ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Euglena longa plastid

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_002652	TTA	4	2698	2710	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	12545413
2	NC_002652	TAA	4	5500	5512	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	12545413
3	NC_002652	ATT	4	5667	5677	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	12545413
4	NC_002652	ATT	4	7631	7642	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	12545416
5	NC_002652	TGT	4	7695	7705	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	12545416
6	NC_002652	TTA	4	7837	7848	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	12545416
7	NC_002652	TAT	4	8993	9005	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	12545418
8	NC_002652	ATA	4	10718	10729	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	12545419
9	NC_002652	TTA	4	12128	12139	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	12545422
10	NC_002652	TAT	4	12221	12231	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	12545422
11	NC_002652	TTA	4	12590	12601	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	12545422
12	NC_002652	TAA	4	14994	15005	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	12545425
13	NC_002652	TAT	4	15397	15408	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	12545425
14	NC_002652	TAT	4	17395	17406	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	12545427
15	NC_002652	ATT	4	17860	17871	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_002652	TAA	4	20353	20363	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	12545432
17	NC_002652	ATA	4	20436	20448	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	12545432
18	NC_002652	TAT	4	20743	20753	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	12545433
19	NC_002652	TTA	5	21232	21247	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
20	NC_002652	ATA	4	21623	21635	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
21	NC_002652	TAA	4	22224	22234	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	12545435
22	NC_002652	TGG	4	22581	22592	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	12545435
23	NC_002652	ATA	4	23138	23150	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	12545436
24	NC_002652	TAT	4	23151	23163	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	12545436
25	NC_002652	TTA	4	23384	23395	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
26	NC_002652	ATT	5	25239	25253	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	12545437
27	NC_002652	TAT	4	25643	25655	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	12545438
28	NC_002652	ATT	4	28163	28174	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	12545439
29	NC_002652	TTA	4	28722	28732	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	12545439
30	NC_002652	TAT	4	29008	29019	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	12545439
31	NC_002652	ATA	4	29427	29439	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	12545440
32	NC_002652	ATA	4	29585	29595	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
33	NC_002652	ATT	4	31367	31378	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	12545443
34	NC_002652	TTA	4	31903	31913	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	12545444
35	NC_002652	TAA	4	32373	32383	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	12545445
36	NC_002652	TAA	5	33383	33398	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	12545446
37	NC_002652	TAT	4	33642	33653	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	12545446
38	NC_002652	ATA	4	34944	34954	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	12545448
39	NC_002652	ATA	5	36548	36562	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	12545449
40	NC_002652	ATA	4	37502	37512	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	12545450
41	NC_002652	ATA	8	38880	38903	24	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
42	NC_002652	AGA	5	40048	40062	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	12545451
43	NC_002652	ATC	4	40444	40455	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	12545451
44	NC_002652	TTA	4	43526	43536	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
45	NC_002652	TAA	4	45724	45735	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
46	NC_002652	TCT	8	46772	46794	23	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
47	NC_002652	TAA	5	46835	46849	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
48	NC_002652	TAA	4	46868	46878	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
49	NC_002652	TAA	4	51064	51075	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
50	NC_002652	TAA	4	52285	52296	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
51	NC_002652	ATA	4	52543	52553	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
52	NC_002652	TTA	4	54426	54436	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
53	NC_002652	TAA	4	56568	56579	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
54	NC_002652	TAA	4	58310	58321	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
55	NC_002652	AAT	5	60326	60341	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
56	NC_002652	ATA	4	60363	60374	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
57	NC_002652	TAT	4	61619	61629	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
58	NC_002652	ATA	4	63948	63959	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	12545455
59	NC_002652	TAA	4	65190	65201	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	12545456
60	NC_002652	ATA	4	66851	66861	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	12545456
61	NC_002652	ATT	6	67095	67111	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	12545456
62	NC_002652	ATT	4	68435	68445	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	12545457
63	NC_002652	TAA	4	69067	69078	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	12545457
64	NC_002652	TAT	4	69098	69108	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	12545457
65	NC_002652	TAT	4	73139	73150	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Euglena longa plastid