ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Chrysodidymus synuroideus mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_002174	TTA	4	2117	2128	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_002174	TAA	4	2870	2880	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
3	NC_002174	TAA	4	3331	3341	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
4	NC_002174	TAA	4	5819	5830	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11466461
5	NC_002174	TAA	4	6803	6814	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11466463
6	NC_002174	TAT	4	7320	7331	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11466464
7	NC_002174	ATT	4	7364	7375	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11466464
8	NC_002174	ATT	4	7552	7562	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11466464
9	NC_002174	ATT	5	8117	8130	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	11466465
10	NC_002174	ATT	5	9567	9580	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	11466466
11	NC_002174	ATT	4	10161	10173	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	11466467
12	NC_002174	ATT	4	10937	10947	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11466467
13	NC_002174	AAC	4	11109	11120	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	11466467
14	NC_002174	AAT	4	11683	11694	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11466467
15	NC_002174	TAA	4	11751	11762	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11466467
16	NC_002174	ATA	5	13214	13228	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	11466468
17	NC_002174	TAA	4	15704	15714	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	11466469
18	NC_002174	ATT	4	15942	15953	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11466470
19	NC_002174	ATA	4	16118	16128	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	11466470
20	NC_002174	ATA	5	16789	16802	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	11466471
21	NC_002174	TTG	4	17248	17259	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	11466471
22	NC_002174	AAT	4	17691	17702	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11466471
23	NC_002174	ATA	4	17826	17837	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11466471
24	NC_002174	ATA	6	19760	19776	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	11466474
25	NC_002174	ATA	4	19899	19911	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	11466474
26	NC_002174	TTA	4	20141	20151	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11466474
27	NC_002174	ATA	5	20618	20632	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	11466474
28	NC_002174	TAA	5	20838	20852	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	11466474
29	NC_002174	GTA	4	22508	22519	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	11466477
30	NC_002174	TAT	4	23469	23480	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11466478
31	NC_002174	AAT	4	24483	24494	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
32	NC_002174	AAT	7	24954	24973	20	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10 %	11466481
33	NC_002174	ATT	4	25331	25342	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11466481
34	NC_002174	ATT	5	25725	25738	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	11466482
35	NC_002174	ATT	4	25842	25852	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11466482
36	NC_002174	ATA	4	25932	25942	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	11466482
37	NC_002174	TAT	4	26827	26838	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11466484
38	NC_002174	AAT	4	28560	28572	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
39	NC_002174	TAT	4	29768	29779	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11466487
40	NC_002174	ATT	4	30102	30112	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
41	NC_002174	TAT	4	30183	30194	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11466488
42	NC_002174	TAT	4	32965	32976	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11466493
43	NC_002174	ATA	4	33509	33520	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11466494
44	NC_002174	ATT	4	34023	34034	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11466494

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Chrysodidymus synuroideus mitochondrion