ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Di-nucleotide Imperfect Repeats of Lotus japonicus chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_002694	TA	12	5036	5057	22	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_002694	TA	7	14620	14633	14	50 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
3	NC_002694	AT	13	14650	14674	25	50 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
4	NC_002694	AT	7	14677	14690	14	50 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
5	NC_002694	AT	6	14731	14743	13	50 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
6	NC_002694	TA	11	25582	25603	22	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
7	NC_002694	CT	6	25806	25816	11	0 %	50 %	50 %	9 %	Non-Coding
8	NC_002694	TA	6	26879	26889	11	50 %	50 %	0 %	9 %	13518432
9	NC_002694	TA	6	29558	29568	11	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
10	NC_002694	TA	6	30273	30283	11	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
11	NC_002694	AT	7	36797	36809	13	50 %	50 %	0 %	7 %	13518436
12	NC_002694	AT	6	41385	41396	12	50 %	50 %	0 %	8 %	13518438
13	NC_002694	TA	6	42897	42907	11	50 %	50 %	0 %	9 %	13518438
14	NC_002694	TA	8	46858	46872	15	50 %	50 %	0 %	6 %	Non-Coding
15	NC_002694	TA	7	46879	46894	16	50 %	50 %	0 %	6 %	Non-Coding
16	NC_002694	AT	6	47747	47760	14	50 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
17	NC_002694	TA	6	47838	47849	12	50 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
18	NC_002694	TA	6	47854	47865	12	50 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
19	NC_002694	TA	9	48537	48554	18	50 %	50 %	0 %	5 %	13518442
20	NC_002694	AT	6	51160	51171	12	50 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
21	NC_002694	AT	11	51324	51349	26	50 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
22	NC_002694	AT	7	54634	54647	14	50 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
23	NC_002694	TA	6	54719	54729	11	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
24	NC_002694	AT	6	54741	54751	11	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
25	NC_002694	AT	6	58363	58375	13	50 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
26	NC_002694	TA	11	60449	60471	23	50 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
27	NC_002694	AT	6	63773	63783	11	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
28	NC_002694	AT	6	64004	64016	13	50 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
29	NC_002694	AT	7	64093	64105	13	50 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
30	NC_002694	AT	6	65415	65425	11	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
31	NC_002694	TA	6	66213	66223	11	50 %	50 %	0 %	9 %	13518461
32	NC_002694	AC	6	67102	67112	11	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
33	NC_002694	TA	6	77223	77233	11	50 %	50 %	0 %	9 %	13518462
34	NC_002694	TA	6	79776	79786	11	50 %	50 %	0 %	9 %	13518462
35	NC_002694	AT	7	80175	80188	14	50 %	50 %	0 %	7 %	13518462
36	NC_002694	TA	11	92154	92174	21	50 %	50 %	0 %	9 %	13518462
37	NC_002694	TA	7	106469	106482	14	50 %	50 %	0 %	7 %	13518462
38	NC_002694	TA	12	109450	109473	24	50 %	50 %	0 %	8 %	13518462
39	NC_002694	AT	7	110734	110746	13	50 %	50 %	0 %	7 %	13518462
40	NC_002694	TA	9	120171	120188	18	50 %	50 %	0 %	5 %	13518462
41	NC_002694	TA	6	120433	120444	12	50 %	50 %	0 %	8 %	13518462
42	NC_002694	TA	7	125976	125989	14	50 %	50 %	0 %	7 %	13518462
43	NC_002694	AT	9	140286	140303	18	50 %	50 %	0 %	5 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Di-nucleotide Imperfect Repeats of Lotus japonicus chloroplast