ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Triticum aestivum chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_002762	AAT	4	4466	4477	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_002762	GAA	4	8542	8553	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_002762	TTG	4	10861	10871	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	14017558
4	NC_002762	AAT	4	14174	14185	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
5	NC_002762	ATA	4	19122	19132	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
6	NC_002762	AGA	4	20544	20555	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	14017562
7	NC_002762	AAC	4	23200	23211	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	14017563
8	NC_002762	AAT	5	24888	24902	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	14017563
9	NC_002762	ATT	4	30102	30114	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
10	NC_002762	GTT	5	31788	31802	15	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	6 %	14017566
11	NC_002762	TGC	4	32517	32528	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	14017567
12	NC_002762	CTA	4	40171	40182	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	14017572
13	NC_002762	AGT	4	43115	43125	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	14017573
14	NC_002762	AAT	4	45190	45200	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
15	NC_002762	ATA	4	47387	47398	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
16	NC_002762	TAT	5	47730	47745	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
17	NC_002762	TAA	6	50585	50601	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
18	NC_002762	GAA	4	58266	58276	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
19	NC_002762	TTA	4	63103	63114	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
20	NC_002762	TCT	4	64222	64234	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
21	NC_002762	TTC	5	64985	64999	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
22	NC_002762	TAA	4	66772	66783	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
23	NC_002762	AGA	4	74095	74106	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	14017595
24	NC_002762	TAT	5	75152	75165	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	14017595
25	NC_002762	CTT	5	80268	80281	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	14017595
26	NC_002762	TTC	4	81383	81393	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	14017595
27	NC_002762	TTA	4	84285	84295	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	14017595
28	NC_002762	TAC	4	88899	88910	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	14017595
29	NC_002762	TAA	4	103548	103558	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	14017595
30	NC_002762	ATA	4	104650	104660	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	14017595
31	NC_002762	CAA	4	107908	107918	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	14017595
32	NC_002762	GTA	4	125984	125995	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	14017595
33	NC_002762	ATA	4	130598	130608	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Triticum aestivum chloroplast