ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tetra-nucleotide Imperfect Repeats of Beta vulgaris subsp. vulgaris mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_002511	AAAG	3	2021	2033	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
2	NC_002511	TCTA	3	2365	2376	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
3	NC_002511	CAAG	3	3123	3134	12	50 %	0 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_002511	CAAA	3	3560	3571	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
5	NC_002511	ATTT	3	3909	3919	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
6	NC_002511	ATGA	3	7683	7694	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_002511	CCCA	3	12025	12035	11	25 %	0 %	0 %	75 %	9 %	Non-Coding
8	NC_002511	GCAA	3	13375	13385	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
9	NC_002511	AAAG	3	13759	13770	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
10	NC_002511	AAAG	3	14889	14900	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	9838370
11	NC_002511	AGTT	3	15275	15285	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
12	NC_002511	AAAG	3	17242	17253	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
13	NC_002511	ATCA	3	17498	17508	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
14	NC_002511	AGCC	3	18539	18549	11	25 %	0 %	25 %	50 %	9 %	9838371
15	NC_002511	CAAA	3	19552	19564	13	75 %	0 %	0 %	25 %	7 %	9838373
16	NC_002511	AGTA	3	20665	20676	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
17	NC_002511	TTTC	3	22727	22738	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
18	NC_002511	ACTT	3	24209	24220	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
19	NC_002511	CTTT	3	24417	24427	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
20	NC_002511	TTCT	3	28207	28218	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
21	NC_002511	TTCC	3	30689	30700	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
22	NC_002511	TTCC	3	31440	31451	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
23	NC_002511	GAAG	3	31734	31745	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
24	NC_002511	TTCA	3	33192	33204	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	16227991
25	NC_002511	AATG	3	34022	34032	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	16227991
26	NC_002511	CTAG	3	35459	35469	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
27	NC_002511	CCTT	3	37054	37065	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	16227991
28	NC_002511	CTTT	3	37313	37325	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	16227991
29	NC_002511	CTGA	3	39834	39845	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
30	NC_002511	AAAG	3	41963	41973	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
31	NC_002511	TCAT	3	42527	42538	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
32	NC_002511	CTTT	3	44137	44147	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
33	NC_002511	AGTT	3	44345	44356	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
34	NC_002511	CAAG	3	45208	45219	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
35	NC_002511	CAAA	3	45230	45240	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
36	NC_002511	GAAA	3	45949	45960	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
37	NC_002511	GAAT	3	49107	49117	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
38	NC_002511	TCCT	3	51907	51917	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
39	NC_002511	AGGG	4	53605	53619	15	25 %	0 %	75 %	0 %	6 %	Non-Coding
40	NC_002511	CTTT	4	53775	53791	17	0 %	75 %	0 %	25 %	5 %	Non-Coding
41	NC_002511	AAAT	3	56077	56088	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
42	NC_002511	TCGT	3	58543	58553	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
43	NC_002511	TCCT	3	61024	61035	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	9838386
44	NC_002511	TTTA	3	68157	68168	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
45	NC_002511	AGCT	3	70946	70956	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	9838388
46	NC_002511	AAAT	3	71242	71253	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
47	NC_002511	GCTT	3	71825	71836	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
48	NC_002511	CTCG	3	72237	72249	13	0 %	25 %	25 %	50 %	7 %	Non-Coding
49	NC_002511	TCTA	3	76106	76117	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	16227992
50	NC_002511	CCTT	3	77955	77967	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	16227992
51	NC_002511	GATC	3	81242	81253	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	16227992
52	NC_002511	ATCG	3	81882	81893	12	25 %	25 %	25 %	25 %	0 %	16227992
53	NC_002511	GTGG	3	82508	82520	13	0 %	25 %	75 %	0 %	7 %	16227992
54	NC_002511	TGAA	3	84528	84538	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	16227992
55	NC_002511	CTTT	3	85323	85333	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	16227992
56	NC_002511	CTTT	3	86032	86042	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	16227992
57	NC_002511	TCTA	3	90002	90013	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	16227992
58	NC_002511	GATC	3	92053	92063	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	16227992
59	NC_002511	AAGC	3	92080	92090	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	16227992
60	NC_002511	GCTT	3	92483	92493	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	16227992
61	NC_002511	GCCC	3	92560	92571	12	0 %	0 %	25 %	75 %	8 %	16227992
62	NC_002511	AAGA	3	94911	94923	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	16227992
63	NC_002511	CTTT	3	94966	94978	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	16227992
64	NC_002511	CCCA	3	95081	95091	11	25 %	0 %	0 %	75 %	9 %	16227992
65	NC_002511	TCAT	3	95230	95240	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	16227992
66	NC_002511	GAAA	3	95275	95286	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	16227992
67	NC_002511	GAAA	4	95814	95828	15	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	16227992
68	NC_002511	AAAG	3	95889	95899	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	16227992
69	NC_002511	TTGG	3	96133	96144	12	0 %	50 %	50 %	0 %	8 %	16227992
70	NC_002511	ATCT	3	97246	97257	12	25 %	50 %	0 %	25 %	0 %	16227992
71	NC_002511	TACT	3	98807	98817	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	16227992
72	NC_002511	AGTA	3	99914	99925	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	16227992
73	NC_002511	ACTC	3	100548	100559	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	16227992
74	NC_002511	ACTC	3	100580	100591	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	16227992
75	NC_002511	AGAA	3	101647	101658	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	16227992
76	NC_002511	TATG	3	101875	101886	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	16227992
77	NC_002511	TGAG	3	103385	103395	11	25 %	25 %	50 %	0 %	9 %	16227992
78	NC_002511	ACCT	3	103852	103862	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	16227992
79	NC_002511	GAAT	3	104687	104697	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	16227992
80	NC_002511	AAGC	3	104767	104778	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	16227992
81	NC_002511	AAGA	3	105108	105119	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	16227992
82	NC_002511	TTAG	3	108719	108729	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	16227992
83	NC_002511	ACAG	3	108795	108806	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	16227992
84	NC_002511	CTTT	3	108830	108841	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	16227992
85	NC_002511	GGAA	3	111530	111541	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	16227992
86	NC_002511	GATC	3	113084	113096	13	25 %	25 %	25 %	25 %	7 %	16227992
87	NC_002511	GAAT	3	116360	116371	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	16227992
88	NC_002511	ATAG	3	116905	116915	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	16227992
89	NC_002511	AAAG	3	118511	118522	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	16227992
90	NC_002511	CAAG	3	121456	121467	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	16227992
91	NC_002511	GAAT	4	121829	121844	16	50 %	25 %	25 %	0 %	6 %	16227992
92	NC_002511	GAAA	3	122650	122660	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	16227992
93	NC_002511	TTTC	3	123332	123343	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	16227992
94	NC_002511	TAGA	3	125210	125220	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	16227992
95	NC_002511	ACTT	3	127159	127170	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	16227992
96	NC_002511	CAAG	3	127442	127453	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	16227992
97	NC_002511	TCCA	3	128886	128896	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	16227992
98	NC_002511	GAAA	3	129266	129277	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	16227992
99	NC_002511	AAGG	3	130150	130161	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	16227992
100	NC_002511	AAGA	3	130394	130406	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	16227992
101	NC_002511	ACAG	3	130540	130551	12	50 %	0 %	25 %	25 %	0 %	16227992
102	NC_002511	TTGT	3	130826	130837	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	16227992
103	NC_002511	CTGA	3	133915	133927	13	25 %	25 %	25 %	25 %	7 %	16227992
104	NC_002511	CTTG	3	133952	133964	13	0 %	50 %	25 %	25 %	7 %	16227992
105	NC_002511	AATA	3	134405	134416	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	16227992
106	NC_002511	TACT	3	135674	135685	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	16227992
107	NC_002511	TGAA	3	139216	139226	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	16227992
108	NC_002511	TAAG	3	139417	139428	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	16227992
109	NC_002511	AAGT	3	141011	141022	12	50 %	25 %	25 %	0 %	0 %	16227992
110	NC_002511	AAGG	3	143618	143630	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	16227992
111	NC_002511	AGTA	3	144614	144626	13	50 %	25 %	25 %	0 %	7 %	16227992
112	NC_002511	GCAA	3	148575	148585	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	16227992
113	NC_002511	AGCA	3	150650	150661	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	16227992
114	NC_002511	CTTC	4	156648	156662	15	0 %	50 %	0 %	50 %	6 %	16227992
115	NC_002511	AATG	3	156785	156796	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	16227992
116	NC_002511	ACTT	3	158649	158660	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	16227992
117	NC_002511	CCTT	3	158865	158875	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	16227992
118	NC_002511	TCGA	3	159080	159091	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	16227992
119	NC_002511	TTTC	3	159515	159525	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	16227992
120	NC_002511	ATTC	3	163989	164000	12	25 %	50 %	0 %	25 %	0 %	16227992
121	NC_002511	TTTC	3	168491	168503	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	16227992
122	NC_002511	AAGG	3	169540	169551	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	16227992
123	NC_002511	TTTG	3	171856	171867	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	16227992
124	NC_002511	GCCG	3	174819	174830	12	0 %	0 %	50 %	50 %	0 %	16227992
125	NC_002511	ATGC	3	182694	182705	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	16227992
126	NC_002511	ATTC	3	183047	183058	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	16227992
127	NC_002511	GGAG	3	184645	184656	12	25 %	0 %	75 %	0 %	8 %	16227992
128	NC_002511	AAGA	4	188213	188228	16	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	16227992
129	NC_002511	TTCC	3	190746	190757	12	0 %	50 %	0 %	50 %	0 %	16227992
130	NC_002511	TGAA	3	195055	195065	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	16227992
131	NC_002511	TGAG	3	195121	195132	12	25 %	25 %	50 %	0 %	0 %	16227992
132	NC_002511	ATGA	3	195146	195157	12	50 %	25 %	25 %	0 %	0 %	16227992
133	NC_002511	AGGT	3	198498	198510	13	25 %	25 %	50 %	0 %	7 %	16227992
134	NC_002511	AAAG	3	200921	200931	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	16227992
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244	NC_002511	GAAA	3	368330	368342	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
245	NC_002511	CTGT	3	368371	368382	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
246	NC_002511	CTAA	3	368448	368458	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tetra-nucleotide Imperfect Repeats of Beta vulgaris subsp. vulgaris mitochondrion