Team
Contact

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Lotus japonicus chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_002694GAA4307130821266.67 %0 %33.33 %0 %8 %13518419
2NC_002694TAT512560125731433.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
3NC_002694TAT513974139891633.33 %66.67 %0 %0 %6 %Non-Coding
4NC_002694TAT715044150642133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
5NC_002694TAT515067150821633.33 %66.67 %0 %0 %6 %Non-Coding
6NC_002694CTT41653816549120 %66.67 %0 %33.33 %8 %157011997
7NC_002694CAT419891199011133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %13518428
8NC_002694TGC42021620227120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %13518428
9NC_002694ACT422385223951133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %13518429
10NC_002694AAG424191242011166.67 %0 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
11NC_002694ATA524438244521566.67 %33.33 %0 %0 %0 %Non-Coding
12NC_002694ATA424467244781266.67 %33.33 %0 %0 %0 %Non-Coding
13NC_002694ATT429566295771233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
14NC_002694ATA432628326381166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
15NC_002694GAA435017350271166.67 %0 %33.33 %0 %9 %13518436
16NC_002694TGA435292353021133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %13518436
17NC_002694AAC437639376501266.67 %0 %0 %33.33 %8 %13518437
18NC_002694ATT438071380811133.33 %66.67 %0 %0 %9 %13518437
19NC_002694GAA439098391101366.67 %0 %33.33 %0 %7 %13518437
20NC_002694CAT440883408941233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %13518438
21NC_002694TAA545668456811466.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
22NC_002694TAG446422464331233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %13518440
23NC_002694TTA447768477791233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
24NC_002694TTA453497535081233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
25NC_002694TAA453980539911266.67 %33.33 %0 %0 %8 %13518445
26NC_002694ATT454961549731333.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
27NC_002694TTG45630656317120 %66.67 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
28NC_002694ATC456584565951233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
29NC_002694ATA464349643591166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
30NC_002694TAT464368643781133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
31NC_002694GTT46591865928110 %66.67 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
32NC_002694TCT46594465955120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
33NC_002694CTG46760167612120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %13518462
34NC_002694TCT47591475925120 %66.67 %0 %33.33 %8 %13518462
35NC_002694TAT578384783991633.33 %66.67 %0 %0 %6 %13518462
36NC_002694CAA478820788311266.67 %0 %0 %33.33 %8 %13518462
37NC_002694TTA479821798321233.33 %66.67 %0 %0 %8 %13518462
38NC_002694CTT48204982060120 %66.67 %0 %33.33 %8 %13518462
39NC_002694GAT482517825271133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %13518462
40NC_002694GAT483910839201133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %13518462
41NC_002694GAA499950999611266.67 %0 %33.33 %0 %8 %13518462
42NC_002694ATA41071211071321266.67 %33.33 %0 %0 %8 %13518462
43NC_002694ATT41078301078421333.33 %66.67 %0 %0 %7 %13518462
44NC_002694TAA41100491100611366.67 %33.33 %0 %0 %7 %13518462
45NC_002694ATT41104291104411333.33 %66.67 %0 %0 %7 %13518462
46NC_002694AAT51144601144741566.67 %33.33 %0 %0 %6 %13518462
47NC_002694ATA41161711161831366.67 %33.33 %0 %0 %7 %13518462
48NC_002694TCC4120159120169110 %33.33 %0 %66.67 %9 %13518462
49NC_002694ATT41202801202921333.33 %66.67 %0 %0 %7 %13518462
50NC_002694TCT4121499121509110 %66.67 %0 %33.33 %9 %13518462
51NC_002694ATT41249851249961233.33 %66.67 %0 %0 %8 %13518462
52NC_002694ACC41437201437301133.33 %0 %0 %66.67 %9 %13518498
53NC_002694ATC41485361485461133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
54NC_002694ATC41499291499391133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %13518500
55NC_002694GAA51503951504091566.67 %0 %33.33 %0 %6 %13518500