ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Phytophthora infestans mitochondrion

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_002387	TAT	4	110	120	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_002387	TTAA	3	2819	2830	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_002387	ATT	4	2944	2955	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
4	NC_002387	ATT	6	2973	2989	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
5	NC_002387	A	12	3310	3321	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	9695373
6	NC_002387	AATT	4	3697	3713	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	9695374
7	NC_002387	ATT	5	4040	4054	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	9695374
8	NC_002387	TAA	4	4066	4077	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	9695374
9	NC_002387	ATTT	3	4487	4497	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
10	NC_002387	TA	6	4822	4832	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
11	NC_002387	TTA	4	5136	5146	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
12	NC_002387	TAAAA	3	6242	6255	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
13	NC_002387	TTTA	3	6555	6566	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
14	NC_002387	AAATT	3	6860	6873	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
15	NC_002387	AATTTA	3	6922	6939	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
16	NC_002387	TTAA	3	6947	6958	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
17	NC_002387	TTATTT	3	7023	7040	18	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	9695375
18	NC_002387	TTAA	3	7201	7212	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	9695375
19	NC_002387	A	16	7240	7255	16	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	9695375
20	NC_002387	TTTA	3	7527	7539	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
21	NC_002387	A	15	7857	7871	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	9695376
22	NC_002387	TAAA	3	8403	8413	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	9695376
23	NC_002387	AT	6	8449	8459	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	9695377
24	NC_002387	TAT	4	8490	8500	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	9695377
25	NC_002387	A	14	8618	8631	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
26	NC_002387	TAT	4	8991	9002	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	9695378
27	NC_002387	TTAG	3	9624	9635	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	9695378
28	NC_002387	TTAT	3	9908	9918	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	9695378
29	NC_002387	TTAA	3	10235	10246	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
30	NC_002387	A	14	10588	10601	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
31	NC_002387	TTTA	3	10602	10613	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
32	NC_002387	AATT	3	10921	10932	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	9695380
33	NC_002387	ATAA	5	11202	11221	20	75 %	25 %	0 %	0 %	10 %	9695380
34	NC_002387	AATT	3	11236	11247	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
35	NC_002387	T	13	11539	11551	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	9695381
36	NC_002387	ATT	4	11633	11644	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	9695381
37	NC_002387	TTTATT	3	11999	12017	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	10 %	9695381
38	NC_002387	GTTA	3	12259	12269	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	9695381
39	NC_002387	T	15	12355	12369	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	9695381
40	NC_002387	TAT	4	12457	12467	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
41	NC_002387	TTTTTA	3	12556	12574	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	10 %	9695382
42	NC_002387	CTA	4	13783	13793	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	9695382
43	NC_002387	ACA	7	13881	13901	21	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	9695382
44	NC_002387	ATAA	4	14624	14639	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	9695383
45	NC_002387	TAA	4	14680	14692	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	9695383
46	NC_002387	ATA	4	15695	15705	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	9695383
47	NC_002387	TAAA	3	15766	15777	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_002387	AT	9	16198	16215	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	9695384
49	NC_002387	TTGAAT	3	16564	16582	19	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	10 %	9695385
50	NC_002387	AT	8	16948	16962	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	9695385
51	NC_002387	TAT	4	17481	17492	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
52	NC_002387	TA	7	17526	17539	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
53	NC_002387	TAT	4	17670	17680	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	9695386
54	NC_002387	ATA	4	17744	17754	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	9695386
55	NC_002387	TAAT	3	18733	18744	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	9695386
56	NC_002387	TAT	5	18748	18762	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	9695386
57	NC_002387	AAAAT	3	18962	18975	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	9695386
58	NC_002387	TTAA	3	18989	18999	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	9695386
59	NC_002387	ATT	4	19165	19176	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
60	NC_002387	A	16	19882	19897	16	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	9695388
61	NC_002387	AAAT	3	20216	20227	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	9695388
62	NC_002387	TTTAA	3	20292	20305	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	9695389
63	NC_002387	A	17	20407	20423	17	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	9695389
64	NC_002387	ATT	5	20682	20695	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	9695390
65	NC_002387	ACA	5	20720	20733	14	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	7 %	9695390
66	NC_002387	T	15	21313	21327	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	9695390
67	NC_002387	TAT	4	21439	21450	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	9695390
68	NC_002387	ACA	4	21485	21495	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	9695390
69	NC_002387	TTG	4	21534	21545	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	9695390
70	NC_002387	TGG	4	21575	21585	11	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	9695390
71	NC_002387	T	16	21864	21879	16	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	9695391
72	NC_002387	TTA	4	22862	22872	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
73	NC_002387	TAAA	3	22907	22918	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_002387	TA	6	23190	23200	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	9695393
75	NC_002387	ATATT	3	23225	23238	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	9695393
76	NC_002387	TCAA	3	24563	24573	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	9695393
77	NC_002387	ATT	4	24982	24994	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	9695393
78	NC_002387	TTA	4	24995	25006	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	9695393
79	NC_002387	ATT	4	25222	25234	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	9695394
80	NC_002387	T	12	25636	25647	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	9695394
81	NC_002387	TAT	4	25657	25667	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	9695394
82	NC_002387	A	13	25707	25719	13	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	9695394
83	NC_002387	CTG	4	26154	26165	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	9695395
84	NC_002387	AAAAT	3	26221	26234	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	9695395
85	NC_002387	ATA	5	26247	26261	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	9695395
86	NC_002387	AAAT	3	26563	26574	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	9695396
87	NC_002387	TTCAGC	3	26721	26738	18	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	5 %	9695396
88	NC_002387	CCAA	3	26976	26986	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	9695396
89	NC_002387	TCT	4	27240	27250	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	9695396
90	NC_002387	TA	6	27610	27620	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	9695397
91	NC_002387	TAT	4	27931	27942	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	9695397
92	NC_002387	TTA	4	28596	28607	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	9695397
93	NC_002387	ATA	4	29519	29531	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
94	NC_002387	TATT	3	30150	30161	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	9695398
95	NC_002387	ATTT	3	30229	30240	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	9695398
96	NC_002387	AT	7	30329	30342	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	9695398
97	NC_002387	TTCT	3	30418	30428	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
98	NC_002387	ATTT	3	30532	30542	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
99	NC_002387	T	14	30766	30779	14	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	9695399
100	NC_002387	T	12	31104	31115	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	9695399
101	NC_002387	TTTA	3	31260	31271	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	9695400
102	NC_002387	TTAA	3	31419	31431	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	9695400
103	NC_002387	A	15	32406	32420	15	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	9695401
104	NC_002387	TTAA	3	32476	32487	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	9695402
105	NC_002387	A	16	32658	32673	16	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	9695402
106	NC_002387	TAA	4	32864	32875	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	9695403
107	NC_002387	TA	7	32878	32891	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	9695403
108	NC_002387	AT	6	32950	32960	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	9695403
109	NC_002387	TAA	5	32963	32977	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	9695403
110	NC_002387	A	13	33054	33066	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	9695403
111	NC_002387	TAAATT	3	33433	33451	19	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	9695403
112	NC_002387	AAAT	3	34057	34067	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	9695405
113	NC_002387	TAA	5	34106	34119	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	9695405
114	NC_002387	TAA	4	34273	34283	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	9695405
115	NC_002387	AATA	3	34612	34622	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	9695405
116	NC_002387	T	12	34749	34760	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	9695406
117	NC_002387	A	14	34823	34836	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	9695406
118	NC_002387	TTTA	3	35054	35064	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	9695406
119	NC_002387	TA	6	35581	35591	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	9695408
120	NC_002387	A	12	35864	35875	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	9695408
121	NC_002387	AATTAA	3	36260	36277	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	9695409
122	NC_002387	TAG	4	36443	36453	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	9695409
123	NC_002387	AAAT	3	36579	36590	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	9695409
124	NC_002387	A	18	36596	36613	18	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	9695410
125	NC_002387	TAA	4	36611	36622	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	9695410
126	NC_002387	ATTT	3	36631	36641	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	9695410
127	NC_002387	AAAT	3	36680	36691	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	9695410
128	NC_002387	TAAA	3	36773	36784	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	9695410
129	NC_002387	TAA	4	36947	36957	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	9695410
130	NC_002387	ACAA	3	37080	37092	13	75 %	0 %	0 %	25 %	7 %	9695410
131	NC_002387	TAA	4	37179	37189	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	9695410
132	NC_002387	GAAA	3	37332	37342	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	9695411
133	NC_002387	ATA	4	37450	37460	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	9695411
134	NC_002387	ATTT	3	37475	37485	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	9695411
135	NC_002387	ATAA	3	37567	37578	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	9695411
136	NC_002387	TAA	4	37583	37593	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	9695411
137	NC_002387	AAAAT	3	37662	37675	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	9695412
138	NC_002387	AAAT	3	37684	37694	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	9695412
139	NC_002387	AAAT	3	37846	37857	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	9695412
140	NC_002387	ATTTAA	3	37914	37931	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	9695412
141	NC_002387	A	13	37945	37957	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	9695412

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Phytophthora infestans mitochondrion