Tetra-nucleotide Imperfect Repeats of Physarum polycephalum mitochondrion
Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No. | Genome ID | Motif | Iterations | Start | End | Tract Length | A% | T% | G% | C% | Imperfection % | Protein ID |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 | NC_002508 | AATG | 3 | 103 | 114 | 12 | 50 % | 25 % | 25 % | 0 % | 8 % | 11466243 |
2 | NC_002508 | TTAA | 3 | 4275 | 4286 | 12 | 50 % | 50 % | 0 % | 0 % | 8 % | 11466243 |
3 | NC_002508 | GAAA | 3 | 4300 | 4311 | 12 | 75 % | 0 % | 25 % | 0 % | 8 % | 11466243 |
4 | NC_002508 | TTAA | 3 | 4326 | 4337 | 12 | 50 % | 50 % | 0 % | 0 % | 8 % | 11466243 |
5 | NC_002508 | TAAA | 3 | 6423 | 6434 | 12 | 75 % | 25 % | 0 % | 0 % | 8 % | 11466243 |
6 | NC_002508 | AAAT | 3 | 7899 | 7909 | 11 | 75 % | 25 % | 0 % | 0 % | 9 % | 11466243 |
7 | NC_002508 | ATTT | 4 | 10139 | 10154 | 16 | 25 % | 75 % | 0 % | 0 % | 6 % | 11466243 |
8 | NC_002508 | TATT | 4 | 12015 | 12030 | 16 | 25 % | 75 % | 0 % | 0 % | 6 % | 11466243 |
9 | NC_002508 | AATA | 3 | 12571 | 12582 | 12 | 75 % | 25 % | 0 % | 0 % | 8 % | 11466243 |
10 | NC_002508 | ATAA | 3 | 13900 | 13912 | 13 | 75 % | 25 % | 0 % | 0 % | 7 % | 11466243 |
11 | NC_002508 | ACAA | 3 | 14786 | 14797 | 12 | 75 % | 0 % | 0 % | 25 % | 8 % | 11466243 |
12 | NC_002508 | ATAA | 3 | 15164 | 15174 | 11 | 75 % | 25 % | 0 % | 0 % | 9 % | 11466243 |
13 | NC_002508 | TTTA | 3 | 18211 | 18223 | 13 | 25 % | 75 % | 0 % | 0 % | 7 % | 11466243 |
14 | NC_002508 | TTAT | 3 | 18446 | 18458 | 13 | 25 % | 75 % | 0 % | 0 % | 7 % | 11466243 |
15 | NC_002508 | AAGT | 3 | 19228 | 19239 | 12 | 50 % | 25 % | 25 % | 0 % | 8 % | 11466243 |
16 | NC_002508 | CATT | 3 | 19496 | 19506 | 11 | 25 % | 50 % | 0 % | 25 % | 9 % | 11466243 |
17 | NC_002508 | TAAA | 3 | 20073 | 20084 | 12 | 75 % | 25 % | 0 % | 0 % | 8 % | 11466243 |
18 | NC_002508 | ACAA | 3 | 21956 | 21967 | 12 | 75 % | 0 % | 0 % | 25 % | 8 % | 11466243 |
19 | NC_002508 | TAAA | 3 | 27402 | 27412 | 11 | 75 % | 25 % | 0 % | 0 % | 9 % | 11466243 |
20 | NC_002508 | ATTT | 3 | 30752 | 30762 | 11 | 25 % | 75 % | 0 % | 0 % | 9 % | 11466243 |
21 | NC_002508 | TTTA | 3 | 30866 | 30876 | 11 | 25 % | 75 % | 0 % | 0 % | 9 % | 11466243 |
22 | NC_002508 | TATT | 4 | 31449 | 31464 | 16 | 25 % | 75 % | 0 % | 0 % | 0 % | 11466243 |
23 | NC_002508 | TTAT | 3 | 31680 | 31691 | 12 | 25 % | 75 % | 0 % | 0 % | 8 % | 11466243 |
24 | NC_002508 | AATA | 3 | 32715 | 32725 | 11 | 75 % | 25 % | 0 % | 0 % | 9 % | 11466243 |
25 | NC_002508 | TTGC | 3 | 34052 | 34062 | 11 | 0 % | 50 % | 25 % | 25 % | 9 % | 11466243 |
26 | NC_002508 | AAAT | 3 | 38069 | 38081 | 13 | 75 % | 25 % | 0 % | 0 % | 7 % | 11466243 |
27 | NC_002508 | GTAA | 3 | 40957 | 40968 | 12 | 50 % | 25 % | 25 % | 0 % | 8 % | 11466243 |
28 | NC_002508 | TTCA | 3 | 44076 | 44087 | 12 | 25 % | 50 % | 0 % | 25 % | 8 % | 11466243 |
29 | NC_002508 | CTTT | 3 | 45618 | 45629 | 12 | 0 % | 75 % | 0 % | 25 % | 8 % | 11466243 |
30 | NC_002508 | TTAT | 3 | 46357 | 46368 | 12 | 25 % | 75 % | 0 % | 0 % | 8 % | 11466243 |
31 | NC_002508 | GCTA | 3 | 46461 | 46473 | 13 | 25 % | 25 % | 25 % | 25 % | 7 % | 11466243 |
32 | NC_002508 | AAGC | 3 | 49200 | 49210 | 11 | 50 % | 0 % | 25 % | 25 % | 9 % | 11466243 |
33 | NC_002508 | TTTA | 3 | 50376 | 50386 | 11 | 25 % | 75 % | 0 % | 0 % | 9 % | 11466243 |
34 | NC_002508 | TTTA | 3 | 55122 | 55133 | 12 | 25 % | 75 % | 0 % | 0 % | 8 % | 11466243 |
35 | NC_002508 | TAAA | 3 | 58456 | 58466 | 11 | 75 % | 25 % | 0 % | 0 % | 9 % | 11466243 |
36 | NC_002508 | AAAG | 3 | 60786 | 60796 | 11 | 75 % | 0 % | 25 % | 0 % | 9 % | 11466243 |
37 | NC_002508 | ATTT | 3 | 61772 | 61782 | 11 | 25 % | 75 % | 0 % | 0 % | 9 % | 11466243 |
38 | NC_002508 | ATTA | 3 | 62669 | 62680 | 12 | 50 % | 50 % | 0 % | 0 % | 8 % | 11466243 |