25151	25161	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
38	NC_003049	TTA	5	25328	25344	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
39	NC_003049	ATA	4	25440	25451	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
40	NC_003049	ATT	5	25985	25998	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
41	NC_003049	TAT	4	26668	26679	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
42	NC_003049	ATT	4	27124	27135	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
43	NC_003049	TTA	4	27478	27488	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
44	NC_003049	TAT	4	27917	27927	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
45	NC_003049	TTC	4	28962	28973	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	15088711
46	NC_003049	TTA	4	29548	29558	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
47	NC_003049	TAT	4	29847	29858	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
48	NC_003049	TTA	4	31234	31245	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	15088712
49	NC_003049	TAT	4	32126	32137	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	15088713
50	NC_003049	GAA	4	32829	32841	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	15088714
51	NC_003049	TTA	4	33723	33733	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
52	NC_003049	TAG	4	35147	35158	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	15088715
53	NC_003049	TCT	4	35336	35347	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	15088715
54	NC_003049	TAT	4	36783	36794	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	15088716
55	NC_003049	AGA	4	39386	39396	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	15088717
56	NC_003049	TAT	5	39600	39615	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	15088718
57	NC_003049	ATA	4	41013	41024	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	15088718
58	NC_003049	TAT	4	41598	41608	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
59	NC_003049	CTA	5	42087	42100	14	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	15088719
60	NC_003049	ATT	4	42909	42919	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
61	NC_003049	TTA	4	44543	44554	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	15088721
62	NC_003049	ATT	4	44779	44791	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	15088721
63	NC_003049	TAA	4	44965	44976	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	15088721
64	NC_003049	TTG	4	45648	45658	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	15088721
65	NC_003049	ATT	4	45873	45885	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
66	NC_003049	AAT	4	46434	46444	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
67	NC_003049	TAT	4	46685	46696	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	15088722
68	NC_003049	ACT	4	47619	47630	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	15088723
69	NC_003049	ATT	4	49222	49233	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
70	NC_003049	ATT	5	49260	49274	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
71	NC_003049	ATT	4	49415	49426	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Schizophyllum commune mitochondrion