ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Reclinomonas americana mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_001823	ATA	4	337	348	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_001823	GAAT	3	981	991	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
3	NC_001823	ACAG	3	993	1003	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
4	NC_001823	TGTT	3	3019	3029	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
5	NC_001823	ATT	4	3241	3252	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11466496
6	NC_001823	TTAT	4	3805	3820	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
7	NC_001823	ATT	7	3841	3860	20	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
8	NC_001823	TA	11	3908	3929	22	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
9	NC_001823	AATA	3	4318	4329	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
10	NC_001823	TAAT	3	5527	5538	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	11466498
11	NC_001823	ATA	4	5637	5647	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	11466498
12	NC_001823	TAAA	3	5692	5704	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	11466498
13	NC_001823	TAT	4	5778	5790	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	11466498
14	NC_001823	AT	7	5909	5921	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
15	NC_001823	ATTT	3	7591	7601	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	11466500
16	NC_001823	TTTA	3	8104	8114	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	11466500
17	NC_001823	TTTA	3	8168	8180	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	11466500
18	NC_001823	AAAATG	3	8778	8796	19	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	10 %	11466500
19	NC_001823	AATA	3	9005	9015	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	11466500
20	NC_001823	CTTT	3	9504	9516	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	11466500
21	NC_001823	A	13	9917	9929	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	11466500
22	NC_001823	CAAAA	3	10059	10073	15	80 %	0 %	0 %	20 %	6 %	11466500
23	NC_001823	ATT	4	10439	10450	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	11466500
24	NC_001823	AT	6	11532	11542	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11466501
25	NC_001823	AAAAT	3	11670	11683	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	11466501
26	NC_001823	A	13	11728	11740	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	11466501
27	NC_001823	ATTT	3	12259	12269	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	11466501
28	NC_001823	TTAA	3	12378	12390	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	11466501
29	NC_001823	TAT	4	12846	12859	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	11466501
30	NC_001823	TTA	4	12856	12868	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	11466501
31	NC_001823	T	15	15256	15270	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
32	NC_001823	ACAA	3	15661	15672	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	11466502
33	NC_001823	AATT	3	15801	15812	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	11466503
34	NC_001823	TACA	3	16937	16948	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	11466504
35	NC_001823	TTTTAA	3	17279	17295	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	11466504
36	NC_001823	TAT	4	17368	17378	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11466504
37	NC_001823	TAA	4	19025	19036	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	11466505
38	NC_001823	CAGAAG	3	19184	19201	18	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	5 %	11466505
39	NC_001823	ATA	4	19564	19576	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
40	NC_001823	AATT	3	22333	22343	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	11466508
41	NC_001823	AT	6	22463	22474	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
42	NC_001823	AAAT	3	22598	22610	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	11466509
43	NC_001823	AAAAT	3	22653	22666	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	11466509
44	NC_001823	AT	6	23073	23084	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	45282589
45	NC_001823	ATA	4	23489	23500	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	45282589
46	NC_001823	TGG	4	23589	23600	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	45282589
47	NC_001823	A	12	23710	23721	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	45282589
48	NC_001823	A	14	23839	23852	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	11466511
49	NC_001823	ATAAA	3	24005	24019	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	11466511
50	NC_001823	AACA	3	24468	24478	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	11466512
51	NC_001823	AT	7	25309	25322	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	11466513
52	NC_001823	AAAAAC	3	26869	26887	19	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	10 %	11466517
53	NC_001823	TAAA	3	27132	27143	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	11466518
54	NC_001823	ACAA	3	27298	27309	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	11466518
55	NC_001823	ATTT	3	27973	27983	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
56	NC_001823	ATT	4	28147	28158	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11466520
57	NC_001823	A	12	28266	28277	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	11466520
58	NC_001823	TTTA	3	28345	28356	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	11466520
59	NC_001823	AAAT	3	28477	28488	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	11466520
60	NC_001823	TTAAAT	3	28819	28836	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	11466520
61	NC_001823	TTTA	3	28888	28899	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	11466520
62	NC_001823	TA	7	28935	28947	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	11466520
63	NC_001823	ATTT	3	29012	29024	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	11466520
64	NC_001823	TTTTC	3	29116	29129	14	0 %	80 %	0 %	20 %	7 %	11466520
65	NC_001823	ATA	5	29700	29713	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	11466522
66	NC_001823	TA	6	30526	30537	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	11466523
67	NC_001823	TGT	4	30937	30947	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	11466524
68	NC_001823	ACA	4	30989	30999	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	11466524
69	NC_001823	ATAA	4	31484	31499	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
70	NC_001823	AAGT	3	31855	31865	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	11466525
71	NC_001823	TAA	4	31969	31979	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	11466525
72	NC_001823	TTTTA	3	32036	32050	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
73	NC_001823	AGAC	3	32236	32248	13	50 %	0 %	25 %	25 %	7 %	Non-Coding
74	NC_001823	TTA	4	32694	32705	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11466526
75	NC_001823	ATA	4	32776	32788	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	11466526
76	NC_001823	AGTT	3	32878	32889	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	11466526
77	NC_001823	GAAAT	3	33052	33065	14	60 %	20 %	20 %	0 %	7 %	11466526
78	NC_001823	AAAT	3	33627	33637	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
79	NC_001823	GCAGGT	3	33739	33756	18	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	5 %	11466528
80	NC_001823	AAAT	3	34346	34357	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	11466529
81	NC_001823	AATA	4	34443	34458	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	11466529
82	NC_001823	AAT	4	35886	35897	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
83	NC_001823	TTA	4	36176	36188	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	11466530
84	NC_001823	TTA	4	36561	36571	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11466530
85	NC_001823	ATT	4	36734	36744	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	11466530
86	NC_001823	TAT	4	38764	38774	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
87	NC_001823	ATTT	3	38811	38821	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	11466532
88	NC_001823	TAAA	3	39293	39305	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	11466532
89	NC_001823	AT	6	40162	40173	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	11466533
90	NC_001823	TTTC	3	40274	40285	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	11466533
91	NC_001823	ATTT	3	40698	40708	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	11466533
92	NC_001823	TCA	4	40856	40867	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	11466534
93	NC_001823	AAAT	3	42060	42070	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	11466536
94	NC_001823	TA	6	42330	42340	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
95	NC_001823	TA	6	42778	42788	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
96	NC_001823	TAAAA	3	42877	42892	16	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
97	NC_001823	ATAA	3	42893	42904	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
98	NC_001823	TAAAAA	3	42915	42932	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_001823	AAT	4	43604	43614	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	11466540
100	NC_001823	A	13	44159	44171	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	11466540
101	NC_001823	ATA	4	44202	44212	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	11466540
102	NC_001823	AACC	3	44577	44587	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	11466540
103	NC_001823	AAAT	3	45783	45793	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	11466541
104	NC_001823	AT	6	45845	45856	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	11466541
105	NC_001823	AAAAG	3	46150	46163	14	80 %	0 %	20 %	0 %	7 %	11466542
106	NC_001823	TAA	4	46166	46176	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	11466542
107	NC_001823	AATA	3	46264	46275	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	11466542
108	NC_001823	ATA	4	46377	46388	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11466542
109	NC_001823	TAA	4	46398	46408	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	11466542
110	NC_001823	ATA	4	46594	46605	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	11466542
111	NC_001823	TAA	4	46665	46675	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	11466542
112	NC_001823	ATA	4	46878	46889	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	11466543
113	NC_001823	ATT	4	47243	47254	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11466543
114	NC_001823	AAT	4	47252	47262	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	11466543
115	NC_001823	TTA	4	47290	47301	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11466543
116	NC_001823	AAT	4	47496	47506	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	11466544
117	NC_001823	A	12	47624	47635	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	11466544
118	NC_001823	AATATA	4	47832	47854	23	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	4 %	Non-Coding
119	NC_001823	TAT	4	48142	48152	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
120	NC_001823	A	12	48199	48210	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
121	NC_001823	T	14	48461	48474	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	11466545
122	NC_001823	T	18	48548	48565	18	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	11466545
123	NC_001823	CAG	4	48646	48657	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	11466545
124	NC_001823	TAG	4	48958	48968	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	11466545
125	NC_001823	T	14	49128	49141	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	11466545
126	NC_001823	TTTG	3	49145	49156	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	11466545
127	NC_001823	TAAG	3	49295	49306	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	11466545
128	NC_001823	ATT	4	49476	49487	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	11466545
129	NC_001823	AAT	4	49603	49613	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	11466545
130	NC_001823	ATTT	3	49621	49631	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	11466545
131	NC_001823	TAAA	3	49678	49688	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	11466545
132	NC_001823	T	14	49692	49705	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	11466545
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ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Reclinomonas americana mitochondrion