ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Mesostigma viride chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_002186	AAAT	3	68	79	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_002186	ATAA	3	125	135	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
3	NC_002186	TAT	4	452	463	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11466345
4	NC_002186	TTA	4	613	624	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	11466345
5	NC_002186	TCT	4	2658	2668	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	193735618
6	NC_002186	TGC	4	2701	2712	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	193735618
7	NC_002186	T	12	2846	2857	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
8	NC_002186	AAATA	3	3061	3075	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
9	NC_002186	AAAAT	3	3175	3188	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
10	NC_002186	ATTT	3	3287	3298	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
11	NC_002186	ATTT	3	3339	3351	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
12	NC_002186	TCT	4	3897	3907	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	11466347
13	NC_002186	ATT	4	4685	4696	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
14	NC_002186	AAT	4	4762	4773	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11466348
15	NC_002186	TAT	4	5164	5174	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11466348
16	NC_002186	ATT	4	5558	5569	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11466348
17	NC_002186	TTTG	3	6414	6426	13	0 %	75 %	25 %	0 %	7 %	11466348
18	NC_002186	T	13	6535	6547	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	11466348
19	NC_002186	AT	6	7594	7604	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
20	NC_002186	TAA	4	7716	7727	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
21	NC_002186	AATT	3	9869	9880	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
22	NC_002186	GGA	4	10955	10966	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	11466354
23	NC_002186	TCAA	3	11122	11132	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
24	NC_002186	ATT	4	11159	11169	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
25	NC_002186	TAA	4	11707	11719	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
26	NC_002186	ATA	4	13725	13736	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11466359
27	NC_002186	AGAA	3	13921	13932	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_002186	TTA	4	14700	14711	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11466361
29	NC_002186	AAT	4	14816	14826	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
30	NC_002186	ATTA	4	16581	16596	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	11466365
31	NC_002186	TCT	4	17125	17136	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	11466365
32	NC_002186	CTTTT	3	17852	17865	14	0 %	80 %	0 %	20 %	7 %	11466367
33	NC_002186	CAC	4	18144	18155	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	8 %	11466368
34	NC_002186	TCC	4	18676	18687	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	11466368
35	NC_002186	AT	6	19254	19264	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
36	NC_002186	TTAA	3	19454	19464	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
37	NC_002186	AAT	4	19622	19633	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
38	NC_002186	TTTC	3	19657	19668	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
39	NC_002186	TTTA	3	21122	21134	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
40	NC_002186	TAT	4	22940	22950	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
41	NC_002186	AAT	4	23047	23057	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
42	NC_002186	TAT	4	24132	24144	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	11466372
43	NC_002186	TATT	3	25426	25437	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
44	NC_002186	ATT	4	25945	25956	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
45	NC_002186	AAAT	3	26025	26035	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	11466374
46	NC_002186	CTG	4	26548	26559	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	11466374
47	NC_002186	TA	6	27345	27355	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
48	NC_002186	A	12	29045	29056	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
49	NC_002186	CTT	4	29224	29235	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	11466376
50	NC_002186	TCA	4	29424	29435	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	11466376
51	NC_002186	TAAT	3	30175	30187	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	11466378
52	NC_002186	CTA	4	30320	30331	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	11466378
53	NC_002186	AT	6	31286	31296	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
54	NC_002186	ATT	4	31340	31352	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	11466379
55	NC_002186	ATA	4	32067	32078	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
56	NC_002186	CAATT	4	32523	32542	20	40 %	40 %	0 %	20 %	10 %	11466380
57	NC_002186	ATC	4	32917	32928	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	11466380
58	NC_002186	ATT	4	36750	36760	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11466381
59	NC_002186	TCT	5	37085	37100	16	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	11466381
60	NC_002186	TCT	5	37290	37304	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	11466381
61	NC_002186	TTA	4	37401	37412	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11466381
62	NC_002186	ATC	4	40424	40435	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	11466382
63	NC_002186	TAA	4	40750	40760	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	11466382
64	NC_002186	GAATA	3	41234	41247	14	60 %	20 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
65	NC_002186	A	14	41332	41345	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
66	NC_002186	ATT	4	41393	41404	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
67	NC_002186	TAAA	3	41682	41693	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
68	NC_002186	TA	6	41763	41773	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
69	NC_002186	TTTA	3	41851	41861	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
70	NC_002186	AT	7	41869	41881	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
71	NC_002186	TAAA	3	42666	42676	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
72	NC_002186	TAT	4	44162	44172	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
73	NC_002186	TAA	5	44373	44387	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	11466387
74	NC_002186	CAAA	3	44945	44955	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
75	NC_002186	AAT	4	45479	45490	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11466388
76	NC_002186	ACT	4	46962	46972	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	11466389
77	NC_002186	TGG	4	47221	47232	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	11466389
78	NC_002186	TAA	4	48091	48102	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11466389
79	NC_002186	TAG	4	48343	48353	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	11466389
80	NC_002186	CAT	4	49924	49934	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	11466390
81	NC_002186	ACA	4	51369	51381	13	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
82	NC_002186	TTACAA	3	51530	51547	18	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	5 %	11466391
83	NC_002186	AAT	4	51823	51835	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
84	NC_002186	ATAA	3	51987	51998	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
85	NC_002186	TCTG	3	52475	52485	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	11466393
86	NC_002186	TAAT	4	53598	53613	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
87	NC_002186	TAA	4	53626	53636	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
88	NC_002186	TTAA	3	54431	54442	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	11466394
89	NC_002186	ATT	4	55026	55037	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
90	NC_002186	GTTT	3	55447	55457	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
91	NC_002186	TAT	4	55744	55755	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11466447
92	NC_002186	AAT	5	56280	56294	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
93	NC_002186	AATA	3	58319	58329	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
94	NC_002186	ATTT	3	58330	58341	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
95	NC_002186	TTTTTC	3	59121	59139	19	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	10 %	11466398
96	NC_002186	T	15	59520	59534	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
97	NC_002186	TAA	5	59604	59618	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
98	NC_002186	A	12	59670	59681	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
99	NC_002186	AAT	4	60028	60040	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	11466399
100	NC_002186	AAAT	3	62329	62340	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
101	NC_002186	ATAAA	5	62534	62558	25	80 %	20 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
102	NC_002186	AT	6	62820	62830	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
103	NC_002186	TAAA	3	62832	62843	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	11466401
104	NC_002186	TATAT	3	62999	63012	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	11466401
105	NC_002186	ATT	4	63446	63458	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	11466401
106	NC_002186	CTTT	3	63611	63622	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
107	NC_002186	AT	6	63687	63697	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
108	NC_002186	GAA	4	63892	63903	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	11466402
109	NC_002186	ATTA	3	63904	63915	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	11466402
110	NC_002186	TACATA	4	64067	64090	24	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	4 %	Non-Coding
111	NC_002186	ATAA	3	64138	64149	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	11466403
112	NC_002186	TTAA	3	64333	64344	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	11466404
113	NC_002186	TTTA	4	64612	64627	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	11466406
114	NC_002186	TATAAT	3	64974	64991	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
115	NC_002186	ACT	4	65060	65072	13	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
116	NC_002186	TAA	4	65358	65369	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
117	NC_002186	ATT	4	65369	65380	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
118	NC_002186	TAA	8	65569	65592	24	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
119	NC_002186	TAT	5	65587	65601	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
120	NC_002186	AATA	3	65643	65654	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
121	NC_002186	ATTT	3	65818	65829	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
122	NC_002186	AAAT	3	67366	67376	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	11466408
123	NC_002186	GAA	4	67551	67562	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	11466408
124	NC_002186	CATTT	3	69490	69503	14	20 %	60 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
125	NC_002186	AATT	4	69838	69853	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	11466409
126	NC_002186	TTA	4	70117	70127	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11466410
127	NC_002186	CGA	4	70227	70237	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	11466410
128	NC_002186	AT	6	70285	70295	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11466411
129	NC_002186	TTTA	3	70296	70307	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	11466411
130	NC_002186	TCTA	3	70560	70571	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
131	NC_002186	ATTA	4	70927	70942	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
132	NC_002186	ATT	4	70979	70990	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
133	NC_002186	TCAA	3	71232	71243	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
134	NC_002186	TAT	5	71338	71351	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
135	NC_002186	ATT	5	71397	71411	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
136	NC_002186	TA	6	71868	71878	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11466413
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140	NC_002186	TATT	3	72966	72978	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
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144	NC_002186	TCATT	4	75400	75419	20	20 %	60 %	0 %	20 %	5 %	Non-Coding
145	NC_002186	TGAAA	5	75436	75461	26	60 %	20 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
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151	NC_002186	TTGT	3	79408	79419	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
152	NC_002186	ATTT	3	79502	79512	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
153	NC_002186	ATA	4	79826	79836	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
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155	NC_002186	TTA	4	80628	80638	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
156	NC_002186	TAA	4	82399	82411	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
157	NC_002186	TCCC	3	82633	82645	13	0 %	25 %	0 %	75 %	7 %	Non-Coding
158	NC_002186	TAT	4	83119	83129	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11466426
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166	NC_002186	AT	7	93039	93052	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
167	NC_002186	TCAA	3	93189	93200	12	50 %	25 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
168	NC_002186	AAAAT	3	93250	93264	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
169	NC_002186	TAC	4	93675	93686	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	11466429
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173	NC_002186	TCCA	3	95443	95453	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	11466430
174	NC_002186	AATTT	3	95595	95608	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
175	NC_002186	ATT	6	96842	96859	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
176	NC_002186	TTTA	3	97755	97766	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	11466432
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182	NC_002186	ATTC	3	101666	101677	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
183	NC_002186	TATG	3	102019	102034	16	25 %	50 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
184	NC_002186	ATA	4	102113	102124	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
185	NC_002186	ATATT	3	102576	102591	16	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
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187	NC_002186	TATAG	3	102900	102914	15	40 %	40 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
188	NC_002186	TA	6	102939	102949	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
189	NC_002186	ATTG	3	103805	103816	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	11466438
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204	NC_002186	TAA	4	109599	109609	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
205	NC_002186	AATA	3	109708	109719	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
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212	NC_002186	CTAC	3	114025	114036	12	25 %	25 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
213	NC_002186	ACCG	3	117773	117783	11	25 %	0 %	25 %	50 %	9 %	Non-Coding
214	NC_002186	TA	6	118205	118215	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Mesostigma viride chloroplast