ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Malawimonas jakobiformis mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_002553	TAAT	3	319	330	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_002553	AGAC	3	3005	3017	13	50 %	0 %	25 %	25 %	7 %	Non-Coding
3	NC_002553	AAATT	3	3069	3083	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
4	NC_002553	TAT	4	4537	4547	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
5	NC_002553	TGAT	3	4749	4759	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	11466625
6	NC_002553	TAT	5	4775	4788	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	11466625
7	NC_002553	TAT	4	4834	4845	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	11466625
8	NC_002553	TGC	4	4957	4968	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	11466625
9	NC_002553	AAAT	3	5167	5178	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	11466626
10	NC_002553	TAA	4	5444	5455	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11466626
11	NC_002553	AGAAA	3	5655	5669	15	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	11466626
12	NC_002553	AT	6	5781	5792	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	11466626
13	NC_002553	TAA	4	5953	5964	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11466627
14	NC_002553	ATT	4	7306	7317	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11466629
15	NC_002553	TAATA	3	7552	7565	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	11466629
16	NC_002553	AAT	4	7667	7678	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11466629
17	NC_002553	AT	7	7741	7753	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
18	NC_002553	TA	7	8467	8479	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	11466631
19	NC_002553	AAAT	3	8761	8771	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	11466632
20	NC_002553	CAT	4	9026	9036	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	11466633
21	NC_002553	ATAA	3	9112	9123	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	11466633
22	NC_002553	AT	6	9361	9374	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	11466634
23	NC_002553	A	17	9385	9401	17	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	11466634
24	NC_002553	AAAT	3	9427	9438	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	11466634
25	NC_002553	AAAT	3	9621	9632	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	11466634
26	NC_002553	TA	6	10178	10188	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11466635
27	NC_002553	AATATA	3	10268	10285	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	11466635
28	NC_002553	ATA	4	10283	10293	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
29	NC_002553	AT	6	10520	10530	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11466636
30	NC_002553	TAAA	4	10531	10546	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	11466636
31	NC_002553	A	12	10677	10688	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	11466637
32	NC_002553	TA	6	10711	10721	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11466637
33	NC_002553	ATAAA	3	10918	10931	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	11466637
34	NC_002553	AGAAA	3	11472	11491	20	80 %	0 %	20 %	0 %	5 %	11466639
35	NC_002553	ATA	4	11510	11521	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11466639
36	NC_002553	A	14	11518	11531	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	11466639
37	NC_002553	ATTA	3	11671	11682	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	11466639
38	NC_002553	ATTAAT	4	12324	12347	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	11466640
39	NC_002553	ATAAAT	3	12367	12383	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	11466640
40	NC_002553	AT	6	12900	12913	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	39656299
41	NC_002553	TAT	4	13150	13161	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11466641
42	NC_002553	TAA	5	13478	13491	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	11466641
43	NC_002553	ATA	4	13534	13544	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
44	NC_002553	TTA	5	13800	13814	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	11466642
45	NC_002553	TATTT	3	13906	13921	16	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	11466642
46	NC_002553	TATTT	3	14394	14407	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	11466642
47	NC_002553	TAA	5	14594	14608	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_002553	AATATT	3	14662	14680	19	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	11466643
49	NC_002553	TAA	5	14755	14768	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	11466643
50	NC_002553	AAAT	3	15883	15894	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
51	NC_002553	TAA	4	16054	16065	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11466645
52	NC_002553	ATA	4	16169	16181	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	11466645
53	NC_002553	ATT	4	16383	16393	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11466646
54	NC_002553	ATGA	3	16648	16659	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	11466646
55	NC_002553	TAA	5	16685	16699	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
56	NC_002553	ATTA	3	16730	16741	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	11466647
57	NC_002553	ATAA	4	17092	17107	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	11466647
58	NC_002553	AATC	3	17203	17214	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	11466648
59	NC_002553	A	15	17329	17343	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	11466648
60	NC_002553	ATA	5	17501	17514	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	11466649
61	NC_002553	TAT	4	17648	17658	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11466649
62	NC_002553	TTG	4	18254	18265	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	11466649
63	NC_002553	TTTA	3	18349	18361	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
64	NC_002553	TA	6	18452	18463	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
65	NC_002553	AAT	4	18531	18543	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	11466650
66	NC_002553	TAA	5	18731	18746	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	11466650
67	NC_002553	TTA	4	18757	18768	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11466650
68	NC_002553	AT	6	18787	18797	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11466650
69	NC_002553	TATT	5	19612	19633	22	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	11466651
70	NC_002553	AGT	4	19671	19681	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	11466651
71	NC_002553	ATTG	3	19853	19865	13	25 %	50 %	25 %	0 %	7 %	11466651
72	NC_002553	TTA	4	19866	19878	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	11466651
73	NC_002553	TTA	4	20027	20038	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11466651
74	NC_002553	TAT	4	20347	20358	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11466652
75	NC_002553	CCT	4	20790	20800	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	11466652
76	NC_002553	CAG	5	21044	21058	15	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	6 %	11466653
77	NC_002553	ATA	4	21166	21177	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	11466653
78	NC_002553	ATA	5	21223	21236	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	11466653
79	NC_002553	ATA	4	21466	21476	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
80	NC_002553	TTTAA	3	22925	22939	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
81	NC_002553	GTCT	3	22994	23006	13	0 %	50 %	25 %	25 %	7 %	Non-Coding
82	NC_002553	TAA	4	23027	23037	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
83	NC_002553	TA	6	24035	24046	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
84	NC_002553	TGTT	3	24697	24708	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
85	NC_002553	TGGTT	3	26231	26245	15	0 %	60 %	40 %	0 %	6 %	Non-Coding
86	NC_002553	TAA	4	26350	26362	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
87	NC_002553	ATTT	3	26450	26461	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
88	NC_002553	GAAT	3	26745	26756	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	11466654
89	NC_002553	TGT	4	26778	26789	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	11466654
90	NC_002553	AAT	4	27008	27018	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	11466654
91	NC_002553	TAA	4	27039	27050	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11466654
92	NC_002553	CATA	3	28622	28632	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	11466655
93	NC_002553	AT	7	28741	28753	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
94	NC_002553	AT	10	28787	28807	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
95	NC_002553	TA	7	28825	28837	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	11466656
96	NC_002553	TTCT	3	28840	28850	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	11466656
97	NC_002553	TA	7	28904	28917	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	11466656
98	NC_002553	TTTA	3	28977	28987	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	11466656
99	NC_002553	AT	7	29028	29040	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	11466656
100	NC_002553	ATA	4	29051	29062	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11466656
101	NC_002553	ATG	4	29144	29155	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	11466656
102	NC_002553	AATT	3	29204	29214	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11466656
103	NC_002553	TCT	4	29293	29304	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	11466656
104	NC_002553	ATA	4	29381	29392	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	11466656
105	NC_002553	TA	9	29940	29956	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
106	NC_002553	CTAA	3	30544	30555	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	11466657
107	NC_002553	TA	6	31544	31554	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
108	NC_002553	TAA	4	31991	32002	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11466658
109	NC_002553	TTTTTA	3	32461	32477	17	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
110	NC_002553	CCTGCT	3	32662	32679	18	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	5 %	11466660
111	NC_002553	TATT	3	32736	32747	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
112	NC_002553	AATT	3	32814	32825	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	11466661
113	NC_002553	ATT	4	33062	33073	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11466661
114	NC_002553	ATTT	3	33583	33593	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	11466662
115	NC_002553	AT	6	34037	34047	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11466663
116	NC_002553	TAA	4	34234	34245	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11466663
117	NC_002553	TAT	5	34249	34263	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	11466663
118	NC_002553	TGCA	3	34267	34277	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	11466663
119	NC_002553	AAT	4	34595	34606	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11466663
120	NC_002553	TAA	4	34785	34796	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11466663
121	NC_002553	ATA	4	34964	34976	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	11466663
122	NC_002553	AT	7	35660	35672	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
123	NC_002553	TA	6	36274	36286	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	11466665
124	NC_002553	TA	6	36336	36346	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11466665
125	NC_002553	AAATA	3	36516	36529	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	11466665
126	NC_002553	TA	6	36811	36823	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	11466665
127	NC_002553	AT	7	36936	36949	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	11466665
128	NC_002553	AAAT	3	36967	36978	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	11466665
129	NC_002553	TAA	4	37264	37274	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	11466666
130	NC_002553	AT	7	37640	37652	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	11466666
131	NC_002553	AAAT	3	37812	37822	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	11466666
132	NC_002553	CATT	3	38082	38092	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	11466666
133	NC_002553	TAA	4	38104	38115	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11466666
134	NC_002553	A	12	38198	38209	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	11466666
135	NC_002553	AAT	5	38390	38403	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	11466666
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137	NC_002553	AT	6	38479	38489	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
138	NC_002553	AATT	3	38931	38942	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	11466667
139	NC_002553	TAT	6	38964	38981	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	11466667
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141	NC_002553	TAA	4	39508	39519	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11466667
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161	NC_002553	TTATAA	3	43770	43787	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
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171	NC_002553	TA	6	44539	44552	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
172	NC_002553	AT	6	44589	44600	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
173	NC_002553	AAATA	3	44601	44614	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
174	NC_002553	TAT	4	46290	46301	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11466672
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178	NC_002553	ATT	4	46980	46992	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
179	NC_002553	AAACC	3	47093	47107	15	60 %	0 %	0 %	40 %	6 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Malawimonas jakobiformis mitochondrion