ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tetra-nucleotide Imperfect Repeats of Oenothera elata subsp. hookeri plastid plastome I

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_002693	GAAC	3	109	119	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
2	NC_002693	AAGT	3	1064	1074	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	13518299
3	NC_002693	TTTA	3	5052	5062	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	13518301
4	NC_002693	CCAT	3	6513	6524	12	25 %	25 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_002693	CCAT	3	6620	6631	12	25 %	25 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_002693	CCAT	3	6891	6902	12	25 %	25 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_002693	CCAT	3	7015	7026	12	25 %	25 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_002693	AAAG	3	9016	9027	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_002693	AAGA	3	12328	12338	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
10	NC_002693	AAGA	5	13250	13268	19	75 %	0 %	25 %	0 %	10 %	Non-Coding
11	NC_002693	TTTA	3	17765	17776	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
12	NC_002693	TCTA	3	18111	18121	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
13	NC_002693	AAAG	3	20818	20828	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	164597810
14	NC_002693	TTCA	3	23041	23052	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
15	NC_002693	AATA	3	23168	23179	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
16	NC_002693	TACT	3	28853	28864	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
17	NC_002693	AAGC	3	30539	30549	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	164597814
18	NC_002693	AATC	3	32657	32667	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
19	NC_002693	TATC	3	39662	39672	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	164597817
20	NC_002693	TAGG	3	41608	41618	11	25 %	25 %	50 %	0 %	9 %	164597817
21	NC_002693	ATTT	3	43441	43451	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	164597818
22	NC_002693	AGTT	3	52397	52407	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
23	NC_002693	AGAC	3	55126	55137	12	50 %	0 %	25 %	25 %	0 %	164597823
24	NC_002693	CTTT	3	57207	57218	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
25	NC_002693	AAAT	5	57662	57680	19	75 %	25 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
26	NC_002693	ATGG	3	60789	60800	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
27	NC_002693	GATC	3	65384	65396	13	25 %	25 %	25 %	25 %	7 %	164597825
28	NC_002693	AAAG	3	68910	68921	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_002693	AAAT	3	71104	71115	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
30	NC_002693	TGAT	3	71324	71335	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
31	NC_002693	ATTA	3	71887	71898	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	13518352
32	NC_002693	TTTC	3	73374	73385	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
33	NC_002693	ACAA	3	73625	73636	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	13518354
34	NC_002693	TGAA	3	74839	74850	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
35	NC_002693	AAGA	3	76751	76762	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	13518409
36	NC_002693	GTTT	3	80448	80458	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	13518409
37	NC_002693	CTTT	3	86238	86248	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	13518409
38	NC_002693	TTCT	3	86863	86874	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	13518409
39	NC_002693	GAAT	3	87121	87132	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	13518409
40	NC_002693	TTCT	3	87459	87470	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	13518409
41	NC_002693	ACTA	3	88817	88827	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	13518409
42	NC_002693	TTCT	4	92948	92962	15	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	13518409
43	NC_002693	ATCG	3	93596	93608	13	25 %	25 %	25 %	25 %	7 %	13518409
44	NC_002693	CGTT	3	94069	94080	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	13518409
45	NC_002693	CTTT	3	94118	94128	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	13518409
46	NC_002693	AGAT	3	100708	100718	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	13518409
47	NC_002693	TTTC	3	100976	100987	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	13518409
48	NC_002693	ATCC	3	109399	109410	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	13518409
49	NC_002693	TCTA	3	109794	109805	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	13518409
50	NC_002693	AAGG	3	109933	109943	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	13518409
51	NC_002693	GAGG	3	112670	112681	12	25 %	0 %	75 %	0 %	8 %	13518409
52	NC_002693	AGGT	3	112882	112893	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	13518409
53	NC_002693	TAAG	3	114002	114012	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	13518409
54	NC_002693	AAAT	3	117465	117475	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	13518409
55	NC_002693	ATAG	3	117964	117975	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	13518409
56	NC_002693	TTTG	4	119243	119257	15	0 %	75 %	25 %	0 %	6 %	13518409
57	NC_002693	AAAT	4	119264	119279	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	13518409
58	NC_002693	ACTA	3	119408	119418	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	13518409
59	NC_002693	TCTT	3	121128	121138	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	13518409
60	NC_002693	AAGA	3	121605	121616	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	13518409
61	NC_002693	ATGA	3	123114	123125	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	13518409
62	NC_002693	CTTT	3	125066	125077	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	13518409
63	NC_002693	AATC	3	126476	126487	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	13518409
64	NC_002693	CTTT	3	128827	128837	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	13518409
65	NC_002693	ATAC	3	131196	131207	12	50 %	25 %	0 %	25 %	0 %	13518409
66	NC_002693	TCTT	3	132187	132198	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	13518409
67	NC_002693	GTTT	3	134132	134143	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	13518409
68	NC_002693	GTTT	3	134153	134164	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	13518409
69	NC_002693	GTTT	3	134174	134185	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	13518409
70	NC_002693	GTTT	3	134195	134206	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	13518409
71	NC_002693	TCTA	3	137095	137106	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	13518409
72	NC_002693	ATTT	3	137596	137606	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	13518409
73	NC_002693	CATT	3	138017	138027	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	13518409
74	NC_002693	CTTA	3	141059	141069	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	13518409
75	NC_002693	GGAT	3	145661	145672	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	13518409
76	NC_002693	GAAA	3	154084	154095	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	164597847
77	NC_002693	CGAT	3	159175	159187	13	25 %	25 %	25 %	25 %	7 %	164597848
78	NC_002693	AAAG	3	160943	160953	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	164597848
79	NC_002693	AACG	3	160991	161002	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	164597848
80	NC_002693	CGAT	3	161463	161475	13	25 %	25 %	25 %	25 %	7 %	164597848

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tetra-nucleotide Imperfect Repeats of Oenothera elata subsp. hookeri plastid plastome I