ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Nicotiana tabacum plastid

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_001879	TAT	4	173	183	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_001879	AAG	5	3017	3031	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	11465936
3	NC_001879	ATA	4	6432	6444	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
4	NC_001879	AAT	4	6447	6459	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
5	NC_001879	ATT	4	24287	24299	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	11465945
6	NC_001879	CAG	4	28941	28952	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
7	NC_001879	TAG	4	32505	32516	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
8	NC_001879	ATT	4	33048	33058	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
9	NC_001879	TTC	4	36786	36797	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13625479
10	NC_001879	TAA	4	43948	43959	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
11	NC_001879	TAG	4	45888	45898	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	11465956
12	NC_001879	GTA	4	46484	46494	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
13	NC_001879	ATA	4	47361	47372	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
14	NC_001879	TTA	5	53183	53198	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
15	NC_001879	TTA	4	53811	53822	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_001879	ATA	4	56781	56794	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	81238327
17	NC_001879	TTG	4	57554	57564	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
18	NC_001879	ATT	4	61350	61360	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
19	NC_001879	TCT	4	61577	61587	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
20	NC_001879	ATT	4	65511	65522	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
21	NC_001879	GTT	4	67486	67496	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	11465976
22	NC_001879	TCT	4	67758	67769	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
23	NC_001879	TCT	4	76337	76348	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	59430010
24	NC_001879	AGA	4	79381	79391	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	59430010
25	NC_001879	TTA	4	86395	86406	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	59430010
26	NC_001879	CTT	4	86795	86806	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	59430010
27	NC_001879	GAT	4	87262	87272	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	59430010
28	NC_001879	GAT	4	88636	88646	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	59430010
29	NC_001879	TGA	4	93411	93422	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	59430010
30	NC_001879	TTC	4	101236	101247	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	59430011
31	NC_001879	TAA	4	113221	113232	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	59430011
32	NC_001879	AAG	4	113446	113457	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	59430011
33	NC_001879	ATA	4	115398	115408	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	59430011
34	NC_001879	TAT	4	120944	120955	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	59430011
35	NC_001879	TTC	5	122071	122085	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	59430011
36	NC_001879	TTA	4	130539	130550	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	59430011
37	NC_001879	TAT	5	130591	130605	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	59430011
38	NC_001879	GAA	4	141383	141394	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	59430011
39	NC_001879	ATC	4	153984	153994	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
40	NC_001879	ATC	4	155358	155368	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	11466035
41	NC_001879	GAA	5	155823	155837	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	11466035

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Nicotiana tabacum plastid