ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Physarum polycephalum mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_002508	AATG	3	103	114	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	11466243
2	NC_002508	ATT	4	298	309	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11466243
3	NC_002508	TAT	4	315	325	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11466243
4	NC_002508	TA	6	434	445	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	11466243
5	NC_002508	TAA	4	575	586	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	11466243
6	NC_002508	TA	6	609	619	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11466243
7	NC_002508	ATG	4	1168	1180	13	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	11466243
8	NC_002508	AAATA	4	1274	1292	19	80 %	20 %	0 %	0 %	10 %	11466243
9	NC_002508	AT	8	1295	1309	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	11466243
10	NC_002508	TGAAAC	3	1778	1795	18	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	5 %	11466243
11	NC_002508	AGA	4	2635	2646	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	11466243
12	NC_002508	TTAA	3	4275	4286	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	11466243
13	NC_002508	GAAA	3	4300	4311	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	11466243
14	NC_002508	TTAA	3	4326	4337	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	11466243
15	NC_002508	ATT	7	4589	4609	21	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11466243
16	NC_002508	AT	6	4734	4747	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	11466243
17	NC_002508	ATAAAA	3	5353	5370	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	11466243
18	NC_002508	TTA	4	5561	5572	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11466243
19	NC_002508	AAT	6	5755	5772	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	11466243
20	NC_002508	ATA	4	5780	5791	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11466243
21	NC_002508	AT	8	6200	6215	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	11466243
22	NC_002508	ACAAA	3	6325	6338	14	80 %	0 %	0 %	20 %	7 %	11466243
23	NC_002508	TAAA	3	6423	6434	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	11466243
24	NC_002508	AGA	4	7552	7562	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	11466243
25	NC_002508	ATA	4	7574	7584	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	11466243
26	NC_002508	AAAT	3	7899	7909	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	11466243
27	NC_002508	TA	7	8097	8109	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	11466243
28	NC_002508	ATT	4	8375	8385	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11466243
29	NC_002508	GAT	5	8568	8582	15	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	6 %	11466243
30	NC_002508	AT	6	8880	8890	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11466243
31	NC_002508	ATTATA	3	9839	9857	19	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	11466243
32	NC_002508	ATTT	4	10139	10154	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	11466243
33	NC_002508	TAA	4	10267	10277	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	11466243
34	NC_002508	AATATT	3	10726	10742	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	11466243
35	NC_002508	ATA	4	10781	10792	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11466243
36	NC_002508	ATA	4	10862	10873	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11466243
37	NC_002508	AT	6	10901	10914	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	11466243
38	NC_002508	TAT	4	11128	11138	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11466243
39	NC_002508	TATT	4	12015	12030	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	11466243
40	NC_002508	TAT	4	12067	12078	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11466243
41	NC_002508	AT	6	12083	12093	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11466243
42	NC_002508	AATA	3	12571	12582	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	11466243
43	NC_002508	ATA	5	12664	12678	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	11466243
44	NC_002508	TAT	4	13000	13011	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11466243
45	NC_002508	TAA	4	13698	13708	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	11466243
46	NC_002508	ATAA	3	13900	13912	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	11466243
47	NC_002508	ACAA	3	14786	14797	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	11466243
48	NC_002508	ATAA	3	15164	15174	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	11466243
49	NC_002508	TTTGA	3	15263	15276	14	20 %	60 %	20 %	0 %	7 %	11466243
50	NC_002508	TTA	4	16561	16571	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11466243
51	NC_002508	TTTAT	3	17372	17386	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	11466243
52	NC_002508	TGC	4	17903	17913	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	11466243
53	NC_002508	TTTA	3	18211	18223	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	11466243
54	NC_002508	TTAT	3	18446	18458	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	11466243
55	NC_002508	TA	6	18765	18775	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11466243
56	NC_002508	AAGT	3	19228	19239	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	11466243
57	NC_002508	CATT	3	19496	19506	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	11466243
58	NC_002508	TAAA	3	20073	20084	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	11466243
59	NC_002508	ACTTA	3	20426	20440	15	40 %	40 %	0 %	20 %	6 %	11466243
60	NC_002508	AGA	4	20721	20732	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	11466243
61	NC_002508	TTA	4	21484	21495	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11466243
62	NC_002508	ATTAT	3	21686	21699	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	11466243
63	NC_002508	ACAA	3	21956	21967	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	11466243
64	NC_002508	TAA	4	22585	22596	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11466243
65	NC_002508	ACT	4	22867	22878	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	11466243
66	NC_002508	A	13	22884	22896	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	11466243
67	NC_002508	ATA	4	22928	22938	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	11466243
68	NC_002508	ATAAAA	3	22987	23004	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	11466243
69	NC_002508	ATT	4	24165	24175	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11466243
70	NC_002508	TAT	6	24668	24684	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	11466243
71	NC_002508	TCT	4	25001	25012	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	11466243
72	NC_002508	TCT	5	25247	25261	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	11466243
73	NC_002508	TAA	4	26891	26901	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	11466243
74	NC_002508	TAAA	3	27402	27412	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	11466243
75	NC_002508	TA	6	27559	27570	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	11466243
76	NC_002508	TA	6	28540	28551	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	11466243
77	NC_002508	ATA	4	29455	29466	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11466243
78	NC_002508	ATTT	3	30752	30762	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	11466243
79	NC_002508	TTTA	3	30866	30876	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	11466243
80	NC_002508	AT	6	31333	31343	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11466243
81	NC_002508	TATT	4	31449	31464	16	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	11466243
82	NC_002508	ATT	4	31476	31486	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11466243
83	NC_002508	TTAT	3	31680	31691	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	11466243
84	NC_002508	AATA	3	32715	32725	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	11466243
85	NC_002508	TTGC	3	34052	34062	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	11466243
86	NC_002508	TTA	5	34099	34112	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	11466243
87	NC_002508	AAG	4	34828	34840	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	11466243
88	NC_002508	TAT	4	35378	35388	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11466243
89	NC_002508	AAAT	3	38069	38081	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	11466243
90	NC_002508	AAT	4	39038	39049	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11466243
91	NC_002508	GTAA	3	40957	40968	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	11466243
92	NC_002508	AT	7	43402	43415	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	11466243
93	NC_002508	TTCA	3	44076	44087	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	11466243
94	NC_002508	TAA	4	44275	44285	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	11466243
95	NC_002508	ATTTTT	3	45361	45378	18	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	11466243
96	NC_002508	AAT	4	45552	45562	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	11466243
97	NC_002508	CTTT	3	45618	45629	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	11466243
98	NC_002508	TTAT	3	46357	46368	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	11466243
99	NC_002508	GCTA	3	46461	46473	13	25 %	25 %	25 %	25 %	7 %	11466243
100	NC_002508	TTTGTT	3	47521	47538	18	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	5 %	11466243
101	NC_002508	TA	6	48335	48346	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	11466243
102	NC_002508	AAGC	3	49200	49210	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	11466243
103	NC_002508	TTTA	3	50376	50386	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	11466243
104	NC_002508	A	16	51273	51288	16	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	11466243
105	NC_002508	ATT	4	53634	53646	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	11466243
106	NC_002508	ATG	5	55022	55035	14	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	11466243
107	NC_002508	TTTA	3	55122	55133	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	11466243
108	NC_002508	ATT	4	55320	55332	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	11466243
109	NC_002508	TTA	4	55406	55416	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11466243
110	NC_002508	TA	7	55433	55445	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	11466243
111	NC_002508	AATAA	3	56027	56040	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	11466243
112	NC_002508	AAT	4	56337	56348	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11466243
113	NC_002508	ATA	4	56510	56521	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11466243
114	NC_002508	AAT	4	56671	56681	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	11466243
115	NC_002508	TAA	4	56723	56733	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	11466243
116	NC_002508	TA	6	56908	56918	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11466243
117	NC_002508	TAA	4	58040	58052	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	11466243
118	NC_002508	TAAA	3	58456	58466	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	11466243
119	NC_002508	TAT	4	59102	59113	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11466243
120	NC_002508	AATTT	3	59871	59885	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	11466243
121	NC_002508	TAA	4	60165	60176	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11466243
122	NC_002508	TAA	5	60690	60703	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	11466243
123	NC_002508	AAAG	3	60786	60796	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	11466243
124	NC_002508	TA	6	61001	61011	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11466243
125	NC_002508	TTAATT	3	61127	61145	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	11466243
126	NC_002508	ATA	4	61739	61750	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11466243
127	NC_002508	ATTT	3	61772	61782	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	11466243
128	NC_002508	ATTA	3	62669	62680	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	11466243

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

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