ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Chlamydomonas eugametos mitochondrion

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_001872	AGTA	3	101	113	13	50 %	25 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
2	NC_001872	CGACT	5	556	578	23	20 %	20 %	20 %	40 %	8 %	Non-Coding
3	NC_001872	TAT	4	965	976	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11465920
4	NC_001872	CGACT	3	1746	1759	14	20 %	20 %	20 %	40 %	7 %	Non-Coding
5	NC_001872	TA	6	2276	2286	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
6	NC_001872	CGAC	3	2761	2773	13	25 %	0 %	25 %	50 %	7 %	11465909
7	NC_001872	GAAT	3	3225	3235	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
8	NC_001872	CGAC	3	3698	3710	13	25 %	0 %	25 %	50 %	7 %	11465910
9	NC_001872	TCG	4	3971	3981	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	11465910
10	NC_001872	TCTAG	3	4567	4581	15	20 %	40 %	20 %	20 %	6 %	Non-Coding
11	NC_001872	ATT	4	4685	4697	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
12	NC_001872	TTA	4	5352	5364	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	11465911
13	NC_001872	GTAT	3	5584	5594	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	11465911
14	NC_001872	GCGAC	3	6107	6121	15	20 %	0 %	40 %	40 %	0 %	11465911
15	NC_001872	TAAAAT	3	6229	6246	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	11465911
16	NC_001872	TTTA	3	6450	6461	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	11465912
17	NC_001872	AAT	5	6608	6622	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	11465912
18	NC_001872	TAT	4	6652	6663	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11465912
19	NC_001872	AGTA	3	6794	6804	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	11465912
20	NC_001872	TAT	4	6871	6882	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11465912
21	NC_001872	AATA	3	7247	7259	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	11465912
22	NC_001872	ATA	5	7576	7589	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	11465912
23	NC_001872	CGACT	5	7791	7813	23	20 %	20 %	20 %	40 %	8 %	Non-Coding
24	NC_001872	AAGA	3	7856	7866	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
25	NC_001872	TTTA	3	8279	8290	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	11465921
26	NC_001872	ATT	4	9992	10003	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11465921
27	NC_001872	TA	7	10472	10484	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
28	NC_001872	CGAC	3	10891	10903	13	25 %	0 %	25 %	50 %	7 %	Non-Coding
29	NC_001872	TA	13	11503	11528	26	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
30	NC_001872	G	16	11610	11625	16	0 %	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_001872	CGAC	3	12949	12961	13	25 %	0 %	25 %	50 %	7 %	Non-Coding
32	NC_001872	AGAT	3	13297	13308	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
33	NC_001872	CGAC	3	13386	13398	13	25 %	0 %	25 %	50 %	7 %	Non-Coding
34	NC_001872	TAT	4	14301	14314	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	11465913
35	NC_001872	TAAG	3	15262	15273	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	11465913
36	NC_001872	ATT	5	15548	15561	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	11465913
37	NC_001872	ATTT	3	15701	15712	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	11465913
38	NC_001872	CGACT	3	17404	17417	14	20 %	20 %	20 %	40 %	7 %	11465915
39	NC_001872	GTCGA	3	18699	18712	14	20 %	20 %	40 %	20 %	7 %	Non-Coding
40	NC_001872	AT	6	19155	19165	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11465918
41	NC_001872	TCG	4	20119	20129	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	11465918
42	NC_001872	TCG	4	20302	20312	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	11465918
43	NC_001872	TAT	4	21663	21674	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	11465918
44	NC_001872	TAA	4	22542	22553	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11465918
45	NC_001872	TAT	4	22566	22577	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11465918
46	NC_001872	TA	6	22725	22735	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11465918

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Chlamydomonas eugametos mitochondrion