ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Hexa-nucleotide Imperfect Repeats of Euglena longa plastid

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_002652	TTAATT	3	2177	2195	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
2	NC_002652	TATTTT	3	7980	7997	18	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	12545416
3	NC_002652	ATTTAG	3	13671	13689	19	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	10 %	Non-Coding
4	NC_002652	AAATAT	3	14227	14245	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
5	NC_002652	TTATAT	3	15553	15570	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	12545425
6	NC_002652	TTTTGA	3	17759	17776	18	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	0 %	12545427
7	NC_002652	ATTTTT	3	18618	18636	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
8	NC_002652	TTTATT	3	19435	19452	18	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
9	NC_002652	TTTTAA	3	21048	21066	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
10	NC_002652	TATATT	3	22893	22909	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	12545436
11	NC_002652	TATTTT	3	24479	24495	17	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	12545437
12	NC_002652	AAATTT	3	27867	27884	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	12545438
13	NC_002652	AAAATT	3	28444	28462	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10 %	12545439
14	NC_002652	TTTAAT	4	29208	29231	24	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	12545440
15	NC_002652	AAATGA	3	31885	31902	18	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	5 %	12545444
16	NC_002652	AAATAA	3	32888	32906	19	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	10 %	12545445
17	NC_002652	AATAAA	3	34260	34277	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	12545447
18	NC_002652	TAAAAA	3	35095	35113	19	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	10 %	12545448
19	NC_002652	TAAAAA	3	35717	35734	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	12545449
20	NC_002652	TATCAC	4	39786	39809	24	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	12545451
21	NC_002652	TCTGAA	7	39965	40006	42	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	9 %	12545451
22	NC_002652	AGTAGA	7	40057	40098	42	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	9 %	12545451
23	NC_002652	ATACCA	3	46699	46716	18	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	5 %	Non-Coding
24	NC_002652	CTACCT	3	52390	52407	18	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_002652	ATTTTA	3	66761	66778	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	12545456
26	NC_002652	TTTTAT	3	67193	67210	18	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	12545456
27	NC_002652	TTTTTA	3	68239	68256	18	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	12545457
28	NC_002652	TTTAAT	3	69645	69663	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10 %	12545457
29	NC_002652	TTTTAA	3	70025	70041	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	12545457

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Hexa-nucleotide Imperfect Repeats of Euglena longa plastid