ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Malawimonas jakobiformis mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_002553	TAT	4	4537	4547	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_002553	TAT	5	4775	4788	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	11466625
3	NC_002553	TAT	4	4834	4845	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	11466625
4	NC_002553	TGC	4	4957	4968	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	11466625
5	NC_002553	TAA	4	5444	5455	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11466626
6	NC_002553	TAA	4	5953	5964	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11466627
7	NC_002553	ATT	4	7306	7317	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11466629
8	NC_002553	AAT	4	7667	7678	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11466629
9	NC_002553	CAT	4	9026	9036	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	11466633
10	NC_002553	ATA	4	10283	10293	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
11	NC_002553	ATA	4	11510	11521	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11466639
12	NC_002553	TAT	4	13150	13161	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11466641
13	NC_002553	TAA	5	13478	13491	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	11466641
14	NC_002553	ATA	4	13534	13544	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
15	NC_002553	TTA	5	13800	13814	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	11466642
16	NC_002553	TAA	5	14594	14608	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_002553	TAA	5	14755	14768	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	11466643
18	NC_002553	TAA	4	16054	16065	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11466645
19	NC_002553	ATA	4	16169	16181	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	11466645
20	NC_002553	ATT	4	16383	16393	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11466646
21	NC_002553	TAA	5	16685	16699	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
22	NC_002553	ATA	5	17501	17514	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	11466649
23	NC_002553	TAT	4	17648	17658	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11466649
24	NC_002553	TTG	4	18254	18265	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	11466649
25	NC_002553	AAT	4	18531	18543	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	11466650
26	NC_002553	TAA	5	18731	18746	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	11466650
27	NC_002553	TTA	4	18757	18768	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11466650
28	NC_002553	AGT	4	19671	19681	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	11466651
29	NC_002553	TTA	4	19866	19878	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	11466651
30	NC_002553	TTA	4	20027	20038	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11466651
31	NC_002553	TAT	4	20347	20358	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11466652
32	NC_002553	CCT	4	20790	20800	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	11466652
33	NC_002553	CAG	5	21044	21058	15	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	6 %	11466653
34	NC_002553	ATA	4	21166	21177	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	11466653
35	NC_002553	ATA	5	21223	21236	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	11466653
36	NC_002553	ATA	4	21466	21476	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
37	NC_002553	TAA	4	23027	23037	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
38	NC_002553	TAA	4	26350	26362	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
39	NC_002553	TGT	4	26778	26789	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	11466654
40	NC_002553	AAT	4	27008	27018	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	11466654
41	NC_002553	TAA	4	27039	27050	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11466654
42	NC_002553	ATA	4	29051	29062	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11466656
43	NC_002553	ATG	4	29144	29155	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	11466656
44	NC_002553	TCT	4	29293	29304	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	11466656
45	NC_002553	ATA	4	29381	29392	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	11466656
46	NC_002553	TAA	4	31991	32002	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11466658
47	NC_002553	ATT	4	33062	33073	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11466661
48	NC_002553	TAA	4	34234	34245	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11466663
49	NC_002553	TAT	5	34249	34263	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	11466663
50	NC_002553	AAT	4	34595	34606	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11466663
51	NC_002553	TAA	4	34785	34796	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11466663
52	NC_002553	ATA	4	34964	34976	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	11466663
53	NC_002553	TAA	4	37264	37274	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	11466666
54	NC_002553	TAA	4	38104	38115	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11466666
55	NC_002553	AAT	5	38390	38403	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	11466666
56	NC_002553	TAA	4	38431	38442	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11466666
57	NC_002553	TAT	6	38964	38981	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	11466667
58	NC_002553	TAA	4	39508	39519	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11466667
59	NC_002553	AAT	4	39692	39703	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11466667
60	NC_002553	ATA	4	40621	40632	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11466668
61	NC_002553	TTA	4	40633	40644	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11466668
62	NC_002553	ATT	4	40767	40778	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11466668
63	NC_002553	ATA	4	40908	40919	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11466668
64	NC_002553	ATT	4	41826	41837	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11466668
65	NC_002553	TAA	5	43824	43838	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	11466670
66	NC_002553	TAT	4	43947	43958	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	11466670
67	NC_002553	AGA	4	44035	44046	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	11466670
68	NC_002553	CAT	4	44184	44195	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	11466670
69	NC_002553	TAT	4	46290	46301	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11466672
70	NC_002553	ATT	4	46321	46331	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11466672
71	NC_002553	ATT	4	46980	46992	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Malawimonas jakobiformis mitochondrion