ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Rhipicephalus sanguineus mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_002074	TTCA	3	234	244	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	5835695
2	NC_002074	TATT	3	262	272	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	5835695
3	NC_002074	ATT	4	443	455	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	5835695
4	NC_002074	TAT	4	659	670	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	5835695
5	NC_002074	TAAA	3	674	685	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	5835695
6	NC_002074	ATT	4	1467	1478	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	5835696
7	NC_002074	AGG	4	1812	1823	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	5835696
8	NC_002074	ATT	4	2548	2559	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	5835696
9	NC_002074	AAT	4	2770	2781	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	5835697
10	NC_002074	AATT	3	2899	2911	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	5835697
11	NC_002074	TTAA	3	3699	3710	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	5835699
12	NC_002074	TCT	4	3755	3765	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	5835699
13	NC_002074	AAAT	3	3837	3847	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	5835699
14	NC_002074	ATTTT	3	4564	4577	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	5835700
15	NC_002074	ATT	4	5061	5072	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	5835700
16	NC_002074	ATTT	3	5092	5102	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	5835700
17	NC_002074	ATTT	3	5161	5171	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	5835701
18	NC_002074	TC	6	5288	5299	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	5835701
19	NC_002074	TAA	4	5390	5402	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	5835701
20	NC_002074	TTAA	3	5666	5677	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
21	NC_002074	TAT	4	5911	5922	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	5835702
22	NC_002074	AAAT	3	6473	6483	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	5835702
23	NC_002074	ATT	5	6491	6505	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	5835702
24	NC_002074	AAATTT	3	7471	7489	19	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
25	NC_002074	TAA	4	7551	7563	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
26	NC_002074	TAAATT	3	7636	7653	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
27	NC_002074	ATTTT	3	7852	7865	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
28	NC_002074	ATTC	3	8220	8232	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
29	NC_002074	AATT	3	8930	8941	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
30	NC_002074	ATT	4	9275	9286	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	5835703
31	NC_002074	TTA	4	9720	9730	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	5835703
32	NC_002074	TAT	4	10227	10238	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	5835703
33	NC_002074	AAT	4	10384	10396	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	5835703
34	NC_002074	ATAA	3	10546	10556	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	5835703
35	NC_002074	TAA	4	10627	10638	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	5835703
36	NC_002074	ATT	4	11082	11092	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	5835704
37	NC_002074	TA	7	11131	11144	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	5835704
38	NC_002074	ATT	5	11166	11180	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	5835704
39	NC_002074	ATT	6	11412	11429	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	5835704
40	NC_002074	AAAAT	3	11971	11984	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	5835704
41	NC_002074	AAAT	4	12010	12024	15	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	5835704
42	NC_002074	TAA	4	12032	12044	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	5835704
43	NC_002074	ATT	4	12065	12076	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	5835704
44	NC_002074	A	13	12149	12161	13	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	5835704
45	NC_002074	TAA	4	12200	12211	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	5835704
46	NC_002074	ATTTA	3	12303	12317	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	5835705
47	NC_002074	TTA	4	12351	12362	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	5835705
48	NC_002074	TAA	4	12454	12465	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	5835705
49	NC_002074	AAT	4	12837	12848	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	5835706
50	NC_002074	ATTTT	3	13376	13389	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	5835707
51	NC_002074	ATT	5	14003	14016	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	5835707
52	NC_002074	ATTT	3	14353	14364	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
53	NC_002074	AATT	3	14523	14534	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Rhipicephalus sanguineus mitochondrion