ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Candida albicans SC5314 mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_002653	ATA	4	60	70	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_002653	ATA	4	201	212	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_002653	CTA	4	274	285	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
4	NC_002653	GTCA	3	452	463	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
5	NC_002653	TA	6	487	497	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
6	NC_002653	AT	6	1316	1328	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
7	NC_002653	TA	8	1744	1758	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
8	NC_002653	CATT	3	1867	1879	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
9	NC_002653	AGTA	3	2024	2035	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
10	NC_002653	TAA	4	2218	2228	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
11	NC_002653	ATG	4	2341	2352	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
12	NC_002653	TA	6	2715	2726	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
13	NC_002653	ATA	4	3111	3122	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
14	NC_002653	TAT	4	3516	3527	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	32567804
15	NC_002653	GTT	4	3768	3778	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	32567804
16	NC_002653	AATT	3	4584	4594	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	32567794
17	NC_002653	TAG	4	5221	5232	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	32567794
18	NC_002653	AATT	3	5403	5414	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	32567794
19	NC_002653	TAT	5	5599	5612	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
20	NC_002653	TTATCT	3	5695	5712	18	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
21	NC_002653	CT	7	6389	6401	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
22	NC_002653	TC	6	6921	6932	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
23	NC_002653	CT	6	7228	7238	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
24	NC_002653	TAT	5	7376	7389	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
25	NC_002653	TA	7	7416	7428	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
26	NC_002653	TTATAT	3	7651	7668	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
27	NC_002653	TA	7	7859	7873	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
28	NC_002653	TCTA	3	8630	8641	12	25 %	50 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_002653	CCA	4	8934	8944	11	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
30	NC_002653	TATT	3	9058	9069	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_002653	ATA	4	9241	9251	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
32	NC_002653	ATTAAC	3	9486	9502	17	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
33	NC_002653	TAAT	3	9585	9596	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
34	NC_002653	TA	6	9774	9785	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
35	NC_002653	TA	7	9953	9966	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	32567795
36	NC_002653	TAA	4	10301	10311	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	32567795
37	NC_002653	AT	6	11318	11328	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
38	NC_002653	AT	10	11356	11374	19	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
39	NC_002653	GTATA	4	11423	11441	19	40 %	40 %	20 %	0 %	10 %	Non-Coding
40	NC_002653	TA	8	12051	12065	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
41	NC_002653	ATT	4	12147	12157	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
42	NC_002653	TATCTA	3	12240	12257	18	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
43	NC_002653	TAT	4	12310	12320	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
44	NC_002653	ATA	4	12480	12491	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	12585569
45	NC_002653	ACTA	3	13525	13535	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	32567796
46	NC_002653	ATA	4	13832	13842	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	32567797
47	NC_002653	TAAAA	3	13909	13923	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
48	NC_002653	GTAG	3	14566	14576	11	25 %	25 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
49	NC_002653	TTAC	3	15019	15029	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
50	NC_002653	TAT	4	17438	17450	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
51	NC_002653	AT	6	17466	17476	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
52	NC_002653	GGTC	3	17907	17917	11	0 %	25 %	50 %	25 %	9 %	Non-Coding
53	NC_002653	TAA	4	17981	17992	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
54	NC_002653	AAT	5	18243	18257	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
55	NC_002653	TAA	4	18485	18499	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
56	NC_002653	ATA	4	19591	19601	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
57	NC_002653	ATT	4	19841	19852	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
58	NC_002653	AT	6	20147	20157	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
59	NC_002653	AT	9	20172	20189	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
60	NC_002653	AT	6	20198	20208	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
61	NC_002653	AATC	3	20372	20382	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
62	NC_002653	TAAA	3	20545	20557	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
63	NC_002653	ATT	4	20577	20589	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
64	NC_002653	AT	6	21102	21113	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
65	NC_002653	AATA	3	21746	21757	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	32567798
66	NC_002653	TAT	4	21951	21962	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	32567798
67	NC_002653	ATTT	3	22189	22200	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	32567798
68	NC_002653	ATT	4	22225	22236	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	32567798
69	NC_002653	TAA	5	22711	22725	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	32567798
70	NC_002653	TAA	4	22782	22793	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	32567798
71	NC_002653	AAT	5	23106	23120	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	32567799
72	NC_002653	TTC	4	23402	23416	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
73	NC_002653	TA	6	23532	23542	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
74	NC_002653	AT	6	23561	23572	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
75	NC_002653	TA	7	23632	23644	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
76	NC_002653	TA	8	23672	23686	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
77	NC_002653	TTAA	3	24418	24430	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
78	NC_002653	ATG	4	24584	24594	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
79	NC_002653	ATA	5	24824	24837	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
80	NC_002653	AAGTTA	3	25054	25070	17	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
81	NC_002653	TAA	5	25313	25327	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
82	NC_002653	ATA	4	25469	25482	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
83	NC_002653	TTA	4	26543	26553	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
84	NC_002653	AGTA	3	26748	26758	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
85	NC_002653	AT	7	27079	27093	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
86	NC_002653	TAT	4	27115	27125	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
87	NC_002653	TA	6	27339	27349	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
88	NC_002653	TA	6	27378	27388	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
89	NC_002653	ACT	4	27643	27654	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
90	NC_002653	AT	6	28175	28185	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
91	NC_002653	ATA	4	28455	28466	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
92	NC_002653	TTATAC	3	28719	28736	18	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
93	NC_002653	TACC	3	29105	29116	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
94	NC_002653	CCT	4	29525	29536	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
95	NC_002653	CATT	3	29555	29565	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
96	NC_002653	TAT	4	29649	29660	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	32567800
97	NC_002653	AT	6	29700	29710	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	32567800
98	NC_002653	ATT	4	29729	29740	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	32567800
99	NC_002653	TA	7	29834	29846	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	32567801
100	NC_002653	TATAT	4	30028	30046	19	40 %	60 %	0 %	0 %	10 %	32567801
101	NC_002653	AT	6	30477	30487	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	32567801
102	NC_002653	TCACTA	3	31119	31137	19	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	5 %	32567801
103	NC_002653	GTATAT	4	31234	31257	24	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	8 %	32567801
104	NC_002653	TTATAT	3	31462	31480	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10 %	32567801
105	NC_002653	AT	6	32083	32093	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
106	NC_002653	ATT	4	32356	32366	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	32567802
107	NC_002653	ATC	4	33084	33095	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	32567802
108	NC_002653	TAT	4	33097	33109	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	32567802
109	NC_002653	TA	6	33465	33475	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	32567802
110	NC_002653	TAGATA	3	33703	33720	18	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
111	NC_002653	AAT	4	33803	33813	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
112	NC_002653	TA	10	33896	33914	19	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
113	NC_002653	TATAC	4	34519	34537	19	40 %	40 %	0 %	20 %	10 %	Non-Coding
114	NC_002653	ACCC	3	34998	35009	12	25 %	0 %	0 %	75 %	8 %	Non-Coding
115	NC_002653	TTCA	3	35294	35306	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	32567803
116	NC_002653	TAT	4	35647	35657	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	32567803
117	NC_002653	TA	6	35998	36010	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	32567803
118	NC_002653	GTTAAT	3	36458	36474	17	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
119	NC_002653	TAT	4	36711	36721	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
120	NC_002653	ATAG	3	37318	37329	12	50 %	25 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_002653	TCTA	3	37533	37543	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
122	NC_002653	TATC	3	38060	38070	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
123	NC_002653	TA	7	38090	38105	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
124	NC_002653	GGGT	3	38333	38345	13	0 %	25 %	75 %	0 %	7 %	Non-Coding
125	NC_002653	TA	7	38532	38544	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
126	NC_002653	ATA	4	38576	38588	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
127	NC_002653	AG	6	38722	38732	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
128	NC_002653	GTAT	3	38771	38781	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
129	NC_002653	AGT	4	39247	39257	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
130	NC_002653	AATA	3	39264	39275	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
131	NC_002653	TAGAA	4	40152	40170	19	60 %	20 %	20 %	0 %	10 %	Non-Coding
132	NC_002653	ATA	5	40262	40276	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
133	NC_002653	ATA	6	40350	40366	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

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