ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Scenedesmus obliquus mitochondrion

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_002254	T	13	412	424	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
2	NC_002254	ATTT	3	665	675	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
3	NC_002254	ATAA	3	685	695	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
4	NC_002254	ATAA	3	712	722	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
5	NC_002254	ATTTTT	3	739	757	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
6	NC_002254	ATAA	3	876	886	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	11467912
7	NC_002254	ATAA	3	903	913	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	11467912
8	NC_002254	ATAA	3	930	940	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	11467912
9	NC_002254	ATAA	3	957	967	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	11467912
10	NC_002254	ATTT	3	970	980	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	11467912
11	NC_002254	AT	16	1023	1054	32	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
12	NC_002254	ATTT	3	1302	1313	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
13	NC_002254	AAAT	3	1579	1589	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
14	NC_002254	TGTA	3	1687	1697	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
15	NC_002254	GTA	4	1715	1725	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
16	NC_002254	AATAG	4	1791	1814	24	60 %	20 %	20 %	0 %	4 %	Non-Coding
17	NC_002254	AATAG	7	1828	1863	36	60 %	20 %	20 %	0 %	8 %	Non-Coding
18	NC_002254	ATAGA	4	1864	1884	21	60 %	20 %	20 %	0 %	9 %	Non-Coding
19	NC_002254	AATAG	11	1883	1942	60	60 %	20 %	20 %	0 %	8 %	Non-Coding
20	NC_002254	AGT	4	2038	2048	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
21	NC_002254	TAGAA	7	2063	2097	35	60 %	20 %	20 %	0 %	5 %	Non-Coding
22	NC_002254	ATAGA	4	2134	2153	20	60 %	20 %	20 %	0 %	5 %	Non-Coding
23	NC_002254	ATAGA	5	2175	2203	29	60 %	20 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
24	NC_002254	AATAG	4	2234	2254	21	60 %	20 %	20 %	0 %	9 %	Non-Coding
25	NC_002254	AGTA	3	2265	2276	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
26	NC_002254	TAGAA	6	2291	2321	31	60 %	20 %	20 %	0 %	9 %	Non-Coding
27	NC_002254	AATAG	4	2327	2347	21	60 %	20 %	20 %	0 %	9 %	Non-Coding
28	NC_002254	TTA	4	3034	3045	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
29	NC_002254	TTA	4	3138	3149	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
30	NC_002254	ACAG	3	3381	3391	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	11467913
31	NC_002254	AAAT	3	4233	4243	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
32	NC_002254	TTTTA	3	4625	4639	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
33	NC_002254	AATA	3	4878	4888	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
34	NC_002254	TTTTGG	3	5033	5050	18	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	5 %	11467914
35	NC_002254	CATTG	3	5168	5181	14	20 %	40 %	20 %	20 %	7 %	11467914
36	NC_002254	ATTT	3	5617	5628	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
37	NC_002254	TATT	3	6012	6022	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
38	NC_002254	ATA	4	6052	6062	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
39	NC_002254	TA	6	6064	6074	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
40	NC_002254	TGT	4	6457	6468	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	11467931
41	NC_002254	TTAT	3	7098	7108	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	11467931
42	NC_002254	TAA	4	7118	7129	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11467931
43	NC_002254	TA	6	7375	7386	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	11467931
44	NC_002254	AT	6	7389	7400	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	11467931
45	NC_002254	CAA	4	8164	8174	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	11467931
46	NC_002254	TATTTT	3	11243	11260	18	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
47	NC_002254	GTTT	3	11283	11294	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
48	NC_002254	TGTT	3	11893	11903	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	11467918
49	NC_002254	TTGG	3	13671	13681	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	11467919
50	NC_002254	ATAA	3	13899	13909	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
51	NC_002254	TATT	5	13935	13953	19	25 %	75 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
52	NC_002254	ATTAT	5	14488	14511	24	40 %	60 %	0 %	0 %	8 %	11467920
53	NC_002254	TC	6	15544	15554	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
54	NC_002254	ATG	4	16826	16837	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	11467921
55	NC_002254	TGT	4	17062	17073	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	11467921
56	NC_002254	TAAAAA	3	17311	17327	17	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
57	NC_002254	A	12	17386	17397	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
58	NC_002254	TA	6	17396	17409	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
59	NC_002254	T	13	18690	18702	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
60	NC_002254	TTAT	3	18705	18716	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
61	NC_002254	TA	8	18721	18736	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
62	NC_002254	GATT	3	20402	20412	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	11467923
63	NC_002254	TA	6	20687	20698	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
64	NC_002254	TTG	4	21294	21305	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11467924
65	NC_002254	AT	13	23090	23115	26	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
66	NC_002254	A	17	23117	23133	17	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
67	NC_002254	AAAT	3	23495	23506	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
68	NC_002254	AAAT	3	23509	23519	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
69	NC_002254	TAG	4	23562	23572	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
70	NC_002254	TAGAA	3	23642	23656	15	60 %	20 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
71	NC_002254	ATAGA	6	23719	23751	33	60 %	20 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
72	NC_002254	AATAG	9	23759	23804	46	60 %	20 %	20 %	0 %	8 %	Non-Coding
73	NC_002254	TAGAA	12	23837	23895	59	60 %	20 %	20 %	0 %	8 %	Non-Coding
74	NC_002254	ATAGA	5	23932	23956	25	60 %	20 %	20 %	0 %	8 %	Non-Coding
75	NC_002254	AATAG	4	23961	23981	21	60 %	20 %	20 %	0 %	9 %	Non-Coding
76	NC_002254	GCA	4	25385	25396	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	11467925
77	NC_002254	AAT	5	26250	26264	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
78	NC_002254	TAA	4	27447	27457	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
79	NC_002254	AAGC	3	27650	27661	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
80	NC_002254	AT	6	29639	29649	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
81	NC_002254	ATA	4	31121	31132	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
82	NC_002254	TA	11	31576	31597	22	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
83	NC_002254	A	13	32328	32340	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
84	NC_002254	T	13	32562	32574	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
85	NC_002254	TCTT	3	33093	33103	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
86	NC_002254	T	12	33162	33173	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_002254	TTTG	3	33317	33327	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
88	NC_002254	A	15	33385	33399	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
89	NC_002254	TGT	4	33919	33930	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	11467927
90	NC_002254	T	16	34082	34097	16	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
91	NC_002254	A	16	36079	36094	16	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
92	NC_002254	A	12	36479	36490	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
93	NC_002254	ATAA	3	36663	36674	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
94	NC_002254	ACAA	3	37628	37638	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	11467930
95	NC_002254	ATTT	3	37915	37927	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
96	NC_002254	AATA	3	38048	38060	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
97	NC_002254	AATT	3	38162	38172	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
98	NC_002254	TTTTG	3	38272	38285	14	0 %	80 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
99	NC_002254	TTTG	3	38850	38860	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
100	NC_002254	AAAT	3	39269	39279	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
101	NC_002254	AG	6	40353	40364	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
102	NC_002254	A	17	41469	41485	17	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
103	NC_002254	TTTA	3	41755	41766	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Scenedesmus obliquus mitochondrion