ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Alligator mississippiensis mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_001922	AAC	4	2145	2155	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
2	NC_001922	AAAAC	3	2206	2220	15	80 %	0 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
3	NC_001922	GTTC	3	2428	2439	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
4	NC_001922	AATT	3	2593	2603	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
5	NC_001922	TCCC	3	2978	2988	11	0 %	25 %	0 %	75 %	9 %	5835541
6	NC_001922	AAT	4	3262	3272	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	5835541
7	NC_001922	CAC	4	3430	3440	11	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	9 %	5835541
8	NC_001922	GATA	3	3708	3720	13	50 %	25 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
9	NC_001922	CAC	4	4602	4613	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	8 %	5835542
10	NC_001922	ACT	4	5643	5653	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	5835543
11	NC_001922	CTT	4	6342	6353	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	5835543
12	NC_001922	AAG	4	7196	7207	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	5835544
13	NC_001922	ACA	4	8067	8079	13	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	7 %	5835546
14	NC_001922	CT	6	8175	8185	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	5835546
15	NC_001922	CTA	4	8744	8755	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	5835547
16	NC_001922	AC	6	8830	8840	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	5835547
17	NC_001922	TACAA	3	9418	9431	14	60 %	20 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
18	NC_001922	CAT	4	9753	9764	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	5835548
19	NC_001922	AACC	3	11129	11140	12	50 %	0 %	0 %	50 %	8 %	5835550
20	NC_001922	AC	6	11533	11543	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	5835550
21	NC_001922	TAA	4	12206	12217	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	5835551
22	NC_001922	CAT	4	12273	12283	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	5835551
23	NC_001922	TAG	4	12581	12592	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	5835551
24	NC_001922	TAT	5	13608	13622	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	5835551
25	NC_001922	CAAA	3	14132	14142	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	5835552
26	NC_001922	ATT	4	14160	14171	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	5835552
27	NC_001922	CAA	4	15164	15174	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	5835553
28	NC_001922	TCA	4	15311	15322	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	5835553
29	NC_001922	TCCC	3	15391	15402	12	0 %	25 %	0 %	75 %	8 %	5835553
30	NC_001922	C	16	16168	16183	16	0 %	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Alligator mississippiensis mitochondrion