ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Yarrowia lipolytica mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_002659	G	13	24	36	13	0 %	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_002659	G	13	24	36	13	0 %	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_002659	TTA	4	152	162	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
4	NC_002659	TAAT	3	574	585	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
5	NC_002659	TA	6	716	727	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_002659	ATA	4	1352	1364	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
7	NC_002659	AATT	3	1609	1620	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
8	NC_002659	AT	8	1993	2008	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
9	NC_002659	ATA	4	2233	2244	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
10	NC_002659	TTAA	3	2695	2705	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
11	NC_002659	AT	6	2837	2847	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
12	NC_002659	AAAT	3	2918	2928	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
13	NC_002659	TA	7	3022	3035	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
14	NC_002659	TA	6	3022	3033	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_002659	AAAATT	3	3123	3141	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
16	NC_002659	AAAT	3	3449	3460	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
17	NC_002659	AT	8	3779	3793	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
18	NC_002659	AT	7	3808	3823	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
19	NC_002659	AT	6	3808	3819	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_002659	AT	8	4753	4767	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
21	NC_002659	TA	6	5765	5775	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	30977393
22	NC_002659	AT	6	5776	5786	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	30977393
23	NC_002659	ATTA	3	5950	5961	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	30977393
24	NC_002659	TAT	4	6098	6109	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	30977393
25	NC_002659	ATA	4	6555	6566	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	30977393
26	NC_002659	AT	7	6633	6645	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	30977393
27	NC_002659	TA	6	6898	6908	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	30977393
28	NC_002659	TAAA	3	7029	7040	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	30977393
29	NC_002659	ATTA	4	7073	7088	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	30977393
30	NC_002659	ATTA	3	7073	7084	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	30977393
31	NC_002659	ATGTT	13	7080	7143	64	20 %	60 %	20 %	0 %	9 %	30977393
32	NC_002659	TATGT	10	7088	7137	50	20 %	60 %	20 %	0 %	0 %	30977393
33	NC_002659	TTAG	3	7656	7666	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	30977393
34	NC_002659	GTTC	3	7916	7927	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	30977393
35	NC_002659	ATT	4	7994	8005	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	30977393
36	NC_002659	TTC	4	8115	8126	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	30977393
37	NC_002659	AT	6	8429	8439	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	30977393
38	NC_002659	TTA	4	8595	8605	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
39	NC_002659	TAAA	3	8627	8638	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
40	NC_002659	TATAA	3	8703	8716	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
41	NC_002659	TAT	4	8740	8750	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
42	NC_002659	ATAAAG	3	8771	8787	17	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
43	NC_002659	ATA	4	8797	8809	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
44	NC_002659	TAT	4	8821	8833	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
45	NC_002659	ATAAAG	3	8849	8865	17	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
46	NC_002659	ATA	7	8926	8946	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
47	NC_002659	ATA	4	8930	8941	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_002659	AT	6	9300	9310	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
49	NC_002659	ATA	4	9348	9359	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
50	NC_002659	CAAA	3	9411	9422	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
51	NC_002659	ATA	4	10380	10391	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
52	NC_002659	ATATT	3	10393	10406	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
53	NC_002659	TAAAT	3	10715	10729	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
54	NC_002659	TAT	4	10739	10750	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
55	NC_002659	TAA	4	10785	10796	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_002659	TAA	4	10785	10796	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_002659	TTAT	3	10800	10811	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
58	NC_002659	TA	6	10923	10934	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
59	NC_002659	ACAAAT	3	11023	11040	18	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
60	NC_002659	TAA	5	11061	11075	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
61	NC_002659	TAA	4	11061	11072	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_002659	ATA	6	11245	11261	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
63	NC_002659	ATA	5	11247	11261	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_002659	AAT	4	11528	11539	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
65	NC_002659	AT	6	11574	11587	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
66	NC_002659	ATA	4	11634	11644	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
67	NC_002659	TAAA	4	11820	11836	17	75 %	25 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
68	NC_002659	A	17	11921	11937	17	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
69	NC_002659	A	12	11921	11932	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_002659	ATA	7	11990	12010	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
71	NC_002659	TA	16	12128	12158	31	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
72	NC_002659	TA	13	12131	12156	26	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_002659	ATTATA	3	12325	12343	19	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
74	NC_002659	AT	7	12546	12561	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
75	NC_002659	AT	6	12546	12557	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_002659	TA	10	12562	12580	19	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
77	NC_002659	AT	6	12689	12699	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
78	NC_002659	TA	6	12835	12845	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
79	NC_002659	AAAT	3	13102	13113	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
80	NC_002659	TTAA	4	14420	14435	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	30977393
81	NC_002659	TTAA	3	14420	14431	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	30977393
82	NC_002659	TAAATA	9	14507	14560	54	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	30977393
83	NC_002659	TAAATA	7	14507	14548	42	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	30977393
84	NC_002659	AT	7	14615	14627	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	30977393
85	NC_002659	AAAT	3	15003	15014	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	30977393
86	NC_002659	AAAT	3	15003	15014	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	30977393
87	NC_002659	ATTTT	3	15022	15036	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	30977393
88	NC_002659	CATAT	3	15462	15475	14	40 %	40 %	0 %	20 %	7 %	30977393
89	NC_002659	AT	13	15885	15909	25	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	30977393
90	NC_002659	AT	8	15888	15903	16	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	30977393
91	NC_002659	TTTA	3	15970	15982	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	30977393
92	NC_002659	ATTAAT	3	16157	16174	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	30977393
93	NC_002659	ATT	4	16269	16280	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	30977393
94	NC_002659	AT	9	17431	17448	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	30977393
95	NC_002659	AT	8	17431	17446	16	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	30977393
96	NC_002659	TTA	4	17664	17675	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	30977393
97	NC_002659	TTA	4	17664	17675	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	30977393
98	NC_002659	GGT	4	17754	17765	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	30977393
99	NC_002659	ATT	4	18208	18219	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	30977393
100	NC_002659	TAT	4	18528	18538	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	30977393
101	NC_002659	AAAT	3	18604	18614	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	30977393
102	NC_002659	AT	7	18895	18909	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	30977393
103	NC_002659	AT	7	18895	18908	14	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	30977393
104	NC_002659	AT	6	18911	18921	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	30977393
105	NC_002659	ATA	4	18948	18959	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	30977393
106	NC_002659	TAA	4	19106	19116	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	30977393
107	NC_002659	TATT	3	19117	19128	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	30977393
108	NC_002659	TAA	4	19252	19263	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	30977393
109	NC_002659	TA	6	19285	19295	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	30977393
110	NC_002659	AT	7	19377	19390	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	30977393
111	NC_002659	AT	6	19377	19388	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	30977393
112	NC_002659	AT	6	19462	19474	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	30977393
113	NC_002659	AT	6	19551	19561	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	30977393
114	NC_002659	TAA	6	19634	19650	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	30977393
115	NC_002659	TAT	4	19738	19748	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	30977393
116	NC_002659	ATA	5	19866	19881	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	30977393
117	NC_002659	TAA	4	19978	19988	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	30977393
118	NC_002659	AAAT	3	20056	20066	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	30977393
119	NC_002659	AATT	3	20074	20085	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	30977393
120	NC_002659	TAA	4	20188	20200	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	30977393
121	NC_002659	ATA	4	20263	20273	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	30977393
122	NC_002659	AATT	3	20277	20289	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	30977393
123	NC_002659	TA	6	20304	20315	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	30977393
124	NC_002659	AAATT	3	20547	20560	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	30977393
125	NC_002659	TA	6	20625	20635	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	30977393
126	NC_002659	ATA	4	20637	20649	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	30977393
127	NC_002659	TA	6	20985	20995	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	30977393
128	NC_002659	ATTT	3	21023	21034	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	30977393
129	NC_002659	AT	6	21053	21063	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	30977393
130	NC_002659	AATT	3	21348	21359	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	30977393
131	NC_002659	TAT	4	21435	21446	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	30977393
132	NC_002659	AGA	4	21712	21722	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	30977393
133	NC_002659	TTTA	3	22068	22078	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	30977393
134	NC_002659	A	12	22691	22702	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	30977393
135	NC_002659	AAAT	3	22789	22799	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	30977393
136	NC_002659	TAA	4	22843	22854	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	30977393
137	NC_002659	TA	6	23243	23254	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	30977393
138	NC_002659	TTA	4	23439	23450	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	30977393
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168	NC_002659	AT	6	27492	27503	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_002659	TTAT	3	27506	27517	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
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172	NC_002659	AAAC	3	27746	27756	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
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273	NC_002659	AT	6	47716	47727	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Yarrowia lipolytica mitochondrion