ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

All Imperfect Repeats of Euglena longa plastid

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_002652ATTGA38221540 %40 %20 %0 %0 %Non-Coding
2NC_002652AATA31691791175 %25 %0 %0 %9 %Non-Coding
3NC_002652TTTAT31841981520 %80 %0 %0 %6 %Non-Coding
4NC_002652T14684697140 %100 %0 %0 %7 %Non-Coding
5NC_002652ATTT37017121225 %75 %0 %0 %0 %Non-Coding
6NC_002652T12850861120 %100 %0 %0 %8 %Non-Coding
7NC_002652AT9119012061750 %50 %0 %0 %5 %Non-Coding
8NC_002652T1412801293140 %100 %0 %0 %0 %Non-Coding
9NC_002652T1214281439120 %100 %0 %0 %0 %Non-Coding
10NC_002652TATT4169617111625 %75 %0 %0 %6 %Non-Coding
11NC_002652AT6181418241150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
12NC_002652TTAATT3217721951933.33 %66.67 %0 %0 %10 %Non-Coding
13NC_002652TA6224122511150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
14NC_002652TA9259026071850 %50 %0 %0 %5 %12545413
15NC_002652T2126062626210 %100 %0 %0 %4 %12545413
16NC_002652TTA4269827101333.33 %66.67 %0 %0 %7 %12545413
17NC_002652TTTA3336633761125 %75 %0 %0 %9 %12545413
18NC_002652TTTA3360336131125 %75 %0 %0 %9 %12545413
19NC_002652ATTTT3477547891520 %80 %0 %0 %6 %12545413
20NC_002652ACAT3486448751250 %25 %0 %25 %8 %12545413
21NC_002652TTTA3523752481225 %75 %0 %0 %8 %12545413
22NC_002652TAA4550055121366.67 %33.33 %0 %0 %7 %12545413
23NC_002652ATT4566756771133.33 %66.67 %0 %0 %9 %12545413
24NC_002652TAGA3616061701150 %25 %25 %0 %9 %12545413
25NC_002652TA6645064621350 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
26NC_002652TAAA3742074301175 %25 %0 %0 %9 %12545415
27NC_002652ATTT4756975831525 %75 %0 %0 %6 %Non-Coding
28NC_002652ATT4763176421233.33 %66.67 %0 %0 %8 %12545416
29NC_002652TGT476957705110 %66.67 %33.33 %0 %9 %12545416
30NC_002652TTA4783778481233.33 %66.67 %0 %0 %8 %12545416
31NC_002652TATTTT3798079971816.67 %83.33 %0 %0 %5 %12545416
32NC_002652TTGT383328343120 %75 %25 %0 %0 %12545416
33NC_002652ATTT3837183821225 %75 %0 %0 %0 %12545416
34NC_002652TA6846384731150 %50 %0 %0 %9 %12545416
35NC_002652ATTTT3859986121420 %80 %0 %0 %7 %12545416
36NC_002652TAT4899390051333.33 %66.67 %0 %0 %7 %12545418
37NC_002652AAAT3909291021175 %25 %0 %0 %9 %12545418
38NC_002652GGTT391769188130 %50 %50 %0 %7 %12545418
39NC_002652AATT3920692161150 %50 %0 %0 %9 %12545418
40NC_002652TTTG396899699110 %75 %25 %0 %9 %Non-Coding
41NC_002652TTAAT510377103992340 %60 %0 %0 %8 %12545419
42NC_002652AAAT310429104401275 %25 %0 %0 %0 %12545419
43NC_002652ATA410718107291266.67 %33.33 %0 %0 %8 %12545419
44NC_002652TATTT310935109481420 %80 %0 %0 %7 %12545419
45NC_002652TA611782117921150 %50 %0 %0 %9 %12545421
46NC_002652TTAA312017120281250 %50 %0 %0 %8 %12545422
47NC_002652ATTT412054120691625 %75 %0 %0 %6 %12545422
48NC_002652TTA412128121391233.33 %66.67 %0 %0 %8 %12545422
49NC_002652TAT412221122311133.33 %66.67 %0 %0 %9 %12545422
50NC_002652TTTA312477124891325 %75 %0 %0 %7 %12545422
51NC_002652AAAT312523125341275 %25 %0 %0 %8 %12545422
52NC_002652TTA412590126011233.33 %66.67 %0 %0 %8 %12545422
53NC_002652TTAT312725127351125 %75 %0 %0 %9 %12545422
54NC_002652ATTTT312837128501420 %80 %0 %0 %7 %12545422
55NC_002652TA612892129031250 %50 %0 %0 %8 %12545422
56NC_002652ATTT312907129191325 %75 %0 %0 %7 %12545422
57NC_002652TTTG31329913310120 %75 %25 %0 %0 %12545422
58NC_002652ATTTAG313671136891933.33 %50 %16.67 %0 %10 %Non-Coding
59NC_002652AAATAT314227142451966.67 %33.33 %0 %0 %10 %Non-Coding
60NC_002652TTAA314389144001250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
61NC_002652TTAA314437144471150 %50 %0 %0 %9 %12545424
62NC_002652ATTTT314694147081520 %80 %0 %0 %0 %12545424
63NC_002652AT714768147811450 %50 %0 %0 %7 %12545424
64NC_002652TTTAA314809148221440 %60 %0 %0 %7 %12545424
65NC_002652TTTA314843148541225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
66NC_002652TAA414994150051266.67 %33.33 %0 %0 %8 %12545425
67NC_002652TAT415397154081233.33 %66.67 %0 %0 %8 %12545425
68NC_002652TTATAT315553155701833.33 %66.67 %0 %0 %5 %12545425
69NC_002652AAAAT315805158201680 %20 %0 %0 %6 %Non-Coding
70NC_002652AAAT316222162321175 %25 %0 %0 %9 %12545426
71NC_002652TAAAA316685166991580 %20 %0 %0 %6 %Non-Coding
72NC_002652A14169221693514100 %0 %0 %0 %7 %Non-Coding
73NC_002652TAT417395174061233.33 %66.67 %0 %0 %8 %12545427
74NC_002652TTTTGA317759177761816.67 %66.67 %16.67 %0 %0 %12545427
75NC_002652TAAA317838178491275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
76NC_002652ATT417860178711233.33 %66.67 %0 %0 %0 %Non-Coding
77NC_002652ATTA318287182971150 %50 %0 %0 %9 %12545429
78NC_002652T161843618451160 %100 %0 %0 %6 %12545429
79NC_002652ATTTT318597186101420 %80 %0 %0 %7 %12545429
80NC_002652ATTTTT318618186361916.67 %83.33 %0 %0 %10 %Non-Coding
81NC_002652AGTT319352193631225 %50 %25 %0 %8 %Non-Coding
82NC_002652TTTA319394194041125 %75 %0 %0 %9 %Non-Coding
83NC_002652TTTATT319435194521816.67 %83.33 %0 %0 %5 %Non-Coding
84NC_002652AT619698197081150 %50 %0 %0 %9 %12545431
85NC_002652TAATT319824198371440 %60 %0 %0 %7 %12545431
86NC_002652AT720003200161450 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
87NC_002652AT720108201201350 %50 %0 %0 %7 %12545432
88NC_002652AAAT320332203421175 %25 %0 %0 %9 %12545432
89NC_002652TAA420353203631166.67 %33.33 %0 %0 %9 %12545432
90NC_002652ATA420436204481366.67 %33.33 %0 %0 %7 %12545432
91NC_002652TTTA320493205041225 %75 %0 %0 %8 %12545432
92NC_002652TAT420743207531133.33 %66.67 %0 %0 %9 %12545433
93NC_002652TTTTAA321048210661933.33 %66.67 %0 %0 %10 %Non-Coding
94NC_002652ATATT321068210821540 %60 %0 %0 %6 %Non-Coding
95NC_002652TTTG32121021221120 %75 %25 %0 %8 %Non-Coding
96NC_002652TTA521232212471633.33 %66.67 %0 %0 %6 %Non-Coding
97NC_002652AT721522215341350 %50 %0 %0 %7 %12545434
98NC_002652ATA421623216351366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
99NC_002652TTAA321803218141250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
100NC_002652AATT321844218551250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
101NC_002652TTTA322161221721225 %75 %0 %0 %8 %12545435
102NC_002652TAA422224222341166.67 %33.33 %0 %0 %9 %12545435
103NC_002652TGG42258122592120 %33.33 %66.67 %0 %8 %12545435
104NC_002652TATATT322893229091733.33 %66.67 %0 %0 %5 %12545436
105NC_002652ATA423138231501366.67 %33.33 %0 %0 %7 %12545436
106NC_002652TAT423151231631333.33 %66.67 %0 %0 %7 %12545436
107NC_002652TTA423384233951233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
108NC_002652ATTT323419234301225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
109NC_002652ATTT323605236161225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
110NC_002652TTTTA324061240761620 %80 %0 %0 %6 %Non-Coding
111NC_002652TATTTT324479244951716.67 %83.33 %0 %0 %5 %12545437
112NC_002652TTTA324691247021225 %75 %0 %0 %8 %12545437
113NC_002652ATT525239252531533.33 %66.67 %0 %0 %6 %12545437
114NC_002652AATT525555255731950 %50 %0 %0 %10 %12545438
115NC_002652AT625622256351450 %50 %0 %0 %7 %12545438
116NC_002652TAT425643256551333.33 %66.67 %0 %0 %7 %12545438
117NC_002652TTAA325826258371250 %50 %0 %0 %8 %12545438
118NC_002652ATTT325981259911125 %75 %0 %0 %9 %12545438
119NC_002652T122609226103120 %100 %0 %0 %8 %12545438
120NC_002652TTAA326531265431350 %50 %0 %0 %7 %12545438
121NC_002652AATT326627266391350 %50 %0 %0 %7 %12545438
122NC_002652AATT326751267611150 %50 %0 %0 %9 %12545438
123NC_002652ATTT326997270081225 %75 %0 %0 %0 %12545438
124NC_002652TA627068270781150 %50 %0 %0 %9 %12545438
125NC_002652ATGA327201272111150 %25 %25 %0 %9 %12545438
126NC_002652ATTT327803278141225 %75 %0 %0 %8 %12545438
127NC_002652ATTT327853278631125 %75 %0 %0 %9 %12545438
128NC_002652AAATTT327867278841850 %50 %0 %0 %5 %12545438
129NC_002652ATT428163281741233.33 %66.67 %0 %0 %8 %12545439
130NC_002652ATTT528178281982125 %75 %0 %0 %9 %12545439
131NC_002652AAAATT328444284621966.67 %33.33 %0 %0 %10 %12545439
132NC_002652TTTA328538285481125 %75 %0 %0 %9 %12545439
133NC_002652TA828670286841550 %50 %0 %0 %6 %12545439
134NC_002652TTA428722287321133.33 %66.67 %0 %0 %9 %12545439
135NC_002652TAT429008290191233.33 %66.67 %0 %0 %8 %12545439
136NC_002652TTTAAT429208292312433.33 %66.67 %0 %0 %8 %12545440
137NC_002652TTTAA329271292851540 %60 %0 %0 %6 %12545440
138NC_002652ATA429427294391366.67 %33.33 %0 %0 %7 %12545440
139NC_002652ATA429585295951166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
140NC_002652AAAAT429649296692180 %20 %0 %0 %9 %Non-Coding
141NC_002652ATTT330080300901125 %75 %0 %0 %9 %12545441
142NC_002652ATTT430123301381625 %75 %0 %0 %6 %Non-Coding
143NC_002652ATCT330145301561225 %50 %0 %25 %8 %Non-Coding
144NC_002652AAAT330575305851175 %25 %0 %0 %9 %12545442
145NC_002652ATATG330820308331440 %40 %20 %0 %7 %12545442
146NC_002652TA631051310611150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
147NC_002652AAAT331099311101275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
148NC_002652AAAT431139311541675 %25 %0 %0 %6 %Non-Coding
149NC_002652ATT431367313781233.33 %66.67 %0 %0 %8 %12545443
150NC_002652ATAA431419314341675 %25 %0 %0 %0 %12545443
151NC_002652AAATGA331885319021866.67 %16.67 %16.67 %0 %5 %12545444
152NC_002652TTA431903319131133.33 %66.67 %0 %0 %9 %12545444
153NC_002652TAA432373323831166.67 %33.33 %0 %0 %9 %12545445
154NC_002652AAATAA332888329061983.33 %16.67 %0 %0 %10 %12545445
155NC_002652AT633170331811250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
156NC_002652TAA533383333981666.67 %33.33 %0 %0 %6 %12545446
157NC_002652TAT433642336531233.33 %66.67 %0 %0 %8 %12545446
158NC_002652AT634174341851250 %50 %0 %0 %8 %12545447
159NC_002652AATAAA334260342771883.33 %16.67 %0 %0 %5 %12545447
160NC_002652AAAG334796348071275 %0 %25 %0 %8 %12545448
161NC_002652ATA434944349541166.67 %33.33 %0 %0 %9 %12545448
162NC_002652AAAC335049350591175 %0 %0 %25 %9 %12545448
163NC_002652TAAAAA335095351131983.33 %16.67 %0 %0 %10 %12545448
164NC_002652AAAT335123351341275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
165NC_002652TAAAAA335717357341883.33 %16.67 %0 %0 %5 %12545449
166NC_002652AATT335735357451150 %50 %0 %0 %9 %12545449
167NC_002652TAAAA335767357811580 %20 %0 %0 %6 %12545449
168NC_002652ATA536548365621566.67 %33.33 %0 %0 %6 %12545449
169NC_002652AAAT336605366161275 %25 %0 %0 %8 %12545449
170NC_002652ATA437502375121166.67 %33.33 %0 %0 %9 %12545450
171NC_002652AAATC337759377721460 %20 %0 %20 %7 %12545450
172NC_002652AATT337850378601150 %50 %0 %0 %9 %12545450
173NC_002652AAAT338034380451275 %25 %0 %0 %0 %12545450
174NC_002652TAAC338471384821250 %25 %0 %25 %8 %12545450
175NC_002652ATA838880389032466.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
176NC_002652AACT338910389201150 %25 %0 %25 %9 %Non-Coding
177NC_002652AATA339686396961175 %25 %0 %0 %9 %12545451
178NC_002652TATCAC439786398092433.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %12545451
179NC_002652TCTGAA739965400064233.33 %33.33 %16.67 %16.67 %9 %12545451
180NC_002652AGA540048400621566.67 %0 %33.33 %0 %6 %12545451
181NC_002652AGTAGA740057400984250 %16.67 %33.33 %0 %9 %12545451
182NC_002652ATC440444404551233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %12545451
183NC_002652TAAA340954409651275 %25 %0 %0 %8 %12545451
184NC_002652ACAT343200432121350 %25 %0 %25 %7 %Non-Coding
185NC_002652TTA443526435361133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
186NC_002652TTAA344303443151350 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
187NC_002652AAAT444337443521675 %25 %0 %0 %6 %Non-Coding
188NC_002652TAAA344353443631175 %25 %0 %0 %9 %Non-Coding
189NC_002652TAA445724457351266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
190NC_002652TA1145906459262150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
191NC_002652ATACCA346699467161850 %16.67 %0 %33.33 %5 %Non-Coding
192NC_002652TCT84677246794230 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
193NC_002652TAA546835468491566.67 %33.33 %0 %0 %6 %Non-Coding
194NC_002652TAA446868468781166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
195NC_002652ACAT348688487001350 %25 %0 %25 %7 %Non-Coding
196NC_002652ATAA348788487981175 %25 %0 %0 %9 %Non-Coding
197NC_002652AATT350523505341250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
198NC_002652TCCTC35090650919140 %40 %0 %60 %7 %Non-Coding
199NC_002652TAA451064510751266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
200NC_002652TA751246512591450 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
201NC_002652TAA452285522961266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
202NC_002652TAAA352321523311175 %25 %0 %0 %9 %Non-Coding
203NC_002652CTACCT352390524071816.67 %33.33 %0 %50 %0 %Non-Coding
204NC_002652ATA452543525531166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
205NC_002652ACAT354100541121350 %25 %0 %25 %7 %Non-Coding
206NC_002652ATAA354200542101175 %25 %0 %0 %9 %Non-Coding
207NC_002652TTA454426544361133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
208NC_002652AATT356025560361250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
209NC_002652TCCTC35640856421140 %40 %0 %60 %7 %Non-Coding
210NC_002652TAA456568565791266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
211NC_002652TA756750567631450 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
212NC_002652TCCTC35815258165140 %40 %0 %60 %7 %Non-Coding
213NC_002652TAA458310583211266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
214NC_002652TA758492585051450 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
215NC_002652TA1159659596792150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
216NC_002652TA1159787598072150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
217NC_002652TA1159915599352150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
218NC_002652TA1260043600652350 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
219NC_002652TA1160173601932150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
220NC_002652TAAA460316603311675 %25 %0 %0 %6 %Non-Coding
221NC_002652AAT560326603411666.67 %33.33 %0 %0 %6 %Non-Coding
222NC_002652ATA460363603741266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
223NC_002652AATT560371603902050 %50 %0 %0 %5 %Non-Coding
224NC_002652TA760571605841450 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
225NC_002652TATT360925609361225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
226NC_002652T166096760982160 %100 %0 %0 %6 %Non-Coding
227NC_002652AATT361189612001250 %50 %0 %0 %8 %12545452
228NC_002652TAT461619616291133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
229NC_002652ATCT362562625731225 %50 %0 %25 %8 %12545454
230NC_002652TTAA363441634521250 %50 %0 %0 %8 %12545455
231NC_002652AT663477634881250 %50 %0 %0 %8 %12545455
232NC_002652ATA463948639591266.67 %33.33 %0 %0 %8 %12545455
233NC_002652TTATT363960639731420 %80 %0 %0 %7 %Non-Coding
234NC_002652ATCT364045640561225 %50 %0 %25 %8 %Non-Coding
235NC_002652ATTT364339643501225 %75 %0 %0 %8 %12545456
236NC_002652TAA465190652011266.67 %33.33 %0 %0 %8 %12545456
237NC_002652ATTT365202652121125 %75 %0 %0 %9 %12545456
238NC_002652ATTT365286652961125 %75 %0 %0 %9 %12545456
239NC_002652T156550365517150 %100 %0 %0 %6 %12545456
240NC_002652TAAA365593656031175 %25 %0 %0 %9 %12545456
241NC_002652ATTTTA366761667781833.33 %66.67 %0 %0 %5 %12545456
242NC_002652ATA466851668611166.67 %33.33 %0 %0 %9 %12545456
243NC_002652TTAT366903669131125 %75 %0 %0 %9 %12545456
244NC_002652ATT667095671111733.33 %66.67 %0 %0 %5 %12545456
245NC_002652TTTTAT367193672101816.67 %83.33 %0 %0 %5 %12545456
246NC_002652T126720467215120 %100 %0 %0 %8 %12545456
247NC_002652TTCT36757967589110 %75 %0 %25 %9 %12545456
248NC_002652ATTT367753677641225 %75 %0 %0 %8 %12545456
249NC_002652AT667859678691150 %50 %0 %0 %9 %12545456
250NC_002652TTATA367925679391540 %60 %0 %0 %0 %Non-Coding
251NC_002652TTTTTA368239682561816.67 %83.33 %0 %0 %5 %12545457
252NC_002652ATTT368257682681225 %75 %0 %0 %8 %12545457
253NC_002652TA668398684081150 %50 %0 %0 %9 %12545457
254NC_002652ATT468435684451133.33 %66.67 %0 %0 %9 %12545457
255NC_002652AT668480684901150 %50 %0 %0 %9 %12545457
256NC_002652AT669030690401150 %50 %0 %0 %9 %12545457
257NC_002652GTTT36904169051110 %75 %25 %0 %9 %12545457
258NC_002652TAA469067690781266.67 %33.33 %0 %0 %8 %12545457
259NC_002652TAT469098691081133.33 %66.67 %0 %0 %9 %12545457
260NC_002652TATT369623696331125 %75 %0 %0 %9 %12545457
261NC_002652TTTAAT369645696631933.33 %66.67 %0 %0 %10 %12545457
262NC_002652TTTTAA370025700411733.33 %66.67 %0 %0 %5 %12545457
263NC_002652AT670710707221350 %50 %0 %0 %7 %12545457
264NC_002652TA871019710331550 %50 %0 %0 %6 %12545457
265NC_002652AT971163711791750 %50 %0 %0 %5 %12545457
266NC_002652T137139771409130 %100 %0 %0 %7 %12545412
267NC_002652T127213572146120 %100 %0 %0 %0 %12545412
268NC_002652ATTT372175721851125 %75 %0 %0 %9 %12545412
269NC_002652AAATT372519725321460 %40 %0 %0 %7 %Non-Coding
270NC_002652TAAA372621726311175 %25 %0 %0 %9 %Non-Coding
271NC_002652TTTA472633726491725 %75 %0 %0 %5 %Non-Coding
272NC_002652AAATT472659726782060 %40 %0 %0 %5 %Non-Coding
273NC_002652TTTTA373057730711520 %80 %0 %0 %6 %Non-Coding
274NC_002652TAT473139731501233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding