ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Caiman crocodilus mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_002744	C	12	682	693	12	0 %	0 %	0 %	100 %	8 %	Non-Coding
2	NC_002744	GTTC	3	2442	2453	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
3	NC_002744	TC	6	3903	3914	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	13786610
4	NC_002744	GAG	4	5992	6002	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	166240015
5	NC_002744	CTC	4	8042	8053	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	13786614
6	NC_002744	CAA	4	8085	8096	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	13786614
7	NC_002744	CAA	4	8241	8251	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	13786614
8	NC_002744	CCT	5	8551	8565	15	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	6 %	13786614
9	NC_002744	TCT	4	8912	8923	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	13786615
10	NC_002744	CCA	4	9991	10002	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	8 %	13786616
11	NC_002744	TCAT	3	10088	10098	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	13786616
12	NC_002744	CAT	4	10292	10303	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	14190594
13	NC_002744	CCTA	3	11469	11479	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	14190594
14	NC_002744	ATA	4	11637	11647	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
15	NC_002744	CAA	4	12167	12177	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	13786617
16	NC_002744	CCTC	3	12203	12213	11	0 %	25 %	0 %	75 %	9 %	13786617
17	NC_002744	ACA	4	12232	12242	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	13786617
18	NC_002744	TAA	4	12439	12450	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	13786617
19	NC_002744	GCA	4	12714	12725	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	13786617
20	NC_002744	TAG	4	12812	12822	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	13786617
21	NC_002744	ACC	4	12876	12887	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	8 %	13786617
22	NC_002744	AAAT	3	13807	13818	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	13786617
23	NC_002744	GAAG	3	13864	13875	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	13786617
24	NC_002744	CA	6	14076	14086	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	13786618
25	NC_002744	ACC	4	14090	14101	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	8 %	13786618
26	NC_002744	AAAC	3	15587	15598	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	13786619
27	NC_002744	TTC	4	16164	16175	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
28	NC_002744	C	14	16411	16424	14	0 %	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
29	NC_002744	TA	6	16466	16477	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
30	NC_002744	TA	6	16753	16764	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
31	NC_002744	TA	6	17040	17051	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
32	NC_002744	TA	6	17327	17338	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
33	NC_002744	TA	6	17614	17625	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Caiman crocodilus mitochondrion